R/RyggVarTilrettelegg.R
In Rapporteket/rygg: Degenerativ Rygg, figurer, tabeller, analyser
Defines functions
RyggVarTilrettelegg
Documented in
RyggVarTilrettelegg
#' Funksjon for å tilrettelegge variable for beregning.
#'
#' Denne funksjonen gjør utvalg og tilrettelegger variable (gitt ved valgtVar) til videre bruk.
#' Videre bruk kan eksempelvis være beregning av AggVerdier eller gjennomsnitt.
#' Funksjonen gjør også filtreringer som å fjerne ugyldige verdier for den valgte variabelen, samt ta høyde for avhengigheter med
#' andre variable. Det er også her man angir aksetekster og titler for den valgte variabelen.
#' Her kan mye hentes til analysebok
#' Når ei fordeling består av flere variable, settes flerevar=1. Vi omdefinerer variablene slik at
#' alle gyldige registreringer (dvs. alle registreringer som skal telles med) er 0 eller 1.
#' De som har oppfylt spørsmålet
#' er 1, mens ugyldige registreringer er NA. Det betyr at hvis vi skal ta bort registreringer
#' som i kategorier av typen "Ukjent" kodes disse som NA, mens hvis de skal være med kodes de som 0.
#' Vi sender tilbake alle variable som indikatorvariable, dvs. med 0,1,NA
#'
#' @inheritParams RyggFigAndeler
#' @inheritParams RyggUtvalgEnh
#' @param figurtype Hvilken figurtype det skal tilrettelegges variable for:
#' 'andeler', 'andelGrVar', 'andelTid', 'gjsnGrVar', 'gjsnTid'
#'
#' @return Definisjon av valgt variabel.
#'
#' @export
#'
RyggVarTilrettelegg <- function(RegData=NULL, valgtVar, ktr=0, datoFra='2007-01-01',
datoTil=Sys.Date(), hovedkat=99, figurtype='andeler'){ #grVar='',
"%i%" <- intersect
#----------- Figurparametre ------------------------------
cexgr <- 1 #Kan endres for enkeltvariable
retn <- 'V' #Vertikal som standard. 'H' angis evt. for enkeltvariable
flerevar <- 0
grtxt <- '' #Spesifiseres for hver enkelt variabel
grtxt2 <- '' #Spesifiseres evt. for hver enkelt variabel
varTxt <- ''
xAkseTxt <- '' #Benevning
subtxt <- ''
antDes <- 1
if (figurtype == 'andelGrVar') {xAkseTxt <- 'Andel operasjoner (%)'}
sortAvtagende <- TRUE #Sortering av resultater
KImaalGrenser <- NA
tittel <- 'Variabelvalg (valgtVar) feil angitt' # ? I AndelerGrVar og GjsnGrVar genereres tittel i beregningsfunksjonen
variable <- 'Ingen'
#deltittel <- ''
if (!is.null(RegData)) {RegData$Variabel <- 0}
#Kan her definere opp alle aktuelle grupperingsvariable og deres tekst, eller
#sende inn grupperingsvariabel og så gjøre beregninger. (Ulempe: Ekstra avhengigheter)
#Sentralt spm: Hvor skal det avgjøres hvilken figurtype som vises??? her
KIekstrem <- NULL
#----Filtrere på at oppfølgigsskjema finnes
#ktr kan ha verdiene 0, 1 eller 2
valgtVarTest <- valgtVar
if (length(grep('3mnd', valgtVar)) == 1) {
ktr <- 1
valgtVarTest <- sub('3mnd', '', valgtVar)
}
if (length(grep('12mnd', valgtVar) == 1)) {
ktr <- 2
valgtVarTest <- sub('12mnd', '', valgtVar)
}
varPrePost <- c('fornoydhet', 'nytte', 'EQ5DEndr','EQ5DEndr',
'OswEndr', 'SmBeinEndr', 'SmRyggEndr',
'OswEndrPre', 'SmBeinEndrPre', 'SmRyggEndrPre')
if ((valgtVarTest %in% varPrePost) & (ktr==0)) {ktr <- 1}
ktrtxt <- c(' før operasjon', ' (3 mnd etter)', ' (12 mnd. etter)')[ktr+1]
trekkfraDager <- c(0,100,380)[ktr+1]
#-------------------------------------
if (valgtVar=='deknRygg17') { #andelerGrVar
tittel <- 'Dekningsgrad, NKR Degenerativ Rygg, 2017'
xAkseTxt <- 'dekningsgrad, NKR'
KImaal <- 0.8
data('deknRygg17', package = 'nkr') #paste0(valgtVar,'.Rdata')
RegData <- deknRygg17 #paste0(valgtVar)
}
if (valgtVar=='deknNakke17') { #andelerGrVar
tittel <- 'Dekningsgrad, NKR Degenerativ Nakke, 2017'
xAkseTxt <- 'dekningsgrad, NKR'
KImaal <- 0.8
data(deknNakke17, package = 'nkr')
RegData <- deknNakke17 #paste0(valgtVar)
}
if (valgtVar=='deknRygg19') { #andelerGrVar
tittel <- 'Dekningsgrad, NKR Degenerativ Rygg, 2019'
xAkseTxt <- 'dekningsgrad, NKR'
KImaal <- 0.8
data('deknRygg19', package = 'rygg') #paste0(valgtVar,'.Rdata')
RegData <- deknRygg19 #paste0(valgtVar)
}
if (valgtVar=='deknNakke19') { #andelerGrVar
tittel <- 'Dekningsgrad, NKR Degenerativ Nakke, 2019'
xAkseTxt <- 'dekningsgrad, NKR'
KImaal <- 0.8
data(deknNakke19, package = 'nakke')
RegData <- deknNakke19 #paste0(valgtVar)
}
if (valgtVar=='alder') { #Fordeling, GjsnGrVar, GjsnTid
RegData <- RegData[which(RegData$Alder>=0), ] #Tar bort alder<0
RegData$Variabel <- RegData$Alder #GjsnTid, GjsnGrVar
xAkseTxt <- 'alder (år)'
tittel <- 'Alder ved innleggelse' #c('XX', 'test av tittel over to linjer') - funker!
subtxt <- 'Aldersgrupper (år)'
if (figurtype %in% c('gjsnGrVar', 'gjsnTid')) {
tittel <- 'alder ved innleggelse'}
if (figurtype == 'andeler') { #Fordelingsfigur
gr <- c(0,seq(20,90,10),150)
#gr <- c(seq(0, 100, 10),150)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$Alder, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- c('0-19', '20-29', '30-39', '40-49', '50-59', '60-69', '70-79', '80-89', '90+') #c(levels(RegData$VariabelGr)[-length(gr)], '90+') #c(names(AndelLand)[-length(gr)], '90+')
#grtxt <- c('0-9','10-19','20-29','30-39','40-49','50-59','60-69','70-79','80-89','90-99','100+')
xAkseTxt <- 'Aldersgrupper (år)'}
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar=='alder70') { #AndelTid, AndelerGrVar
RegData <- RegData[which(RegData$Alder>=0), ] #Tar bort alder<0
RegData$Variabel[which(RegData$Alder>=70)] <- 1
varTxt <- 'over 70 år'
tittel <- 'Pasienter over 70 år'
}
if (valgtVar == 'antibiotika') { #fordeling, AndelGrVar, AndelTid
grtxt <- c('Nei', 'Ja', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$AntibiotikaV3, levels = c(0,1,9))
tittel <- 'Er det gitt antibiotikaprofylakse?'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$AntibiotikaV3 %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$AntibiotikaV3
tittel <- 'Fått antibiotika'
varTxt <- 'som har fått antibiotika'
}
}
if (valgtVar=='antibiotikaMedikament'){ #fordeling
tittel <- 'Antibiotikatyper'
grtxt <- c("Cefalotin","Cefuroxim","Cefalexin","(Di)Kloksacillin","Klindamycin",
"Penicillin","Erytromycin","Ampicillin","Tetracyclin","Trimetoprim+Sulfonamid",
"Vancomycin","Fusidinsyre","Ciprofloxacin","Cefazolin","Annet")
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$AntibiotikaMedikament, levels = c(1:14,20))
retn <- 'H'
}
if (valgtVar %in% c('arbstatus', 'arbstatus3mnd', 'arbstatus12mnd')) { #Fordeling, AndelGrVar, AndelTid
# Andel i kategori 6 tom 9, mottar sykepenger Av 1-9, (ikke bare de som sykemeldt fra før)
# Gml: grtxt <- c('I arbeid','Hjemmeværende', 'Studie/skole', 'Pensjonist', 'Arbeidsledig', 'Sykemeldt',
# 'Aktiv sykemeldt', 'Delvis sykemeldt', 'Attføring/rehab.', 'Uføretrygdet', 'Ukjent')
datoTil <- min(datoTil, Sys.Date()-trekkfraDager)
RegData$Arbstatus <- switch(as.character(ktr),
'0' = RegData$ArbstatusPreV3,
'1'= RegData$Arbstatus3mndV3,
'2'= RegData$Arbstatus12mndV3)
ind <- switch(as.character(ktr),
'0' = 1:dim(RegData)[1],
'1' = which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1),
'2' = which(RegData$Ferdigstilt1b12mnd == 1))
RegData <- RegData[ind, ]
retn <- 'H'
grtxt <- c("Fulltidsjobb","Deltidsjobb","Student/skoleelev",
"Alderspensjonist", "Arbeidsledig","Sykemeldt","Delvis sykemeldt",
"Arbeidsavklaringspenger", "Uførepensjonert","Ikke utfylt")
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$Arbstatus, levels = c(1:9,99))
tittel <- paste0('Arbeidsstatus, ', ktrtxt)
if (figurtype %in% c('andelTid', 'andelGrVar')) {
RegData <- RegData[which(RegData$Arbstatus %in% 1:9), ]
RegData$Variabel[which(RegData$Arbstatus %in% 6:9)] <- 1
tittel <- paste0('Mottar sykepenger' ,ktrtxt)
varTxt <- 'som mottar sykepenger'}
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar == 'ASA') { #fordeling, AndelGrVar
grtxt <- c('I:Ingen','II:Moderat', 'III:Alvorlig', 'IV:Livstruende', 'Ikke utfylt')
subtxt <- 'Sykdomsgrad'
RegData <- RegData[which(RegData$ASA %in% c(1:4,9)), ] #Antar ikke opererer døde...
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$ASA, levels = c(1:4,9))
tittel <- 'ASA-grad (komorbiditet)'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$ASA %in% 1:4), ]
RegData$Variabel[which(RegData$ASA > 2)] <- 1
tittel <- 'ASA-grad > II'
}
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar == 'BMI') { #Fordeling, AndelGrVar
#BMI > 30
RegData <- RegData[which(RegData$BMI >10), ]
gr <- c(0, 18.5, 25, 30, 35, 40, 1000)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$BMI, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
tittel <- 'Pasientenes BMI (Body Mass Index)'
grtxt <- c('<18,5', levels(RegData$VariabelGr)[2:(length(gr)-2)],'40+')
grtxt2 <- c('Undervekt', 'Normalvekt', 'Overvekt', 'Fedme', 'Fedme kl II', 'Fedme kl III')
xAkseTxt <- '"Body Mass Index"'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData$Variabel[which(RegData$BMI > 30)] <- 1
tittel <- 'Pasienter med fedme: (BMI>30)'
varTxt <- 'BMI>30'
sortAvtagende <- FALSE
}}
if (valgtVar == 'degSponFusj') { #AndelGrVar, AndelTid
#hovedkat=10 #Degen. spondylolistese
RegData <- RyggUtvalgEnh(RegData, hovedkat=10)$RegData
RegData$Variabel[which(RegData$HovedInngrep ==5)] <- 1
varTxt <- 'tilfeller'
tittel <- 'Degen. spondylolistese operert med fusjonskirurgi'
sortAvtagende <- F
xAkseTxt <- 'Andel med fusjonskirurgi (%)'
}
if (valgtVar == 'degSponFusj1op') { #AndelGrVar, AndelTid
# Kl 5. Andel pasienter med degenerativ spondylolistese som blir operert med
# fusjonskirurgi ved første operasjon
# Mål: ≤ landsgjennomsnittet høy måloppnåelse (grønt), > landsgjennomsnittet moderat/lav (gult)
# Hensikt: Redusere andel pasienter med degenerativ spondylolistese som blir operert
# med fusjonskirurgi ved første operasjon
#hovedkat=10 #Degen. spondylolistese
#RegData <- finnReoperasjoner(RegData = RegData)
RegData <- RyggUtvalgEnh(RegData, hovedkat=10)$RegData
RegData <- RegData[which(RegData$TidlOpr == 4), ]
RegData$Variabel[which(RegData$HovedInngrep ==5)] <- 1 # & RegData$TidlOpr == 4
varTxt <- 'tilfeller'
tittel <- 'Degen. spondylolistese, fusjonskirurgi ved første operasjon'
sortAvtagende <- F
xAkseTxt <- 'Andel med fusjonskirurgi i første operasjon (%)'
KImaalGrenser <- 'landsgj' #c(0,landsgj,100)
}
if (valgtVar == 'degSponSSSten') { #AndelGrVar
#(Først og fremst fusjonskirurgi)
RegData$Variabel[which((RegData$RfSentr==1) & (RegData$RfSpondtypeDegen == 1))] <- 1
tittel <- 'Degenerativ spondylolistese og sentral spinal stenose'
varTxt <- 'som har dette'
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar == 'EQ5DPre') {#ford gjsnPre (gjsnBox)
RegData <- RegData[which(RegData$EQ5DV3Pre > -0.6),]
gr <- c(-0.6, seq(-0.2, 0.9, 0.1), 1)
#gr <- c(0,seq(20,90,10),150)
RegData$VariabelGr <- cut(round(RegData$EQ5DV3Pre,3), breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
#grtxt <- c('0-19', '20-29', '30-39', '40-49', '50-59', '60-69', '70-79', '80-89', '90+')
grtxt <- levels(RegData$VariabelGr)
#grtxt <- c(levels(RegData$VariabelGr)[-length(gr)], '90+')
tittel <- 'EQ5D før operasjon'
if (figurtype %in% c('gjsnBox', 'gjsnGrVar')){
tittel <- 'EQ5D før operasjonen'}
RegData$Variabel <- RegData$EQ5DV3Pre
KIekstrem <- c(-0.6, 1)
}
if (valgtVar %in% c('EQ5DEndr', 'EQ5DEndr3mnd', 'EQ5DEndr12mnd')) {#gjsnPre (gjsnBox)
tittel <- paste0('forbedring av EQ5D', ktrtxt)
RegData$Variabel <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$EQ5DV33mnd - RegData$EQ5DV3Pre),
'2'= (RegData$EQ5D12V3mnd - RegData$EQ5DV3Pre))
RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
Xlab <- 'EQ5D før operasjon'
gr <- c(round(seq(-0.6,0.8,0.2),1),1.6) #round(seq(-0.6,1.6,0.3),1)}
RegData$Gr <- cut(RegData$EQ5DV3Pre, gr, right=F)
GrNavn <- levels(RegData$Gr)
AntGr <- length(GrNavn)
GrNavn[AntGr] <- '0.8+'
KIekstrem <- c(-1.6, 1.6)
}
if (valgtVar == 'EQangstPre') {#fordeling
tittel <- 'Problemer med angst/depresjon'
grtxt <- c('Ingen', 'Litt','Middels', 'Svært','Ekstremt', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$EqangstV3Pre, levels = c(1:5,9))
subtxt <- 'Grad av engstelighet/deprimerthet' #Tilstand i forhold til angst'
}
if (valgtVar == 'EQgangePre') { #fordeling
tittel <- 'Problemer med gangfunksjon før operasjon'
grtxt <- c('Ingen', 'Litt','Middels', 'Store', 'Ute av stand til å gå', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$EqgangeV3Pre, levels = c(1:5,9))
subtxt <- 'problemer med gange'
}
if (valgtVar == 'erstatningPre') { #fordeling, AndelGrVar, #AndelTid
#Pasientskjema. Andel med ErstatningPre
#V2: Kode 1:4,9: 'Ja', 'Nei', 'Planlegger', 'Innvilget', 'Ukjent'
#V3: [0,1,2,3,9] ["Nei","Ja","Planlegger","Innvilget","Ikke utfylt"]
grtxt <- c('Nei', 'Ja', 'Planlegger', 'Innvilget', 'Ikke utfylt')
#RegData$VariabelGr <- 9
#indDum <- which(RegData$ErstatningPre %in% 1:4)
#RegData$VariabelGr[indDum] <- RegData$ErstatningPre[indDum]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$ErstatningPre, levels = c(0:3,9))
tittel <- 'Har pasienten søkt erstatning?'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$ErstatningPre %in% 0:3), ]
RegData$Variabel[which(RegData$ErstatningPre %in% c(1,2))] <- 1
tittel <- 'Pasienten har søkt/planlegger å søke erstatning'
varTxt <- 'som har søkt erstatning'
sortAvtagende <- FALSE}
}
if (valgtVar %in% c('fornoydhet', 'fornoydhet3mnd', 'fornoydhet12mnd')) { #fordeling, AndelGrVar
#3/12mndSkjema. Andel med helt Fornøyd (1)
#Kode 1:5,9: 'Fornøyd', 'Litt fornøyd', 'Verken eller', 'Litt misfornøyd', 'Misfornøyd', 'Ukjent')
tittel <- paste('Fornøydhet', ktrtxt)
datoTil <- min(datoTil, as.Date(Sys.Date()-trekkfraDager))
RegData$Fornoyd <- switch(as.character(ktr),
'1'= RegData$Fornoyd3mnd,
'2'= RegData$Fornoyd12mnd)
grtxt <- c('Fornøyd', 'Litt fornøyd', 'Verken eller', 'Litt misfornøyd', 'Misfornøyd', 'Ukjent')
RegData$VariabelGr <- 9
indDum <- which(RegData$Fornoyd %in% 1:5)
RegData$VariabelGr[indDum] <- RegData$Fornoyd[indDum]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$VariabelGr, levels = c(1:5,9))
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$Fornoyd %in% 1:5), ]
RegData$Variabel[which(RegData$Fornoyd %in% 1:2)] <- 1 #
tittel <- paste0('Fornøyde pasienter', ktrtxt)
}
}
if (valgtVar=='hovedInngrep'){ #fordeling
tittel <- 'Hovedinngrep'
# grtxt <- c('Udefinerbart', 'Prolapskirurgi', 'Foramenotomi', 'Laminektomi',
# 'Interspin. implantat', 'Fusjonskirurgi', 'Skiveprotese', 'Rev. av implantat')
grtxt <- c('Udefinerbart', 'Prolapskirurgi', 'Dekompresjon', 'Laminektomi', 'Eksp. intersp impl.',
'Fusjonskirurgi', 'Deformitet', 'Rev. av implantat', 'Skiveprotese')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$HovedInngrep, levels = 0:8)
retn <- 'H'
}
if (valgtVar=='inngrep'){ #fordeling
tittel <- 'Inngrepstyper'
grtxt <- c('Andre inngrep', 'Prolaps mikro', 'Prolaps åpen', 'Midtlinjebev. dekomp.',
'Laminektomi', 'Eksp. intersp impl.', 'PLF', 'PLIF', 'TLIF', 'ALIF', 'XLIF',
'Udefinert fusjon', 'Osteotomi/deform.', 'Revisjon', 'Skiveprotese')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$InngrepV2V3, levels = 0:14)
retn <- 'H'
}
if (valgtVar=='komorbiditet') {
tittel <- 'Komorbiditet'
retn <- 'H'
flerevar <- 1
RegData <- RegData[which(RegData$OpDato >= '2019-01-01'), ]
# variableV2 <- c('SykdAndreRelevanteSykdBechtrew', 'SykdAnnenendokrin', 'SykdAnnenreumatisk',
# 'SykdCerebrovaskular', 'SykdDepresjonAngst', 'SykdHjertekar', 'SykdHoftekneartose',
# 'SykdHypertensjon', 'SykdKreft', 'SykdKroniskLunge', 'SykdKroniskNevrologisk',
# 'SykdKroniskSmerterMuskelSkjelettsyst', 'SykdOsteoporose', 'SykDprebetesMellitus',
# 'SykdReumatoidartritt', 'SykdVaskularClaudicatio', 'Sykd')
variable <- c('SykdAndreRelevanteSykdBechtrew', 'SykdAnnenendokrin', 'SykdAnnenreumatisk',
'SykdCerebrovaskular', 'SykdDepresjonAngst', 'SykdHjertekar', 'SykdHoftekneartose',
'SykdHypertensjon', 'SykdKreft', 'SykdKroniskLunge', 'SykdKroniskNevrologisk',
'SykdOsteoporose', 'SykdOsteoporoseBrudd', 'SykDprebetesMellitus', #'SykdKroniskSmerterMuskelSkjelettsyst',
'SykdPolynevropati', 'SykdProstatisme',
'SykdReumatoidartritt', 'SykdVaskularClaudicatio', 'SykdGeneralisertSmSyndr',
'Sykd')
grtxt <- c('Bechterew', 'Endokrin', 'Reumatisk',
'Cerebrovaskulær', 'Depresjon/Angst', 'Hjerte-kar', 'Hoftekneartose',
'Hypertensjon', 'Kreft', 'Lungesykd.', 'Nevrologisk sykd.',
'Osteoporose', 'Osteoporosebrudd', 'Diabetes Mell.', #'Muskel-/skjelettsm.',
'Polynevropati', 'Prostatisme',
'Reumatoid artritt', 'Vask. Claudicatio', 'Gen.smertesyndrom',
'Tot. Komorb.')
cexgr <- 0.9 #Kan endres for enkeltvariable
}
if (valgtVar=='komplPer') { #fordeling
tittel <- 'Peroperative komplikasjoner'
retn <- 'H'
flerevar <- 1
#NB <- '(Komplikasjoner rapporteres kun f.o.m. 2010)'
variable <- c('PeropKompDura', 'PeropKompFeilnivSide', 'PeropKompNerve', 'PeropKompTransfuBlodning',
'PeropKompKardio','PeropKompFeilplassImp','PeropKompResp','PeropKompAnafy')
grtxt <- c('Durarift', 'Operert feil nivå/side', 'Nerveskade', 'Transfusjonskrevende blødning',
'Kardiovaskulær komplikasjon', 'Feilplassert implantat', 'Respiratorisk komplikasjon', 'Anafylaksi')
}
if (valgtVar=='komplPost') {
tittel <- 'Pasientrapporterte komplikasjoner'
datoFra <- max(datoFra, '2020-01-01')
datoTil <- min(datoTil, as.character(Sys.Date()-90))
retn <- 'H'
flerevar <- 1
variable <- c('KpInfOverfla3mnd','KpInfDyp3mnd', 'KpUVI3mnd', #'KpMiktProb3mnd',
'KpLungebet3mnd', 'KpBlod3mnd','KpDVT3mnd','KpLE3mnd', 'Kp3mnd')
grtxt <- c('Overfl. sårinf. (mangelfull reg. 2019)', 'Dyp sårinfeksjon',
'Urinveisinfeksjon', 'Pneumoni', #'Problem, vannlatning/avføring',
'Transf./opr. pga. blødning', 'DVT','Lungeemboli', 'Postop. kompl. totalt') #'Tot. komplikasjoner'
#Andel kun av de som har svart på 3 mnd ktr:
RegData <- RegData[which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1), ]
indNA <- which(rowSums(is.na(RegData[ ,variable])) == length(variable))
if (length(indNA)>0){ #Fjerner rader hvor alle Kp-variabler er NA
RegData <- RegData[-indNA, ] }
}
if (valgtVar == 'kp3mnd') { #AndelGrVar
#Komplikasjoner 0:nei, 1:ja
#ind <- which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1)
#RegData <- RegData[ind, ]
variable <- c('KpInfOverfla3mnd','KpInfDyp3mnd', 'KpUVI3mnd', #'KpMiktProb3mnd',
'KpLungebet3mnd', 'KpBlod3mnd','KpDVT3mnd','KpLE3mnd')
indNA <- which(rowSums(is.na(RegData[ ,variable])) == length(variable))
if (length(indNA)>0){ #Fjerner rader hvor alle Kp-variabler er NA
RegData <- RegData[-indNA, ] }
RegData$Variabel[rowSums(RegData[ ,variable], na.rm = T) > 0] <- 1
VarTxt <- 'tilfeller'
tittel <- 'Pasientrapporterte komplikasjoner (%)'
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar == 'kpInf3mnd') { #AndelGrVar, AndelTid
#Komplikasjoner 0:nei, 1:ja
#Antar at de som ikke har fylt ut ikke har hatt infeksjon
RegData <- RegData[which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1), ]
RegData$Variabel[rowSums(RegData[ ,c('KpInfOverfla3mnd', 'KpInfDyp3mnd')], na.rm = T) > 0] <- 1
indIkkeSaarInf <- which(RegData$OpDato >= '2019-01-01' & RegData$OpDato <= '2021-12-31')
RegData$Variabel[indIkkeSaarInf] <- NA
VarTxt <- 'tilfeller'
tittel <- paste0('Sårinfeksjon, pasientrapportert', ktrtxt)
sortAvtagende <- FALSE
xAkseTxt <- 'Andel sårinfeksjoner (%)'
# if (hovedkat == 1) {KImaalGrenser <- c(0,2,100)}
# if (hovedkat == 5) {KImaalGrenser <- c(0,3,100)}
# if (hovedkat == 9) {KImaalGrenser <- c(0,3,100)}
}
if (valgtVar == 'kpInfOverfl') { #AndelGrVar, AndelTid
#Lena: Tilpass ktr
#Komplikasjoner 0:nei, 1:ja
ind <- switch(as.character(ktr),
'1' = which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1),
'2' = which(RegData$Ferdigstilt1b12mnd == 1))
RegData <- RegData[ind, ]
RegData$Variabel[RegData$KpInfOverfla3mnd==1] <- 1
indIkkeSaarInf <- which(RegData$OpDato >= '2019-01-01' & RegData$OpDato <= '2021-12-31')
RegData$Variabel[indIkkeSaarInf] <- NA
VarTxt <- 'tilfeller'
tittel <- paste0('Overfladisk sårinfeksjon, pasientrapportert', ktrtxt)
sortAvtagende <- FALSE
xAkseTxt <- 'Andel sårinfeksjoner (%)'
#KImaalRetn <- 'lav'
if (hovedkat == 1) {KImaalGrenser <- c(0,2,100)}
if (hovedkat == 5) {KImaalGrenser <- c(0,3,100)}
if (hovedkat == 9) {KImaalGrenser <- c(0,3,100)}
}
if (valgtVar=='liggedogn') {#fordeling, gjsnGrVar, andeler, gjsnTid
#liggedogn
#For opphold registrert som dagkirurgi uten at liggedogn er reg., settes liggedogn=0
tittel <- 'Total liggetid ved operasjon'
dagind <- which( (is.na(RegData$Liggedogn) | is.nan(RegData$Liggedogn)) & RegData$Dagkirurgi==1)
RegData$Liggedogn[dagind]<-0
RegData <- RegData[which(RegData$Liggedogn>=0),]
RegData$Variabel <- RegData$Liggedogn #gjsnGrVar
gr <- c(0:7,100)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$Liggedogn, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- c(0:6, '7+')
xAkseTxt <- 'Antall liggedøgn' #(subtxt
subtxt <- 'døgn'
if (figurtype=='gjsnGrVar') {tittel <- 'total liggetid'}
sortAvtagende <- 'F'
TittelVar <- 'Total liggetid ved operasjon'
ytxt1 <- 'liggetid'
KIekstrem <- c(0, 20)
}
if (valgtVar=='liggetidPostOp') {#fordeling, gjsnGrVar, gjsnTid
#liggedogn
#For opphold registrert som dagkirurgi uten at liggedogn er reg., settes liggedogn=0
tittel <- 'Liggetid etter operasjon'
RegData <- RegData[which(RegData$OpDato >= '2019-01-01'), ]
dagind <- which( (is.na(RegData$LiggetidPostOp) | is.nan(RegData$LiggetidPostOp)) & RegData$Dagkirurgi==1)
RegData$LiggetidPostOp[dagind]<-0
RegData <- RegData[which(RegData$LiggetidPostOp>=0),]
RegData$Variabel <- RegData$LiggetidPostOp #gjsnGrVar
gr <- c(0:7,100)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$LiggetidPostOp, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- c(0:6, '7+')
xAkseTxt <- 'Antall liggedøgn' #(subtxt
subtxt <- 'døgn'
if (figurtype=='gjsnGrVar') {tittel <- 'liggetid etter operasjon'}
sortAvtagende <- 'F'
TittelVar <- 'Liggetid etter operasjon'
ytxt1 <- 'liggetid'
KIekstrem <- c(0, 20)
}
if (valgtVar %in% c('misfornoyd', 'misfornoyd3mnd', 'misfornoyd12mnd')) { #AndelGrVar #%in% c('Misfor3mnd','Misfor12mnd')) { #AndelGrVar
#3/12mndSkjema. Andel med Misfornøyd/litt misfornøyd (1,2)
#Kode 1:5,9: 'Fornøyd', 'Litt fornøyd', 'Verken eller', 'Litt misfornøyd', 'Misfornøyd', 'Ukjent')
RegData$Misfornoyd <- switch(as.character(ktr),
'1'= RegData$Fornoyd3mnd,
'2'= RegData$Fornoyd12mnd)
RegData <- RegData[which(RegData$Misfornoyd %in% 1:5), ]
RegData$Variabel[which(RegData$Misfornoyd %in% 4:5)] <- 1
tittel <- paste0('Misfornøyde pasienter' ,ktrtxt)
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar == 'morsmal') { #fordeling AndelGrVar, AndelTid
grtxt <- c('Norsk', 'Samisk', 'Annet', 'Ikke utfylt')
tittel <- 'Morsmål'
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$Morsmal, levels = c(1:3,9))
if (figurtype %in% c('andelTid', 'andelGrVar')) {
RegData <- RegData[which(RegData$Morsmal %in% 1:3), ]
RegData$Variabel[which(RegData$Morsmal %in% 2:3)] <- 1
tittel <- 'Fremmedspråklige (ikke norsk som morsmål)'
varTxt <- 'fremmedspråklige'
sortAvtagende <- F}
}
if (valgtVar %in% c('nytte', 'nytte3mnd', 'nytte12mnd')) { #fordeling, AndelGrVar
#Andel med helt bra/mye bedre (1:2)
#Kode 1:7: ''Helt bra', 'Mye bedre', 'Litt bedre', 'Uendret', 'Litt verre', 'Mye verre',
# 'Verre enn noen gang', 'Ukjent')
tittel <- c('Hvilken nytte har du hatt av operasjonen?',ktrtxt)
RegData$Nytte <- switch(as.character(ktr),
'1'=RegData$Nytte3mnd,
'2'=RegData$Nytte12mnd)
datoTil <- min(datoTil, Sys.Date()-trekkfraDager)
retn <- 'H'
RegData$VariabelGr <- 9
indDum <- which(RegData$Nytte %in% 1:7)
RegData$VariabelGr[indDum] <- RegData$Nytte[indDum]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$VariabelGr, levels = c(1:7,9))
grtxt <- c('Helt bra', 'Mye bedre', 'Litt bedre', 'Uendret', 'Litt verre', 'Mye verre',
'Verre enn noen gang', 'Ukjent')
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$Nytte %in% 1:7), ]
RegData$Variabel[RegData$Nytte %in% 1:2] <- 1
tittel <- paste0('Helt bra eller mye bedre' , ktrtxt)
}}
if (valgtVar=='opInd') { #fordeling
tittel <- 'Operasjonsindikasjon'
retn <- 'H'
flerevar <- 1
variable <- c('OpIndCauda', 'OpIndParese') #, 'OpIndSme')
grtxt <- c('Cauda equlina', 'Parese')# , 'Smerter')
}
if (valgtVar == 'opIndPareseGrad') {#fordeling
tittel <- 'Operasjonsindikasjon, paresegrad'
grtxt <- c(0:5, 'Ukjent')
RegData <- RegData[which(RegData$OpIndParese ==1),]
indDum <- which(RegData$OpIndPareseGrad %in% 0:5)
RegData$VariabelGr <- 9
RegData$VariabelGr[indDum] <- RegData$OpIndPareseGrad[indDum]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$VariabelGr, levels = c(0:5,9))
}
if (valgtVar %in% c('oppf3mnd', 'oppf12mnd', 'oppf3og12mnd')) { #AndelGrVar
#Oppfølgingsskjema.
#"Ferdig1a", "Ferdig2a", "Ferdigstilt1b12mnd", "Ferdigstilt1b3mnd"
datoTil <- min(datoTil, Sys.Date()-trekkfraDager)
ind <- switch(valgtVar,
oppf3mnd = which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1),
oppf12mnd = which(RegData$Ferdigstilt1b12mnd==1),
oppf3og12mnd = which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1 & RegData$Ferdigstilt1b12mnd==1 ))
RegData$Variabel[ind] <- 1
tittel <- paste0('Svart på oppfølging, ',
switch(valgtVar,
oppf3mnd = '3 mnd. etter',
oppf12mnd = '12 mnd. etter',
oppf3og12mnd = 'både 3 og 12 mnd. etter'))
sortAvtagende <- T
}
if (valgtVar == 'opKat') { #fordeling, andel øhjelp
#retn <- 'H'
tittel <- 'Operasjonskategori'
grtxt <- c('Elektiv', 'Akutt', '1/2-Akutt', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$OpKat, levels = c(1:3,9))
if (figurtype %in% c('andelTid', 'andelGrVar')) {
RegData <- RegData[which(RegData$OpKat %in% 1:3), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OpKat ==2)] <- 1
tittel <- 'Øyeblikkelig hjelp'
varTxt <- 'ø-hjelp'
sortAvtagende <- F}
}
if (valgtVar %in% c('OswEndr', 'OswEndr3mnd', 'OswEndr12mnd')) {
#Forbedring=lavere Oswestry
tittel <- paste0('forbedring av ODI', ktrtxt)
RegData$Variabel <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot3mnd),
'2'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot12mnd))
RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
KIekstrem <- c(-100, 100)
}
if (valgtVar %in% c('OswEndrPre', 'OswEndrPre3mnd', 'OswEndrPre12mnd')) { #Sammenligner endring og prescore
#Forbedring=lavere Oswestry
tittel <- paste0('forbedring av ODI', ktrtxt)
RegData$Variabel <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot3mnd),
'2'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot12mnd))
RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
KIekstrem <- c(-100, 100)
Xlab <- 'Oswestry før operasjon'
gr <- c(seq(0,90,10), 101)
RegData$Gr <- cut(RegData$OswTotPre, gr, right=F)
GrNavn <- levels(RegData$Gr)
GrNavn[length(GrNavn)] <- '[90,100]'
}
if (valgtVar == 'OswEndrLav') { #AndelGrVar
#Mislykkede operasjoner
RegData$OswEndr <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot3mnd),
'2'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot12mnd))
RegData <- RegData[which(RegData$OswEndr >= -100), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OswEndr <13)] <- 1
tittel <- paste0('Forbedring av Oswestry-skår < 13 poeng', ktrtxt)
sortAvtagende <- F
}
if (valgtVar %in% c('OswEndr20', 'OswEndr203mnd', 'OswEndr2012mnd')) { #AndelGrVar, andelTid
#Mislykkede operasjoner
RegData$OswEndr <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot3mnd),
'2'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot12mnd))
RegData <- RegData[which(RegData$OswEndr >= -100), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OswEndr >=20)] <- 1
varTxt <- 'med >20 poeng forbedring'
tittel <- paste0('Forbedring av Oswestry-skår >= 20 poeng', ktrtxt)
}
if (valgtVar %in% c('OswEndr30pst', 'OswEndr30pst3mnd', 'OswEndr30pst12mnd')) { #AndelGrVar, andelTid
#Andel med klinisk signifikant forbedring i Oswestry-skår.
#Forbedring = nedgang
RegData$OswPst <- switch(as.character(ktr),
'1' = (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot3mnd)/RegData$OswTotPre*100,
'2' = (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot12mnd)/RegData$OswTotPre*100)
RegData <- RegData[which(RegData$OswPst>=-1000), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OswPst >=30)] <- 1
varTxt <- 'med \u2265 30 % forbedring'
tittel <- paste0('Minst 30% forbedring av Oswestry-skår', ktrtxt)
}
if (valgtVar %in% c('Osw22', 'Osw223mnd', 'Osw2212mnd')) { #AndelGrVar
#Andel med Oswestry-skår under 23 etter op.
RegData$OswPost <- switch(as.character(ktr),
'1' = RegData$OswTot3mnd,
'2' = RegData$OswTot12mnd)
RegData <- RegData[which(RegData$OswPost>=0), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OswPost <= 22)] <- 1
tittel <- paste0('Oswestry-skår < 23 poeng', ktrtxt)
}
if (valgtVar %in% c('Osw48', 'Osw483mnd', 'Osw4812mnd')) { #AndelGrVar
#Andel med Oswestry-skår fortsatt over 48.
RegData$OswPost <- switch(as.character(ktr),
'1' = RegData$OswTot3mnd,
'2' = RegData$OswTot12mnd)
RegData <- RegData[which(RegData$OswPost>=0), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OswPost >48)] <- 1
tittel <- paste0('Oswestry-skår > 48 poeng', ktrtxt)
sortAvtagende <- F
}
if (valgtVar == 'OswTotPre') { #fordeling, gjsnBox, gjsnGrVar
RegData$Variabel <- RegData$OswTotPre
RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
tittel <- 'oswestryskår før operasjonen'
gr <- seq(0, 100, 10)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$Variabel, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- levels(RegData$VariabelGr)
xAkseTxt <- 'skår'
KIekstrem <- c(0, 100)
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar=='peropKomp') { #AndelGrVar
#Komplikasjoner ved operasjon
#Kode 1:Ja, tomme:Nei
RegData$Variabel[which(RegData$PeropKomp == 1)] <- 1
tittel <- 'Komplikasjoner ved operasjon'
varTxt <- 'med komplikasjoner'
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar=='peropKompDura') { #AndelGrVar
#Durarift ved operasjon
#Kode 1:Ja, tomme:Nei
RegData$Variabel[which(RegData$PeropKompDura == 1)] <- 1
tittel <- 'Komplikasjon ved operasjon: Durarift'
sortAvtagende <- FALSE
xAkseTxt <- 'Andel durarift (%)'
varTxt <- 'med durarift'
# if (hovedkat == 1) {KImaalGrenser <- c(0,2,20)}
# if (hovedkat %in% c(5,9)) {KImaalGrenser <- c(0,3,20)}
}
if (valgtVar=='radUnders') { #fordeling
tittel <- 'Radiologisk undersøkelse'
retn <- 'H'
flerevar <- 1
variable <- c('RvCt', 'RvMr', 'RvRtgLscol', 'RvFunksjo') #'RvRadigr-it', 'RvDiscogr-ut', 'RvDpregblok',
grtxt <- c('CT', 'MR', 'Rtg.LS-columna', 'Fleks./Ekst.') #'Radikulografi-ut', 'Diskografi-ut', 'Diag.blokade'-finnes,
#variable <- c('RvCt', 'RvMr', 'RvRadigr', 'RvDiscogr', 'RvDpregblok', 'RvRtgLscol', 'RvFunksjo')
#grtxt <- c('CT', 'MR', 'Radikulografi', 'Diskografi', 'Diag.blokade', 'Rtg.LS-columna', 'Fleks./Ekst.')
}
if (valgtVar == 'regDiffOp') { #Andeler
#Verdier: 0-3402
tittel <- 'Tid fra utfylling av pasientskjema(?) til operasjon'
#if (figurtype == 'andeler') { #Fordelingsfigur
#14 dager, mellom 15 dager og 3 mnd, mer enn 3 mnd
gr <- c(-1000,-30, -14, 0, 15, 91, 2000)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$DiffUtfOp, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- c('<-30d', levels(RegData$VariabelGr)[2:(length(gr)-2)], '>3mnd')
subtxt <- 'dager fra operasjon til utfylling' #}
}
if (valgtVar == 'regForsinkelse') { #Andeler, GjsnGrVar
#Verdier: -2205 - 969
RegData <- RegData[which(RegData$DiffUtFerdig > -1), ]
tittel <- switch(figurtype,
andeler='Tid fra utskriving til ferdigstilt registrering',
andelGrVar = 'Mer enn 30 dager fra utskriving til ferdig registrering') #
subtxt <- 'døgn'
cexgr <- 0.9
xAkseTxt <- 'dager'
sortAvtagende <- FALSE
datoTil <- min(datoTil, Sys.Date()-trekkfraDager)
if (figurtype == 'andeler') { #Fordelingsfigur
gr <- c(seq(0,98,7), 2000)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$DiffUtFerdig, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
#plot(RegData$VariabelGr)
grtxt <- c(1:14, '>3 mnd.')
subtxt <- 'innen gitte uker etter utskriving'
}
if (figurtype %in% c('andelTid', 'andelGrVar')) {
RegData$Variabel[which(RegData$DiffUtFerdig >90)] <- 1
tittel <- 'Registrert for sent for 3 mnd. oppfølging'
varTxt <- 'for sent registrert'
sortAvtagende <- F}
#KImaalGrenser <- c(0,3,10,100)
}
if (valgtVar=='roker') { #fordeling, AndelGrVar, #AndelTid
#PasientSkjema. Andel med Roker=1
#Kode 0,1,tom: Nei, Ja Ukjent
#V3: [0,1,2,9] ["Nei","Ja","Har røkt tidligere","Ikke utfylt"]
tittel <- 'Røyker du?'
if (figurtype == 'andeler'){
grtxt <- c("Nei","Ja","Har røkt tidligere","Ikke utfylt")
RegData <- RegData[which(RegData$RokerV3 %in% c(0:2,9)), ]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$RokerV3, levels = c(0:2,9))
}
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')){
# RegData <- RegData[which(RegData$RokerV3 %in% 0:2), ]
# RegData$Variabel[RegData$RokerV3==1] <- 1
RegData <- RegData[which(RegData$RokerV2 %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$RokerV2
tittel <- 'Røykere'
varTxt <- 'røykere'
sortAvtagende <- FALSE}
}
if (valgtVar == 'saardren') { #AndelGrVar
#LegeSkjema. Andel med Saardren=1
#Kode 0,1,tom: Nei, Ja Ukjent
grtxt <- c('Nei', 'Ja', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$Saardren, levels = c(0:1,9))
tittel <- 'Sårdren'
sortAvtagende <- F
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')){
RegData <- RegData[which(RegData$Saardren %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$Saardren
tittel <- 'Andel som får sårdren (%)'
}
}
if (valgtVar == 'sivilStatus') { #fordeling
tittel <- 'Sivilstatus'
#V2: grtxt <- c('Gift', 'Samboer', 'Enslig', 'Ukjent')
grtxt <- c('Gift/Samboer', 'Enslig', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$SivilStatusV3, levels = c(1:2,9))
}
if (valgtVar == 'smStiPreHypp') { #fordeling
tittel <- 'Hyppighet av smertestillende før operasjonen'
grtxt <- c('Sjeldnere', 'Månedlig', 'Ukentlig', 'Daglig', 'Flere ganger om dagen', 'Ikke utfylt') #'Oftere',
#RegData <- RegData[which(RegData$SmHyppPre %in% c(1:5, 9)), ]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$SmHyppPre, levels = c(1:5,9))
retn <- 'H'
}
if (valgtVar %in% c('smBeinEndr', 'smBeinEndr3mnd', 'smBeinEndr12mnd')) {
tittel <- paste0('bedring av beinsmerter ',ktrtxt)
RegData <- RegData[which((RegData$SmBePre %in% 0:10) &
(RegData$SmBe3mnd %in% 0:10) & (RegData$SmBe3mnd %in% 0:10)), ]
RegData$Variabel <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$SmBePre - RegData$SmBe3mnd),
'2'= (RegData$SmBePre - RegData$SmBe12mnd))
#RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
KIekstrem <- c(-10,10)
}
if (valgtVar == 'smBePre') { #fordeling, gjsn
if (figurtype=='andeler'){
RegData$VariabelGr <- RegData$SmBePre
levels(RegData$VariabelGr) <- c(0:10,99)
grtxt <- c(as.character(0:10), 'Ikke utfylt')
tittel <- 'Beinsmerter før operasjon'
}
if (figurtype %in% c('gjsnBox', 'gjsnGrVar')){
RegData <- RegData[RegData$SmBePre %in% 0:10, ]
RegData$Variabel <- RegData$SmBePre
tittel <- 'beinsmerter før operasjonen'
}
xAkseTxt <- 'skår'
KIekstrem <- c(0, 10)
}
if (valgtVar == 'smBePreLav') { #AndelGrVar, AndelTid
#Lav beinsmerte og ingen parese. (Først og fremst prolaps)
RegData <- RegData[which(RegData$SmBePre %in% 0:10),]
RegData$Variabel[which((RegData$OpIndParese==0) & (RegData$SmBePre < 3.5))] <- 1
sortAvtagende <- F
tittel <- "Lite beinsmerter og ingen parese" #expression("Lite beinsmerter og ingen parese") #paste0('Beinsmerte ', expression(""<="3"), ' og ingen parese')
#intToUtf8(2264)
#KImaalRetn <- 'lav'
KImaalGrenser <- c(0,3,100)
varTxt <- 'med manglende indikasjon'
}
if (valgtVar %in% c('smRyggEndr', 'smRyggEndr3mnd', 'smRyggEndr12mnd')) {#gjsn
tittel <- paste0('forbedring av ryggsmerter', ktrtxt)
RegData <- RegData[which((RegData$SmRyPre %in% 0:10) &
(RegData$SmRy3mnd %in% 0:10) & (RegData$SmRy12mnd %in% 0:10)), ]
RegData$Variabel <- switch(as.character(ktr),
'1'= RegData$SmRyPre - RegData$SmRy3mnd,
'2'= RegData$SmRyPre - RegData$SmRy12mnd)
KIekstrem <- c(-10,10)
}
if (valgtVar == 'smRyggPre') { #fordeling, gjsn
if (figurtype=='andeler'){
RegData$VariabelGr <- RegData$SmRyPre
levels(RegData$VariabelGr) <- c(0:10,99)
grtxt <- c(as.character(0:10), 'Ikke utfylt')
tittel <- 'Ryggsmerter før operasjon'
}
if (figurtype %in% c('gjsnBox', 'gjsnGrVar')){
RegData <- RegData[RegData$SmRyPre %in% 0:10, ]
RegData$Variabel <- RegData$SmRyPre
tittel <- 'ryggsmerter før operasjonen'
}
}
if (valgtVar == 'smStiPre') { #fordeling, andelGrVar/Tid
tittel <- 'Bruk av smertestillende før operasjonen'
grtxt <- c('Nei', 'Ja', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$SmStiPre, levels = c(0:1,9))
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$SmStiPre %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$SmStiPre
varTxt <- 'som brukte smertestillende'
sortAvtagende <- F}
}
if (valgtVar %in% c('symptVarighRyggHof','sympVarighUtstr')) { #fordeling, andelGrVar/Tid
grtxt <- c('Ingen', '<3 mnd', '3-12 mnd', '1-2 år', '> 2 år', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(switch(valgtVar,
symptVarighRyggHof = RegData$SymptVarighRyggHof,
sympVarighUtstr = RegData$SympVarighUtstr),
levels = c(1:5,9)
)
tittel <- switch(valgtVar,
symptVarighRyggHof = 'Varighet av rygg-/hoftesmerter',
sympVarighUtstr = 'Varighet av utstrålende smerter'
)
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$VariabelGr %in% 1:5), ]
RegData$Variabel[which(RegData$VariabelGr %in% 4:5)] <- 1
varTxt <- 'med varighet minst 1 år'
tittel <- switch(valgtVar,
symptVarighRyggHof ='Varighet av rygg-/hoftesmerter minst ett år',
sympVarighUtstr = 'Varighet av utstrålende smerter minst ett år')
sortAvtagende <- F}
# if (valgtVar == 'sympVarighUtstr') {KImaalGrenser <- c(0,20,100)}
}
if (valgtVar == 'tidlOpr') {
tittel <- 'Tidligere ryggoperert?'
retn <- 'H'
grtxt <- c('Samme nivå', 'Annet nivå', 'Annet og sm. nivå', 'Primæroperasjon') #, 'Ukjent')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$TidlOpr, levels = c(1:4))
}
if (valgtVar=='tidlOprAntall') {
tittel <- 'Antall tidligere operasjoner'
gr <- c(-1:5, 1000)
RegData$Variabel <- -1
RegData$Variabel[RegData$TidlOpr==4] <- 0
indDum <- which(RegData$TidlOprAntall>-1)
RegData$Variabel[indDum] <- RegData$TidlOprAntall[indDum]
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$Variabel, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- c('Ukjent', 0:4,paste0('5-', max(RegData$TidlOprAntall, na.rm=T)))
}
if (valgtVar == 'tidlOp3'){ #AndelTid, AndelGrVar
RegData$Variabel[RegData$TidlOprAntall>2] <- 1
varTxt <- 'med >2 tidl. operasjoner'
tittel <- 'Flere enn to tidligere operasjoner'
sortAvtagende <- F
}
if (valgtVar == 'trombProfyl') { #AndelGrVar, AndelTid
#Legeskjema
tittel <- 'Tromboseprofylakse gitt ifm. operasjon'
#if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')){
RegData <- RegData[which(RegData$PostopTrombProfyl %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$PostopTrombProfyl
varTxt <- 'fått tromboseprofylakse'
sortAvtagende <- F #}
}
if (valgtVar == 'trombProfylLettKI') { #AndelGrVar, AndelTid
#Legeskjema
#Spesifisering: (BlodfortynnendeFast = 0 & ASA grad< 3 & Kjønn = 1 (mann)) & (HovedInngrepV2V3=1 eller HovedInngrepV2V3=2)
#Mål: < landsgjennomsnittet høy måloppnåelse (grønt), ≥ landsgjennomsnittet moderat/lav (gult)
indUtv <- which((RegData$ASA<3) & (RegData$ErMann==1) & (RegData$HovedInngrepV2V3 %in% 1:2) & (RegData$BlodfortynnendeFast==0))
#(RegData$ErMann==1) & (RegData$HovedInngrepV2V3 %in% 1:2) er også hardkodet utvalg i andelsfigurene.
RegData <- RegData[indUtv,]
tittel <- 'Tromboseprofylakse gitt, ASA<3'
RegData <- RegData[which(RegData$PostopTrombProfyl %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$PostopTrombProfyl
varTxt <- 'fått tromboseprofylakse'
sortAvtagende <- F
KImaalGrenser <- 'landsgj'
}
if (valgtVar == 'tryggKir') { #fordeling, AndelGrVar, AndelTid
#Legeskjema. Andel med UforetrygdPre ja og planlegger. Innført V3
tittel <- 'Ble "trygg kirurgi"-prosedyre gjennomført?'
#retn <- 'H'
grtxt <- c('Nei', 'Ja, ved start', 'Ja, ved avslutning', 'Ja, start/avslutn.', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$SafeSurgery, levels = c(0:3,9))
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')){
RegData <- RegData[which(RegData$SafeSurgery %in% 0:3), ]
RegData$Variabel[which(RegData$SafeSurgery %in% c(1:3))] <- 1
varTxt <- 'trygg kirurgi'
KImaalGrenser <- c(0,95,100)
sortAvtagende <- T}
}
if (valgtVar == 'uforetrygdPre') { #fordeling, AndelGrVar, AndelTid
#PasientSkjema. Andel med UforetrygdPre ja og planlegger
#Kode V2 1:4,tom: 'Ja', 'Nei', 'Planlegger søknad', 'Innvilget', 'Ukjent')
#V3: [0,1,2,3,9] ["Nei","Ja","Planlegger å søke","Er allerede innvilget","Ikke utfylt"]
tittel <- 'Har pasienten søkt uføretrygd?'
#retn <- 'H'
grtxt <- c('Nei', 'Ja', 'Planlegger søknad', 'Innvilget', 'Ukjent')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$UforetrygdPre, levels = c(0:3,9))
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')){
RegData <- RegData[which(RegData$UforetrygdPre %in% 0:3), ]
RegData$Variabel[which(RegData$UforetrygdPre %in% c(1,2))] <- 1
varTxt <- 'søkt/planlagt å søke'
tittel <- 'Har søkt/planlegger å søke uføretrygd før op.'
sortAvtagende <- F}
}
if (valgtVar == 'utd') { #AndelGrVar, AndelTid
#PasientSkjema. Andel med Utdanning 4 el 5
#Kode V2 1:5,9: 'Grunnskole++, 7-10år','Real-, yrkes- el vg skole', 'Allmennfaglig vg skole',
#Høyskole/universitet, <4 år', 'Høyskole/universitet, 4år+', 'Ukjent'
#V3: [1,2,3,4,5,9] ["Grunnskole 7-10 år, framhaldsskole eller folkehøyskole",
grtxt <- c('Grunnskole, 7-10år','Real-, yrkes- el vg skole', #'Real-, yrkes-/yrkesfaglig vg skole',
'Allmennfaglig vg skole','Høyskole/universitet, <4 år','Høyskole/universitet, 4år+',
'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$Utd, levels = c(1:5,9))
retn <- 'H'
tittel <- 'Høyeste fullførte utdanning'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData$Variabel[which(RegData$Utd %in% 4:5)] <- 1
varTxt <- 'med høyere utdanning'
tittel <- 'Andel høyskole-/universitetsutdannede'
}}
if (valgtVar == 'ventetidHenvTimePol') { #Fordeling, AndelGrVar, AndelTid
grtxt <- c("< 3 mnd.","3-6 mnd","6-12 mnd.","> 12 mnd.","Ikke utfylt")
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$VentetidHenvTilSpesialist, levels = c(1:4,9))
retn <- 'H'
tittel <- 'Ventetid fra henvisning til time på poliklinikk'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$VentetidHenvTilSpesialist %in% 1:4),]
RegData$Variabel[which(RegData$VentetidHenvTilSpesialist == 1)] <- 1
varTxt <- 'ventet <3mnd'
tittel <- 'Ventetid < 3 mnd. fra henvisning til time på poliklinikk'
}}
if (valgtVar == 'ventetidSpesOp') { #Fordeling, AndelGrVar, AndelTid
grtxt <- c("< 3 mnd.","3-6 mnd","6-12 mnd.","> 12 mnd.","Ikke utfylt")
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$VentetidSpesialistTilOpr, levels = c(1:4,9))
retn <- 'H'
tittel <- 'Ventetid fra operasjon bestemt til utført'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$VentetidSpesialistTilOpr %in% 1:4),]
RegData$Variabel[which(RegData$VentetidSpesialistTilOpr == 1)] <- 1
varTxt <- 'ventet <3mnd'
tittel <- 'Ventetid < 3 mnd. fra operasjon bestemt til utført'
KImaalGrenser <- c(0,50,80,100)
}}
if (valgtVar %in% c('verre', 'verre3mnd', 'verre12mnd')) { #AndelGrVar #%in% c('Verre3mnd','Verre12mnd')) {
#3/12mndSkjema. Andel med helt mye verre og noen sinne (6:7)
#Kode 1:7,9: ''Helt bra', 'Mye bedre', 'Litt bedre', 'Uendret', 'Litt verre', 'Mye verre',
# 'Verre enn noen gang', 'Ukjent')
RegData$Nytte <- switch(as.character(ktr),
'1'=RegData$Nytte3mnd,
'2'=RegData$Nytte12mnd)
RegData <- RegData[which(RegData$Nytte %in% 1:7), ]
RegData$Variabel[RegData$Nytte %in% 6:7] <- 1
tittel <- paste0('Mye verre/verre enn noen gang' , ktrtxt)
sortAvtagende <- F
}
RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
#print(datoTil)
RegData <- RegData[RegData$InnDato < datoTil,]
UtData <- list(RegData=RegData, grtxt=grtxt, cexgr=cexgr, varTxt=varTxt, xAkseTxt=xAkseTxt,
KImaalGrenser=KImaalGrenser, KIekstrem=KIekstrem, #KImaal=KImaalRetn,
retn=retn, subtxt=subtxt, tittel=tittel, antDes=antDes,
flerevar=flerevar, variable=variable, sortAvtagende=sortAvtagende)
#RegData inneholder nå variablene 'Variabel' og 'VariabelGr'
return(invisible(UtData))
}
Rapporteket/rygg documentation built on March 20, 2024, 11:44 p.m.
R Package Documentation
Browse R Packages
We want your feedback!
Note that we can't provide technical support on individual packages. You should contact the package authors for that.
Defines functions RyggVarTilrettelegg
Documented in RyggVarTilrettelegg
#' Funksjon for å tilrettelegge variable for beregning.
#'
#' Denne funksjonen gjør utvalg og tilrettelegger variable (gitt ved valgtVar) til videre bruk.
#' Videre bruk kan eksempelvis være beregning av AggVerdier eller gjennomsnitt.
#' Funksjonen gjør også filtreringer som å fjerne ugyldige verdier for den valgte variabelen, samt ta høyde for avhengigheter med
#' andre variable. Det er også her man angir aksetekster og titler for den valgte variabelen.
#' Her kan mye hentes til analysebok
#' Når ei fordeling består av flere variable, settes flerevar=1. Vi omdefinerer variablene slik at
#' alle gyldige registreringer (dvs. alle registreringer som skal telles med) er 0 eller 1.
#' De som har oppfylt spørsmålet
#' er 1, mens ugyldige registreringer er NA. Det betyr at hvis vi skal ta bort registreringer
#' som i kategorier av typen "Ukjent" kodes disse som NA, mens hvis de skal være med kodes de som 0.
#' Vi sender tilbake alle variable som indikatorvariable, dvs. med 0,1,NA
#'
#' @inheritParams RyggFigAndeler
#' @inheritParams RyggUtvalgEnh
#' @param figurtype Hvilken figurtype det skal tilrettelegges variable for:
#' 'andeler', 'andelGrVar', 'andelTid', 'gjsnGrVar', 'gjsnTid'
#'
#' @return Definisjon av valgt variabel.
#'
#' @export
#'
RyggVarTilrettelegg <- function(RegData=NULL, valgtVar, ktr=0, datoFra='2007-01-01',
datoTil=Sys.Date(), hovedkat=99, figurtype='andeler'){ #grVar='',
"%i%" <- intersect
#----------- Figurparametre ------------------------------
cexgr <- 1 #Kan endres for enkeltvariable
retn <- 'V' #Vertikal som standard. 'H' angis evt. for enkeltvariable
flerevar <- 0
grtxt <- '' #Spesifiseres for hver enkelt variabel
grtxt2 <- '' #Spesifiseres evt. for hver enkelt variabel
varTxt <- ''
xAkseTxt <- '' #Benevning
subtxt <- ''
antDes <- 1
if (figurtype == 'andelGrVar') {xAkseTxt <- 'Andel operasjoner (%)'}
sortAvtagende <- TRUE #Sortering av resultater
KImaalGrenser <- NA
tittel <- 'Variabelvalg (valgtVar) feil angitt' # ? I AndelerGrVar og GjsnGrVar genereres tittel i beregningsfunksjonen
variable <- 'Ingen'
#deltittel <- ''
if (!is.null(RegData)) {RegData$Variabel <- 0}
#Kan her definere opp alle aktuelle grupperingsvariable og deres tekst, eller
#sende inn grupperingsvariabel og så gjøre beregninger. (Ulempe: Ekstra avhengigheter)
#Sentralt spm: Hvor skal det avgjøres hvilken figurtype som vises??? her
KIekstrem <- NULL
#----Filtrere på at oppfølgigsskjema finnes
#ktr kan ha verdiene 0, 1 eller 2
valgtVarTest <- valgtVar
if (length(grep('3mnd', valgtVar)) == 1) {
ktr <- 1
valgtVarTest <- sub('3mnd', '', valgtVar)
}
if (length(grep('12mnd', valgtVar) == 1)) {
ktr <- 2
valgtVarTest <- sub('12mnd', '', valgtVar)
}
varPrePost <- c('fornoydhet', 'nytte', 'EQ5DEndr','EQ5DEndr',
'OswEndr', 'SmBeinEndr', 'SmRyggEndr',
'OswEndrPre', 'SmBeinEndrPre', 'SmRyggEndrPre')
if ((valgtVarTest %in% varPrePost) & (ktr==0)) {ktr <- 1}
ktrtxt <- c(' før operasjon', ' (3 mnd etter)', ' (12 mnd. etter)')[ktr+1]
trekkfraDager <- c(0,100,380)[ktr+1]
#-------------------------------------
if (valgtVar=='deknRygg17') { #andelerGrVar
tittel <- 'Dekningsgrad, NKR Degenerativ Rygg, 2017'
xAkseTxt <- 'dekningsgrad, NKR'
KImaal <- 0.8
data('deknRygg17', package = 'nkr') #paste0(valgtVar,'.Rdata')
RegData <- deknRygg17 #paste0(valgtVar)
}
if (valgtVar=='deknNakke17') { #andelerGrVar
tittel <- 'Dekningsgrad, NKR Degenerativ Nakke, 2017'
xAkseTxt <- 'dekningsgrad, NKR'
KImaal <- 0.8
data(deknNakke17, package = 'nkr')
RegData <- deknNakke17 #paste0(valgtVar)
}
if (valgtVar=='deknRygg19') { #andelerGrVar
tittel <- 'Dekningsgrad, NKR Degenerativ Rygg, 2019'
xAkseTxt <- 'dekningsgrad, NKR'
KImaal <- 0.8
data('deknRygg19', package = 'rygg') #paste0(valgtVar,'.Rdata')
RegData <- deknRygg19 #paste0(valgtVar)
}
if (valgtVar=='deknNakke19') { #andelerGrVar
tittel <- 'Dekningsgrad, NKR Degenerativ Nakke, 2019'
xAkseTxt <- 'dekningsgrad, NKR'
KImaal <- 0.8
data(deknNakke19, package = 'nakke')
RegData <- deknNakke19 #paste0(valgtVar)
}
if (valgtVar=='alder') { #Fordeling, GjsnGrVar, GjsnTid
RegData <- RegData[which(RegData$Alder>=0), ] #Tar bort alder<0
RegData$Variabel <- RegData$Alder #GjsnTid, GjsnGrVar
xAkseTxt <- 'alder (år)'
tittel <- 'Alder ved innleggelse' #c('XX', 'test av tittel over to linjer') - funker!
subtxt <- 'Aldersgrupper (år)'
if (figurtype %in% c('gjsnGrVar', 'gjsnTid')) {
tittel <- 'alder ved innleggelse'}
if (figurtype == 'andeler') { #Fordelingsfigur
gr <- c(0,seq(20,90,10),150)
#gr <- c(seq(0, 100, 10),150)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$Alder, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- c('0-19', '20-29', '30-39', '40-49', '50-59', '60-69', '70-79', '80-89', '90+') #c(levels(RegData$VariabelGr)[-length(gr)], '90+') #c(names(AndelLand)[-length(gr)], '90+')
#grtxt <- c('0-9','10-19','20-29','30-39','40-49','50-59','60-69','70-79','80-89','90-99','100+')
xAkseTxt <- 'Aldersgrupper (år)'}
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar=='alder70') { #AndelTid, AndelerGrVar
RegData <- RegData[which(RegData$Alder>=0), ] #Tar bort alder<0
RegData$Variabel[which(RegData$Alder>=70)] <- 1
varTxt <- 'over 70 år'
tittel <- 'Pasienter over 70 år'
}
if (valgtVar == 'antibiotika') { #fordeling, AndelGrVar, AndelTid
grtxt <- c('Nei', 'Ja', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$AntibiotikaV3, levels = c(0,1,9))
tittel <- 'Er det gitt antibiotikaprofylakse?'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$AntibiotikaV3 %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$AntibiotikaV3
tittel <- 'Fått antibiotika'
varTxt <- 'som har fått antibiotika'
}
}
if (valgtVar=='antibiotikaMedikament'){ #fordeling
tittel <- 'Antibiotikatyper'
grtxt <- c("Cefalotin","Cefuroxim","Cefalexin","(Di)Kloksacillin","Klindamycin",
"Penicillin","Erytromycin","Ampicillin","Tetracyclin","Trimetoprim+Sulfonamid",
"Vancomycin","Fusidinsyre","Ciprofloxacin","Cefazolin","Annet")
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$AntibiotikaMedikament, levels = c(1:14,20))
retn <- 'H'
}
if (valgtVar %in% c('arbstatus', 'arbstatus3mnd', 'arbstatus12mnd')) { #Fordeling, AndelGrVar, AndelTid
# Andel i kategori 6 tom 9, mottar sykepenger Av 1-9, (ikke bare de som sykemeldt fra før)
# Gml: grtxt <- c('I arbeid','Hjemmeværende', 'Studie/skole', 'Pensjonist', 'Arbeidsledig', 'Sykemeldt',
# 'Aktiv sykemeldt', 'Delvis sykemeldt', 'Attføring/rehab.', 'Uføretrygdet', 'Ukjent')
datoTil <- min(datoTil, Sys.Date()-trekkfraDager)
RegData$Arbstatus <- switch(as.character(ktr),
'0' = RegData$ArbstatusPreV3,
'1'= RegData$Arbstatus3mndV3,
'2'= RegData$Arbstatus12mndV3)
ind <- switch(as.character(ktr),
'0' = 1:dim(RegData)[1],
'1' = which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1),
'2' = which(RegData$Ferdigstilt1b12mnd == 1))
RegData <- RegData[ind, ]
retn <- 'H'
grtxt <- c("Fulltidsjobb","Deltidsjobb","Student/skoleelev",
"Alderspensjonist", "Arbeidsledig","Sykemeldt","Delvis sykemeldt",
"Arbeidsavklaringspenger", "Uførepensjonert","Ikke utfylt")
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$Arbstatus, levels = c(1:9,99))
tittel <- paste0('Arbeidsstatus, ', ktrtxt)
if (figurtype %in% c('andelTid', 'andelGrVar')) {
RegData <- RegData[which(RegData$Arbstatus %in% 1:9), ]
RegData$Variabel[which(RegData$Arbstatus %in% 6:9)] <- 1
tittel <- paste0('Mottar sykepenger' ,ktrtxt)
varTxt <- 'som mottar sykepenger'}
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar == 'ASA') { #fordeling, AndelGrVar
grtxt <- c('I:Ingen','II:Moderat', 'III:Alvorlig', 'IV:Livstruende', 'Ikke utfylt')
subtxt <- 'Sykdomsgrad'
RegData <- RegData[which(RegData$ASA %in% c(1:4,9)), ] #Antar ikke opererer døde...
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$ASA, levels = c(1:4,9))
tittel <- 'ASA-grad (komorbiditet)'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$ASA %in% 1:4), ]
RegData$Variabel[which(RegData$ASA > 2)] <- 1
tittel <- 'ASA-grad > II'
}
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar == 'BMI') { #Fordeling, AndelGrVar
#BMI > 30
RegData <- RegData[which(RegData$BMI >10), ]
gr <- c(0, 18.5, 25, 30, 35, 40, 1000)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$BMI, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
tittel <- 'Pasientenes BMI (Body Mass Index)'
grtxt <- c('<18,5', levels(RegData$VariabelGr)[2:(length(gr)-2)],'40+')
grtxt2 <- c('Undervekt', 'Normalvekt', 'Overvekt', 'Fedme', 'Fedme kl II', 'Fedme kl III')
xAkseTxt <- '"Body Mass Index"'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData$Variabel[which(RegData$BMI > 30)] <- 1
tittel <- 'Pasienter med fedme: (BMI>30)'
varTxt <- 'BMI>30'
sortAvtagende <- FALSE
}}
if (valgtVar == 'degSponFusj') { #AndelGrVar, AndelTid
#hovedkat=10 #Degen. spondylolistese
RegData <- RyggUtvalgEnh(RegData, hovedkat=10)$RegData
RegData$Variabel[which(RegData$HovedInngrep ==5)] <- 1
varTxt <- 'tilfeller'
tittel <- 'Degen. spondylolistese operert med fusjonskirurgi'
sortAvtagende <- F
xAkseTxt <- 'Andel med fusjonskirurgi (%)'
}
if (valgtVar == 'degSponFusj1op') { #AndelGrVar, AndelTid
# Kl 5. Andel pasienter med degenerativ spondylolistese som blir operert med
# fusjonskirurgi ved første operasjon
# Mål: ≤ landsgjennomsnittet høy måloppnåelse (grønt), > landsgjennomsnittet moderat/lav (gult)
# Hensikt: Redusere andel pasienter med degenerativ spondylolistese som blir operert
# med fusjonskirurgi ved første operasjon
#hovedkat=10 #Degen. spondylolistese
#RegData <- finnReoperasjoner(RegData = RegData)
RegData <- RyggUtvalgEnh(RegData, hovedkat=10)$RegData
RegData <- RegData[which(RegData$TidlOpr == 4), ]
RegData$Variabel[which(RegData$HovedInngrep ==5)] <- 1 # & RegData$TidlOpr == 4
varTxt <- 'tilfeller'
tittel <- 'Degen. spondylolistese, fusjonskirurgi ved første operasjon'
sortAvtagende <- F
xAkseTxt <- 'Andel med fusjonskirurgi i første operasjon (%)'
KImaalGrenser <- 'landsgj' #c(0,landsgj,100)
}
if (valgtVar == 'degSponSSSten') { #AndelGrVar
#(Først og fremst fusjonskirurgi)
RegData$Variabel[which((RegData$RfSentr==1) & (RegData$RfSpondtypeDegen == 1))] <- 1
tittel <- 'Degenerativ spondylolistese og sentral spinal stenose'
varTxt <- 'som har dette'
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar == 'EQ5DPre') {#ford gjsnPre (gjsnBox)
RegData <- RegData[which(RegData$EQ5DV3Pre > -0.6),]
gr <- c(-0.6, seq(-0.2, 0.9, 0.1), 1)
#gr <- c(0,seq(20,90,10),150)
RegData$VariabelGr <- cut(round(RegData$EQ5DV3Pre,3), breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
#grtxt <- c('0-19', '20-29', '30-39', '40-49', '50-59', '60-69', '70-79', '80-89', '90+')
grtxt <- levels(RegData$VariabelGr)
#grtxt <- c(levels(RegData$VariabelGr)[-length(gr)], '90+')
tittel <- 'EQ5D før operasjon'
if (figurtype %in% c('gjsnBox', 'gjsnGrVar')){
tittel <- 'EQ5D før operasjonen'}
RegData$Variabel <- RegData$EQ5DV3Pre
KIekstrem <- c(-0.6, 1)
}
if (valgtVar %in% c('EQ5DEndr', 'EQ5DEndr3mnd', 'EQ5DEndr12mnd')) {#gjsnPre (gjsnBox)
tittel <- paste0('forbedring av EQ5D', ktrtxt)
RegData$Variabel <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$EQ5DV33mnd - RegData$EQ5DV3Pre),
'2'= (RegData$EQ5D12V3mnd - RegData$EQ5DV3Pre))
RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
Xlab <- 'EQ5D før operasjon'
gr <- c(round(seq(-0.6,0.8,0.2),1),1.6) #round(seq(-0.6,1.6,0.3),1)}
RegData$Gr <- cut(RegData$EQ5DV3Pre, gr, right=F)
GrNavn <- levels(RegData$Gr)
AntGr <- length(GrNavn)
GrNavn[AntGr] <- '0.8+'
KIekstrem <- c(-1.6, 1.6)
}
if (valgtVar == 'EQangstPre') {#fordeling
tittel <- 'Problemer med angst/depresjon'
grtxt <- c('Ingen', 'Litt','Middels', 'Svært','Ekstremt', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$EqangstV3Pre, levels = c(1:5,9))
subtxt <- 'Grad av engstelighet/deprimerthet' #Tilstand i forhold til angst'
}
if (valgtVar == 'EQgangePre') { #fordeling
tittel <- 'Problemer med gangfunksjon før operasjon'
grtxt <- c('Ingen', 'Litt','Middels', 'Store', 'Ute av stand til å gå', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$EqgangeV3Pre, levels = c(1:5,9))
subtxt <- 'problemer med gange'
}
if (valgtVar == 'erstatningPre') { #fordeling, AndelGrVar, #AndelTid
#Pasientskjema. Andel med ErstatningPre
#V2: Kode 1:4,9: 'Ja', 'Nei', 'Planlegger', 'Innvilget', 'Ukjent'
#V3: [0,1,2,3,9] ["Nei","Ja","Planlegger","Innvilget","Ikke utfylt"]
grtxt <- c('Nei', 'Ja', 'Planlegger', 'Innvilget', 'Ikke utfylt')
#RegData$VariabelGr <- 9
#indDum <- which(RegData$ErstatningPre %in% 1:4)
#RegData$VariabelGr[indDum] <- RegData$ErstatningPre[indDum]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$ErstatningPre, levels = c(0:3,9))
tittel <- 'Har pasienten søkt erstatning?'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$ErstatningPre %in% 0:3), ]
RegData$Variabel[which(RegData$ErstatningPre %in% c(1,2))] <- 1
tittel <- 'Pasienten har søkt/planlegger å søke erstatning'
varTxt <- 'som har søkt erstatning'
sortAvtagende <- FALSE}
}
if (valgtVar %in% c('fornoydhet', 'fornoydhet3mnd', 'fornoydhet12mnd')) { #fordeling, AndelGrVar
#3/12mndSkjema. Andel med helt Fornøyd (1)
#Kode 1:5,9: 'Fornøyd', 'Litt fornøyd', 'Verken eller', 'Litt misfornøyd', 'Misfornøyd', 'Ukjent')
tittel <- paste('Fornøydhet', ktrtxt)
datoTil <- min(datoTil, as.Date(Sys.Date()-trekkfraDager))
RegData$Fornoyd <- switch(as.character(ktr),
'1'= RegData$Fornoyd3mnd,
'2'= RegData$Fornoyd12mnd)
grtxt <- c('Fornøyd', 'Litt fornøyd', 'Verken eller', 'Litt misfornøyd', 'Misfornøyd', 'Ukjent')
RegData$VariabelGr <- 9
indDum <- which(RegData$Fornoyd %in% 1:5)
RegData$VariabelGr[indDum] <- RegData$Fornoyd[indDum]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$VariabelGr, levels = c(1:5,9))
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$Fornoyd %in% 1:5), ]
RegData$Variabel[which(RegData$Fornoyd %in% 1:2)] <- 1 #
tittel <- paste0('Fornøyde pasienter', ktrtxt)
}
}
if (valgtVar=='hovedInngrep'){ #fordeling
tittel <- 'Hovedinngrep'
# grtxt <- c('Udefinerbart', 'Prolapskirurgi', 'Foramenotomi', 'Laminektomi',
# 'Interspin. implantat', 'Fusjonskirurgi', 'Skiveprotese', 'Rev. av implantat')
grtxt <- c('Udefinerbart', 'Prolapskirurgi', 'Dekompresjon', 'Laminektomi', 'Eksp. intersp impl.',
'Fusjonskirurgi', 'Deformitet', 'Rev. av implantat', 'Skiveprotese')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$HovedInngrep, levels = 0:8)
retn <- 'H'
}
if (valgtVar=='inngrep'){ #fordeling
tittel <- 'Inngrepstyper'
grtxt <- c('Andre inngrep', 'Prolaps mikro', 'Prolaps åpen', 'Midtlinjebev. dekomp.',
'Laminektomi', 'Eksp. intersp impl.', 'PLF', 'PLIF', 'TLIF', 'ALIF', 'XLIF',
'Udefinert fusjon', 'Osteotomi/deform.', 'Revisjon', 'Skiveprotese')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$InngrepV2V3, levels = 0:14)
retn <- 'H'
}
if (valgtVar=='komorbiditet') {
tittel <- 'Komorbiditet'
retn <- 'H'
flerevar <- 1
RegData <- RegData[which(RegData$OpDato >= '2019-01-01'), ]
# variableV2 <- c('SykdAndreRelevanteSykdBechtrew', 'SykdAnnenendokrin', 'SykdAnnenreumatisk',
# 'SykdCerebrovaskular', 'SykdDepresjonAngst', 'SykdHjertekar', 'SykdHoftekneartose',
# 'SykdHypertensjon', 'SykdKreft', 'SykdKroniskLunge', 'SykdKroniskNevrologisk',
# 'SykdKroniskSmerterMuskelSkjelettsyst', 'SykdOsteoporose', 'SykDprebetesMellitus',
# 'SykdReumatoidartritt', 'SykdVaskularClaudicatio', 'Sykd')
variable <- c('SykdAndreRelevanteSykdBechtrew', 'SykdAnnenendokrin', 'SykdAnnenreumatisk',
'SykdCerebrovaskular', 'SykdDepresjonAngst', 'SykdHjertekar', 'SykdHoftekneartose',
'SykdHypertensjon', 'SykdKreft', 'SykdKroniskLunge', 'SykdKroniskNevrologisk',
'SykdOsteoporose', 'SykdOsteoporoseBrudd', 'SykDprebetesMellitus', #'SykdKroniskSmerterMuskelSkjelettsyst',
'SykdPolynevropati', 'SykdProstatisme',
'SykdReumatoidartritt', 'SykdVaskularClaudicatio', 'SykdGeneralisertSmSyndr',
'Sykd')
grtxt <- c('Bechterew', 'Endokrin', 'Reumatisk',
'Cerebrovaskulær', 'Depresjon/Angst', 'Hjerte-kar', 'Hoftekneartose',
'Hypertensjon', 'Kreft', 'Lungesykd.', 'Nevrologisk sykd.',
'Osteoporose', 'Osteoporosebrudd', 'Diabetes Mell.', #'Muskel-/skjelettsm.',
'Polynevropati', 'Prostatisme',
'Reumatoid artritt', 'Vask. Claudicatio', 'Gen.smertesyndrom',
'Tot. Komorb.')
cexgr <- 0.9 #Kan endres for enkeltvariable
}
if (valgtVar=='komplPer') { #fordeling
tittel <- 'Peroperative komplikasjoner'
retn <- 'H'
flerevar <- 1
#NB <- '(Komplikasjoner rapporteres kun f.o.m. 2010)'
variable <- c('PeropKompDura', 'PeropKompFeilnivSide', 'PeropKompNerve', 'PeropKompTransfuBlodning',
'PeropKompKardio','PeropKompFeilplassImp','PeropKompResp','PeropKompAnafy')
grtxt <- c('Durarift', 'Operert feil nivå/side', 'Nerveskade', 'Transfusjonskrevende blødning',
'Kardiovaskulær komplikasjon', 'Feilplassert implantat', 'Respiratorisk komplikasjon', 'Anafylaksi')
}
if (valgtVar=='komplPost') {
tittel <- 'Pasientrapporterte komplikasjoner'
datoFra <- max(datoFra, '2020-01-01')
datoTil <- min(datoTil, as.character(Sys.Date()-90))
retn <- 'H'
flerevar <- 1
variable <- c('KpInfOverfla3mnd','KpInfDyp3mnd', 'KpUVI3mnd', #'KpMiktProb3mnd',
'KpLungebet3mnd', 'KpBlod3mnd','KpDVT3mnd','KpLE3mnd', 'Kp3mnd')
grtxt <- c('Overfl. sårinf. (mangelfull reg. 2019)', 'Dyp sårinfeksjon',
'Urinveisinfeksjon', 'Pneumoni', #'Problem, vannlatning/avføring',
'Transf./opr. pga. blødning', 'DVT','Lungeemboli', 'Postop. kompl. totalt') #'Tot. komplikasjoner'
#Andel kun av de som har svart på 3 mnd ktr:
RegData <- RegData[which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1), ]
indNA <- which(rowSums(is.na(RegData[ ,variable])) == length(variable))
if (length(indNA)>0){ #Fjerner rader hvor alle Kp-variabler er NA
RegData <- RegData[-indNA, ] }
}
if (valgtVar == 'kp3mnd') { #AndelGrVar
#Komplikasjoner 0:nei, 1:ja
#ind <- which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1)
#RegData <- RegData[ind, ]
variable <- c('KpInfOverfla3mnd','KpInfDyp3mnd', 'KpUVI3mnd', #'KpMiktProb3mnd',
'KpLungebet3mnd', 'KpBlod3mnd','KpDVT3mnd','KpLE3mnd')
indNA <- which(rowSums(is.na(RegData[ ,variable])) == length(variable))
if (length(indNA)>0){ #Fjerner rader hvor alle Kp-variabler er NA
RegData <- RegData[-indNA, ] }
RegData$Variabel[rowSums(RegData[ ,variable], na.rm = T) > 0] <- 1
VarTxt <- 'tilfeller'
tittel <- 'Pasientrapporterte komplikasjoner (%)'
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar == 'kpInf3mnd') { #AndelGrVar, AndelTid
#Komplikasjoner 0:nei, 1:ja
#Antar at de som ikke har fylt ut ikke har hatt infeksjon
RegData <- RegData[which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1), ]
RegData$Variabel[rowSums(RegData[ ,c('KpInfOverfla3mnd', 'KpInfDyp3mnd')], na.rm = T) > 0] <- 1
indIkkeSaarInf <- which(RegData$OpDato >= '2019-01-01' & RegData$OpDato <= '2021-12-31')
RegData$Variabel[indIkkeSaarInf] <- NA
VarTxt <- 'tilfeller'
tittel <- paste0('Sårinfeksjon, pasientrapportert', ktrtxt)
sortAvtagende <- FALSE
xAkseTxt <- 'Andel sårinfeksjoner (%)'
# if (hovedkat == 1) {KImaalGrenser <- c(0,2,100)}
# if (hovedkat == 5) {KImaalGrenser <- c(0,3,100)}
# if (hovedkat == 9) {KImaalGrenser <- c(0,3,100)}
}
if (valgtVar == 'kpInfOverfl') { #AndelGrVar, AndelTid
#Lena: Tilpass ktr
#Komplikasjoner 0:nei, 1:ja
ind <- switch(as.character(ktr),
'1' = which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1),
'2' = which(RegData$Ferdigstilt1b12mnd == 1))
RegData <- RegData[ind, ]
RegData$Variabel[RegData$KpInfOverfla3mnd==1] <- 1
indIkkeSaarInf <- which(RegData$OpDato >= '2019-01-01' & RegData$OpDato <= '2021-12-31')
RegData$Variabel[indIkkeSaarInf] <- NA
VarTxt <- 'tilfeller'
tittel <- paste0('Overfladisk sårinfeksjon, pasientrapportert', ktrtxt)
sortAvtagende <- FALSE
xAkseTxt <- 'Andel sårinfeksjoner (%)'
#KImaalRetn <- 'lav'
if (hovedkat == 1) {KImaalGrenser <- c(0,2,100)}
if (hovedkat == 5) {KImaalGrenser <- c(0,3,100)}
if (hovedkat == 9) {KImaalGrenser <- c(0,3,100)}
}
if (valgtVar=='liggedogn') {#fordeling, gjsnGrVar, andeler, gjsnTid
#liggedogn
#For opphold registrert som dagkirurgi uten at liggedogn er reg., settes liggedogn=0
tittel <- 'Total liggetid ved operasjon'
dagind <- which( (is.na(RegData$Liggedogn) | is.nan(RegData$Liggedogn)) & RegData$Dagkirurgi==1)
RegData$Liggedogn[dagind]<-0
RegData <- RegData[which(RegData$Liggedogn>=0),]
RegData$Variabel <- RegData$Liggedogn #gjsnGrVar
gr <- c(0:7,100)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$Liggedogn, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- c(0:6, '7+')
xAkseTxt <- 'Antall liggedøgn' #(subtxt
subtxt <- 'døgn'
if (figurtype=='gjsnGrVar') {tittel <- 'total liggetid'}
sortAvtagende <- 'F'
TittelVar <- 'Total liggetid ved operasjon'
ytxt1 <- 'liggetid'
KIekstrem <- c(0, 20)
}
if (valgtVar=='liggetidPostOp') {#fordeling, gjsnGrVar, gjsnTid
#liggedogn
#For opphold registrert som dagkirurgi uten at liggedogn er reg., settes liggedogn=0
tittel <- 'Liggetid etter operasjon'
RegData <- RegData[which(RegData$OpDato >= '2019-01-01'), ]
dagind <- which( (is.na(RegData$LiggetidPostOp) | is.nan(RegData$LiggetidPostOp)) & RegData$Dagkirurgi==1)
RegData$LiggetidPostOp[dagind]<-0
RegData <- RegData[which(RegData$LiggetidPostOp>=0),]
RegData$Variabel <- RegData$LiggetidPostOp #gjsnGrVar
gr <- c(0:7,100)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$LiggetidPostOp, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- c(0:6, '7+')
xAkseTxt <- 'Antall liggedøgn' #(subtxt
subtxt <- 'døgn'
if (figurtype=='gjsnGrVar') {tittel <- 'liggetid etter operasjon'}
sortAvtagende <- 'F'
TittelVar <- 'Liggetid etter operasjon'
ytxt1 <- 'liggetid'
KIekstrem <- c(0, 20)
}
if (valgtVar %in% c('misfornoyd', 'misfornoyd3mnd', 'misfornoyd12mnd')) { #AndelGrVar #%in% c('Misfor3mnd','Misfor12mnd')) { #AndelGrVar
#3/12mndSkjema. Andel med Misfornøyd/litt misfornøyd (1,2)
#Kode 1:5,9: 'Fornøyd', 'Litt fornøyd', 'Verken eller', 'Litt misfornøyd', 'Misfornøyd', 'Ukjent')
RegData$Misfornoyd <- switch(as.character(ktr),
'1'= RegData$Fornoyd3mnd,
'2'= RegData$Fornoyd12mnd)
RegData <- RegData[which(RegData$Misfornoyd %in% 1:5), ]
RegData$Variabel[which(RegData$Misfornoyd %in% 4:5)] <- 1
tittel <- paste0('Misfornøyde pasienter' ,ktrtxt)
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar == 'morsmal') { #fordeling AndelGrVar, AndelTid
grtxt <- c('Norsk', 'Samisk', 'Annet', 'Ikke utfylt')
tittel <- 'Morsmål'
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$Morsmal, levels = c(1:3,9))
if (figurtype %in% c('andelTid', 'andelGrVar')) {
RegData <- RegData[which(RegData$Morsmal %in% 1:3), ]
RegData$Variabel[which(RegData$Morsmal %in% 2:3)] <- 1
tittel <- 'Fremmedspråklige (ikke norsk som morsmål)'
varTxt <- 'fremmedspråklige'
sortAvtagende <- F}
}
if (valgtVar %in% c('nytte', 'nytte3mnd', 'nytte12mnd')) { #fordeling, AndelGrVar
#Andel med helt bra/mye bedre (1:2)
#Kode 1:7: ''Helt bra', 'Mye bedre', 'Litt bedre', 'Uendret', 'Litt verre', 'Mye verre',
# 'Verre enn noen gang', 'Ukjent')
tittel <- c('Hvilken nytte har du hatt av operasjonen?',ktrtxt)
RegData$Nytte <- switch(as.character(ktr),
'1'=RegData$Nytte3mnd,
'2'=RegData$Nytte12mnd)
datoTil <- min(datoTil, Sys.Date()-trekkfraDager)
retn <- 'H'
RegData$VariabelGr <- 9
indDum <- which(RegData$Nytte %in% 1:7)
RegData$VariabelGr[indDum] <- RegData$Nytte[indDum]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$VariabelGr, levels = c(1:7,9))
grtxt <- c('Helt bra', 'Mye bedre', 'Litt bedre', 'Uendret', 'Litt verre', 'Mye verre',
'Verre enn noen gang', 'Ukjent')
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$Nytte %in% 1:7), ]
RegData$Variabel[RegData$Nytte %in% 1:2] <- 1
tittel <- paste0('Helt bra eller mye bedre' , ktrtxt)
}}
if (valgtVar=='opInd') { #fordeling
tittel <- 'Operasjonsindikasjon'
retn <- 'H'
flerevar <- 1
variable <- c('OpIndCauda', 'OpIndParese') #, 'OpIndSme')
grtxt <- c('Cauda equlina', 'Parese')# , 'Smerter')
}
if (valgtVar == 'opIndPareseGrad') {#fordeling
tittel <- 'Operasjonsindikasjon, paresegrad'
grtxt <- c(0:5, 'Ukjent')
RegData <- RegData[which(RegData$OpIndParese ==1),]
indDum <- which(RegData$OpIndPareseGrad %in% 0:5)
RegData$VariabelGr <- 9
RegData$VariabelGr[indDum] <- RegData$OpIndPareseGrad[indDum]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$VariabelGr, levels = c(0:5,9))
}
if (valgtVar %in% c('oppf3mnd', 'oppf12mnd', 'oppf3og12mnd')) { #AndelGrVar
#Oppfølgingsskjema.
#"Ferdig1a", "Ferdig2a", "Ferdigstilt1b12mnd", "Ferdigstilt1b3mnd"
datoTil <- min(datoTil, Sys.Date()-trekkfraDager)
ind <- switch(valgtVar,
oppf3mnd = which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1),
oppf12mnd = which(RegData$Ferdigstilt1b12mnd==1),
oppf3og12mnd = which(RegData$Ferdigstilt1b3mnd==1 & RegData$Ferdigstilt1b12mnd==1 ))
RegData$Variabel[ind] <- 1
tittel <- paste0('Svart på oppfølging, ',
switch(valgtVar,
oppf3mnd = '3 mnd. etter',
oppf12mnd = '12 mnd. etter',
oppf3og12mnd = 'både 3 og 12 mnd. etter'))
sortAvtagende <- T
}
if (valgtVar == 'opKat') { #fordeling, andel øhjelp
#retn <- 'H'
tittel <- 'Operasjonskategori'
grtxt <- c('Elektiv', 'Akutt', '1/2-Akutt', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$OpKat, levels = c(1:3,9))
if (figurtype %in% c('andelTid', 'andelGrVar')) {
RegData <- RegData[which(RegData$OpKat %in% 1:3), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OpKat ==2)] <- 1
tittel <- 'Øyeblikkelig hjelp'
varTxt <- 'ø-hjelp'
sortAvtagende <- F}
}
if (valgtVar %in% c('OswEndr', 'OswEndr3mnd', 'OswEndr12mnd')) {
#Forbedring=lavere Oswestry
tittel <- paste0('forbedring av ODI', ktrtxt)
RegData$Variabel <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot3mnd),
'2'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot12mnd))
RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
KIekstrem <- c(-100, 100)
}
if (valgtVar %in% c('OswEndrPre', 'OswEndrPre3mnd', 'OswEndrPre12mnd')) { #Sammenligner endring og prescore
#Forbedring=lavere Oswestry
tittel <- paste0('forbedring av ODI', ktrtxt)
RegData$Variabel <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot3mnd),
'2'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot12mnd))
RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
KIekstrem <- c(-100, 100)
Xlab <- 'Oswestry før operasjon'
gr <- c(seq(0,90,10), 101)
RegData$Gr <- cut(RegData$OswTotPre, gr, right=F)
GrNavn <- levels(RegData$Gr)
GrNavn[length(GrNavn)] <- '[90,100]'
}
if (valgtVar == 'OswEndrLav') { #AndelGrVar
#Mislykkede operasjoner
RegData$OswEndr <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot3mnd),
'2'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot12mnd))
RegData <- RegData[which(RegData$OswEndr >= -100), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OswEndr <13)] <- 1
tittel <- paste0('Forbedring av Oswestry-skår < 13 poeng', ktrtxt)
sortAvtagende <- F
}
if (valgtVar %in% c('OswEndr20', 'OswEndr203mnd', 'OswEndr2012mnd')) { #AndelGrVar, andelTid
#Mislykkede operasjoner
RegData$OswEndr <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot3mnd),
'2'= (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot12mnd))
RegData <- RegData[which(RegData$OswEndr >= -100), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OswEndr >=20)] <- 1
varTxt <- 'med >20 poeng forbedring'
tittel <- paste0('Forbedring av Oswestry-skår >= 20 poeng', ktrtxt)
}
if (valgtVar %in% c('OswEndr30pst', 'OswEndr30pst3mnd', 'OswEndr30pst12mnd')) { #AndelGrVar, andelTid
#Andel med klinisk signifikant forbedring i Oswestry-skår.
#Forbedring = nedgang
RegData$OswPst <- switch(as.character(ktr),
'1' = (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot3mnd)/RegData$OswTotPre*100,
'2' = (RegData$OswTotPre - RegData$OswTot12mnd)/RegData$OswTotPre*100)
RegData <- RegData[which(RegData$OswPst>=-1000), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OswPst >=30)] <- 1
varTxt <- 'med \u2265 30 % forbedring'
tittel <- paste0('Minst 30% forbedring av Oswestry-skår', ktrtxt)
}
if (valgtVar %in% c('Osw22', 'Osw223mnd', 'Osw2212mnd')) { #AndelGrVar
#Andel med Oswestry-skår under 23 etter op.
RegData$OswPost <- switch(as.character(ktr),
'1' = RegData$OswTot3mnd,
'2' = RegData$OswTot12mnd)
RegData <- RegData[which(RegData$OswPost>=0), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OswPost <= 22)] <- 1
tittel <- paste0('Oswestry-skår < 23 poeng', ktrtxt)
}
if (valgtVar %in% c('Osw48', 'Osw483mnd', 'Osw4812mnd')) { #AndelGrVar
#Andel med Oswestry-skår fortsatt over 48.
RegData$OswPost <- switch(as.character(ktr),
'1' = RegData$OswTot3mnd,
'2' = RegData$OswTot12mnd)
RegData <- RegData[which(RegData$OswPost>=0), ]
RegData$Variabel[which(RegData$OswPost >48)] <- 1
tittel <- paste0('Oswestry-skår > 48 poeng', ktrtxt)
sortAvtagende <- F
}
if (valgtVar == 'OswTotPre') { #fordeling, gjsnBox, gjsnGrVar
RegData$Variabel <- RegData$OswTotPre
RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
tittel <- 'oswestryskår før operasjonen'
gr <- seq(0, 100, 10)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$Variabel, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- levels(RegData$VariabelGr)
xAkseTxt <- 'skår'
KIekstrem <- c(0, 100)
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar=='peropKomp') { #AndelGrVar
#Komplikasjoner ved operasjon
#Kode 1:Ja, tomme:Nei
RegData$Variabel[which(RegData$PeropKomp == 1)] <- 1
tittel <- 'Komplikasjoner ved operasjon'
varTxt <- 'med komplikasjoner'
sortAvtagende <- FALSE
}
if (valgtVar=='peropKompDura') { #AndelGrVar
#Durarift ved operasjon
#Kode 1:Ja, tomme:Nei
RegData$Variabel[which(RegData$PeropKompDura == 1)] <- 1
tittel <- 'Komplikasjon ved operasjon: Durarift'
sortAvtagende <- FALSE
xAkseTxt <- 'Andel durarift (%)'
varTxt <- 'med durarift'
# if (hovedkat == 1) {KImaalGrenser <- c(0,2,20)}
# if (hovedkat %in% c(5,9)) {KImaalGrenser <- c(0,3,20)}
}
if (valgtVar=='radUnders') { #fordeling
tittel <- 'Radiologisk undersøkelse'
retn <- 'H'
flerevar <- 1
variable <- c('RvCt', 'RvMr', 'RvRtgLscol', 'RvFunksjo') #'RvRadigr-it', 'RvDiscogr-ut', 'RvDpregblok',
grtxt <- c('CT', 'MR', 'Rtg.LS-columna', 'Fleks./Ekst.') #'Radikulografi-ut', 'Diskografi-ut', 'Diag.blokade'-finnes,
#variable <- c('RvCt', 'RvMr', 'RvRadigr', 'RvDiscogr', 'RvDpregblok', 'RvRtgLscol', 'RvFunksjo')
#grtxt <- c('CT', 'MR', 'Radikulografi', 'Diskografi', 'Diag.blokade', 'Rtg.LS-columna', 'Fleks./Ekst.')
}
if (valgtVar == 'regDiffOp') { #Andeler
#Verdier: 0-3402
tittel <- 'Tid fra utfylling av pasientskjema(?) til operasjon'
#if (figurtype == 'andeler') { #Fordelingsfigur
#14 dager, mellom 15 dager og 3 mnd, mer enn 3 mnd
gr <- c(-1000,-30, -14, 0, 15, 91, 2000)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$DiffUtfOp, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- c('<-30d', levels(RegData$VariabelGr)[2:(length(gr)-2)], '>3mnd')
subtxt <- 'dager fra operasjon til utfylling' #}
}
if (valgtVar == 'regForsinkelse') { #Andeler, GjsnGrVar
#Verdier: -2205 - 969
RegData <- RegData[which(RegData$DiffUtFerdig > -1), ]
tittel <- switch(figurtype,
andeler='Tid fra utskriving til ferdigstilt registrering',
andelGrVar = 'Mer enn 30 dager fra utskriving til ferdig registrering') #
subtxt <- 'døgn'
cexgr <- 0.9
xAkseTxt <- 'dager'
sortAvtagende <- FALSE
datoTil <- min(datoTil, Sys.Date()-trekkfraDager)
if (figurtype == 'andeler') { #Fordelingsfigur
gr <- c(seq(0,98,7), 2000)
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$DiffUtFerdig, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
#plot(RegData$VariabelGr)
grtxt <- c(1:14, '>3 mnd.')
subtxt <- 'innen gitte uker etter utskriving'
}
if (figurtype %in% c('andelTid', 'andelGrVar')) {
RegData$Variabel[which(RegData$DiffUtFerdig >90)] <- 1
tittel <- 'Registrert for sent for 3 mnd. oppfølging'
varTxt <- 'for sent registrert'
sortAvtagende <- F}
#KImaalGrenser <- c(0,3,10,100)
}
if (valgtVar=='roker') { #fordeling, AndelGrVar, #AndelTid
#PasientSkjema. Andel med Roker=1
#Kode 0,1,tom: Nei, Ja Ukjent
#V3: [0,1,2,9] ["Nei","Ja","Har røkt tidligere","Ikke utfylt"]
tittel <- 'Røyker du?'
if (figurtype == 'andeler'){
grtxt <- c("Nei","Ja","Har røkt tidligere","Ikke utfylt")
RegData <- RegData[which(RegData$RokerV3 %in% c(0:2,9)), ]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$RokerV3, levels = c(0:2,9))
}
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')){
# RegData <- RegData[which(RegData$RokerV3 %in% 0:2), ]
# RegData$Variabel[RegData$RokerV3==1] <- 1
RegData <- RegData[which(RegData$RokerV2 %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$RokerV2
tittel <- 'Røykere'
varTxt <- 'røykere'
sortAvtagende <- FALSE}
}
if (valgtVar == 'saardren') { #AndelGrVar
#LegeSkjema. Andel med Saardren=1
#Kode 0,1,tom: Nei, Ja Ukjent
grtxt <- c('Nei', 'Ja', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$Saardren, levels = c(0:1,9))
tittel <- 'Sårdren'
sortAvtagende <- F
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')){
RegData <- RegData[which(RegData$Saardren %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$Saardren
tittel <- 'Andel som får sårdren (%)'
}
}
if (valgtVar == 'sivilStatus') { #fordeling
tittel <- 'Sivilstatus'
#V2: grtxt <- c('Gift', 'Samboer', 'Enslig', 'Ukjent')
grtxt <- c('Gift/Samboer', 'Enslig', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$SivilStatusV3, levels = c(1:2,9))
}
if (valgtVar == 'smStiPreHypp') { #fordeling
tittel <- 'Hyppighet av smertestillende før operasjonen'
grtxt <- c('Sjeldnere', 'Månedlig', 'Ukentlig', 'Daglig', 'Flere ganger om dagen', 'Ikke utfylt') #'Oftere',
#RegData <- RegData[which(RegData$SmHyppPre %in% c(1:5, 9)), ]
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$SmHyppPre, levels = c(1:5,9))
retn <- 'H'
}
if (valgtVar %in% c('smBeinEndr', 'smBeinEndr3mnd', 'smBeinEndr12mnd')) {
tittel <- paste0('bedring av beinsmerter ',ktrtxt)
RegData <- RegData[which((RegData$SmBePre %in% 0:10) &
(RegData$SmBe3mnd %in% 0:10) & (RegData$SmBe3mnd %in% 0:10)), ]
RegData$Variabel <- switch(as.character(ktr),
'1'= (RegData$SmBePre - RegData$SmBe3mnd),
'2'= (RegData$SmBePre - RegData$SmBe12mnd))
#RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
KIekstrem <- c(-10,10)
}
if (valgtVar == 'smBePre') { #fordeling, gjsn
if (figurtype=='andeler'){
RegData$VariabelGr <- RegData$SmBePre
levels(RegData$VariabelGr) <- c(0:10,99)
grtxt <- c(as.character(0:10), 'Ikke utfylt')
tittel <- 'Beinsmerter før operasjon'
}
if (figurtype %in% c('gjsnBox', 'gjsnGrVar')){
RegData <- RegData[RegData$SmBePre %in% 0:10, ]
RegData$Variabel <- RegData$SmBePre
tittel <- 'beinsmerter før operasjonen'
}
xAkseTxt <- 'skår'
KIekstrem <- c(0, 10)
}
if (valgtVar == 'smBePreLav') { #AndelGrVar, AndelTid
#Lav beinsmerte og ingen parese. (Først og fremst prolaps)
RegData <- RegData[which(RegData$SmBePre %in% 0:10),]
RegData$Variabel[which((RegData$OpIndParese==0) & (RegData$SmBePre < 3.5))] <- 1
sortAvtagende <- F
tittel <- "Lite beinsmerter og ingen parese" #expression("Lite beinsmerter og ingen parese") #paste0('Beinsmerte ', expression(""<="3"), ' og ingen parese')
#intToUtf8(2264)
#KImaalRetn <- 'lav'
KImaalGrenser <- c(0,3,100)
varTxt <- 'med manglende indikasjon'
}
if (valgtVar %in% c('smRyggEndr', 'smRyggEndr3mnd', 'smRyggEndr12mnd')) {#gjsn
tittel <- paste0('forbedring av ryggsmerter', ktrtxt)
RegData <- RegData[which((RegData$SmRyPre %in% 0:10) &
(RegData$SmRy3mnd %in% 0:10) & (RegData$SmRy12mnd %in% 0:10)), ]
RegData$Variabel <- switch(as.character(ktr),
'1'= RegData$SmRyPre - RegData$SmRy3mnd,
'2'= RegData$SmRyPre - RegData$SmRy12mnd)
KIekstrem <- c(-10,10)
}
if (valgtVar == 'smRyggPre') { #fordeling, gjsn
if (figurtype=='andeler'){
RegData$VariabelGr <- RegData$SmRyPre
levels(RegData$VariabelGr) <- c(0:10,99)
grtxt <- c(as.character(0:10), 'Ikke utfylt')
tittel <- 'Ryggsmerter før operasjon'
}
if (figurtype %in% c('gjsnBox', 'gjsnGrVar')){
RegData <- RegData[RegData$SmRyPre %in% 0:10, ]
RegData$Variabel <- RegData$SmRyPre
tittel <- 'ryggsmerter før operasjonen'
}
}
if (valgtVar == 'smStiPre') { #fordeling, andelGrVar/Tid
tittel <- 'Bruk av smertestillende før operasjonen'
grtxt <- c('Nei', 'Ja', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$SmStiPre, levels = c(0:1,9))
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$SmStiPre %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$SmStiPre
varTxt <- 'som brukte smertestillende'
sortAvtagende <- F}
}
if (valgtVar %in% c('symptVarighRyggHof','sympVarighUtstr')) { #fordeling, andelGrVar/Tid
grtxt <- c('Ingen', '<3 mnd', '3-12 mnd', '1-2 år', '> 2 år', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(switch(valgtVar,
symptVarighRyggHof = RegData$SymptVarighRyggHof,
sympVarighUtstr = RegData$SympVarighUtstr),
levels = c(1:5,9)
)
tittel <- switch(valgtVar,
symptVarighRyggHof = 'Varighet av rygg-/hoftesmerter',
sympVarighUtstr = 'Varighet av utstrålende smerter'
)
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$VariabelGr %in% 1:5), ]
RegData$Variabel[which(RegData$VariabelGr %in% 4:5)] <- 1
varTxt <- 'med varighet minst 1 år'
tittel <- switch(valgtVar,
symptVarighRyggHof ='Varighet av rygg-/hoftesmerter minst ett år',
sympVarighUtstr = 'Varighet av utstrålende smerter minst ett år')
sortAvtagende <- F}
# if (valgtVar == 'sympVarighUtstr') {KImaalGrenser <- c(0,20,100)}
}
if (valgtVar == 'tidlOpr') {
tittel <- 'Tidligere ryggoperert?'
retn <- 'H'
grtxt <- c('Samme nivå', 'Annet nivå', 'Annet og sm. nivå', 'Primæroperasjon') #, 'Ukjent')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$TidlOpr, levels = c(1:4))
}
if (valgtVar=='tidlOprAntall') {
tittel <- 'Antall tidligere operasjoner'
gr <- c(-1:5, 1000)
RegData$Variabel <- -1
RegData$Variabel[RegData$TidlOpr==4] <- 0
indDum <- which(RegData$TidlOprAntall>-1)
RegData$Variabel[indDum] <- RegData$TidlOprAntall[indDum]
RegData$VariabelGr <- cut(RegData$Variabel, breaks=gr, include.lowest=TRUE, right=FALSE)
grtxt <- c('Ukjent', 0:4,paste0('5-', max(RegData$TidlOprAntall, na.rm=T)))
}
if (valgtVar == 'tidlOp3'){ #AndelTid, AndelGrVar
RegData$Variabel[RegData$TidlOprAntall>2] <- 1
varTxt <- 'med >2 tidl. operasjoner'
tittel <- 'Flere enn to tidligere operasjoner'
sortAvtagende <- F
}
if (valgtVar == 'trombProfyl') { #AndelGrVar, AndelTid
#Legeskjema
tittel <- 'Tromboseprofylakse gitt ifm. operasjon'
#if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')){
RegData <- RegData[which(RegData$PostopTrombProfyl %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$PostopTrombProfyl
varTxt <- 'fått tromboseprofylakse'
sortAvtagende <- F #}
}
if (valgtVar == 'trombProfylLettKI') { #AndelGrVar, AndelTid
#Legeskjema
#Spesifisering: (BlodfortynnendeFast = 0 & ASA grad< 3 & Kjønn = 1 (mann)) & (HovedInngrepV2V3=1 eller HovedInngrepV2V3=2)
#Mål: < landsgjennomsnittet høy måloppnåelse (grønt), ≥ landsgjennomsnittet moderat/lav (gult)
indUtv <- which((RegData$ASA<3) & (RegData$ErMann==1) & (RegData$HovedInngrepV2V3 %in% 1:2) & (RegData$BlodfortynnendeFast==0))
#(RegData$ErMann==1) & (RegData$HovedInngrepV2V3 %in% 1:2) er også hardkodet utvalg i andelsfigurene.
RegData <- RegData[indUtv,]
tittel <- 'Tromboseprofylakse gitt, ASA<3'
RegData <- RegData[which(RegData$PostopTrombProfyl %in% 0:1), ]
RegData$Variabel <- RegData$PostopTrombProfyl
varTxt <- 'fått tromboseprofylakse'
sortAvtagende <- F
KImaalGrenser <- 'landsgj'
}
if (valgtVar == 'tryggKir') { #fordeling, AndelGrVar, AndelTid
#Legeskjema. Andel med UforetrygdPre ja og planlegger. Innført V3
tittel <- 'Ble "trygg kirurgi"-prosedyre gjennomført?'
#retn <- 'H'
grtxt <- c('Nei', 'Ja, ved start', 'Ja, ved avslutning', 'Ja, start/avslutn.', 'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$SafeSurgery, levels = c(0:3,9))
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')){
RegData <- RegData[which(RegData$SafeSurgery %in% 0:3), ]
RegData$Variabel[which(RegData$SafeSurgery %in% c(1:3))] <- 1
varTxt <- 'trygg kirurgi'
KImaalGrenser <- c(0,95,100)
sortAvtagende <- T}
}
if (valgtVar == 'uforetrygdPre') { #fordeling, AndelGrVar, AndelTid
#PasientSkjema. Andel med UforetrygdPre ja og planlegger
#Kode V2 1:4,tom: 'Ja', 'Nei', 'Planlegger søknad', 'Innvilget', 'Ukjent')
#V3: [0,1,2,3,9] ["Nei","Ja","Planlegger å søke","Er allerede innvilget","Ikke utfylt"]
tittel <- 'Har pasienten søkt uføretrygd?'
#retn <- 'H'
grtxt <- c('Nei', 'Ja', 'Planlegger søknad', 'Innvilget', 'Ukjent')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$UforetrygdPre, levels = c(0:3,9))
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')){
RegData <- RegData[which(RegData$UforetrygdPre %in% 0:3), ]
RegData$Variabel[which(RegData$UforetrygdPre %in% c(1,2))] <- 1
varTxt <- 'søkt/planlagt å søke'
tittel <- 'Har søkt/planlegger å søke uføretrygd før op.'
sortAvtagende <- F}
}
if (valgtVar == 'utd') { #AndelGrVar, AndelTid
#PasientSkjema. Andel med Utdanning 4 el 5
#Kode V2 1:5,9: 'Grunnskole++, 7-10år','Real-, yrkes- el vg skole', 'Allmennfaglig vg skole',
#Høyskole/universitet, <4 år', 'Høyskole/universitet, 4år+', 'Ukjent'
#V3: [1,2,3,4,5,9] ["Grunnskole 7-10 år, framhaldsskole eller folkehøyskole",
grtxt <- c('Grunnskole, 7-10år','Real-, yrkes- el vg skole', #'Real-, yrkes-/yrkesfaglig vg skole',
'Allmennfaglig vg skole','Høyskole/universitet, <4 år','Høyskole/universitet, 4år+',
'Ikke utfylt')
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$Utd, levels = c(1:5,9))
retn <- 'H'
tittel <- 'Høyeste fullførte utdanning'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData$Variabel[which(RegData$Utd %in% 4:5)] <- 1
varTxt <- 'med høyere utdanning'
tittel <- 'Andel høyskole-/universitetsutdannede'
}}
if (valgtVar == 'ventetidHenvTimePol') { #Fordeling, AndelGrVar, AndelTid
grtxt <- c("< 3 mnd.","3-6 mnd","6-12 mnd.","> 12 mnd.","Ikke utfylt")
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$VentetidHenvTilSpesialist, levels = c(1:4,9))
retn <- 'H'
tittel <- 'Ventetid fra henvisning til time på poliklinikk'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$VentetidHenvTilSpesialist %in% 1:4),]
RegData$Variabel[which(RegData$VentetidHenvTilSpesialist == 1)] <- 1
varTxt <- 'ventet <3mnd'
tittel <- 'Ventetid < 3 mnd. fra henvisning til time på poliklinikk'
}}
if (valgtVar == 'ventetidSpesOp') { #Fordeling, AndelGrVar, AndelTid
grtxt <- c("< 3 mnd.","3-6 mnd","6-12 mnd.","> 12 mnd.","Ikke utfylt")
RegData$VariabelGr <- factor(RegData$VentetidSpesialistTilOpr, levels = c(1:4,9))
retn <- 'H'
tittel <- 'Ventetid fra operasjon bestemt til utført'
if (figurtype %in% c('andelGrVar', 'andelTid')) {
RegData <- RegData[which(RegData$VentetidSpesialistTilOpr %in% 1:4),]
RegData$Variabel[which(RegData$VentetidSpesialistTilOpr == 1)] <- 1
varTxt <- 'ventet <3mnd'
tittel <- 'Ventetid < 3 mnd. fra operasjon bestemt til utført'
KImaalGrenser <- c(0,50,80,100)
}}
if (valgtVar %in% c('verre', 'verre3mnd', 'verre12mnd')) { #AndelGrVar #%in% c('Verre3mnd','Verre12mnd')) {
#3/12mndSkjema. Andel med helt mye verre og noen sinne (6:7)
#Kode 1:7,9: ''Helt bra', 'Mye bedre', 'Litt bedre', 'Uendret', 'Litt verre', 'Mye verre',
# 'Verre enn noen gang', 'Ukjent')
RegData$Nytte <- switch(as.character(ktr),
'1'=RegData$Nytte3mnd,
'2'=RegData$Nytte12mnd)
RegData <- RegData[which(RegData$Nytte %in% 1:7), ]
RegData$Variabel[RegData$Nytte %in% 6:7] <- 1
tittel <- paste0('Mye verre/verre enn noen gang' , ktrtxt)
sortAvtagende <- F
}
RegData <- RegData[which(!is.na(RegData$Variabel)),]
#print(datoTil)
RegData <- RegData[RegData$InnDato < datoTil,]
UtData <- list(RegData=RegData, grtxt=grtxt, cexgr=cexgr, varTxt=varTxt, xAkseTxt=xAkseTxt,
KImaalGrenser=KImaalGrenser, KIekstrem=KIekstrem, #KImaal=KImaalRetn,
retn=retn, subtxt=subtxt, tittel=tittel, antDes=antDes,
flerevar=flerevar, variable=variable, sortAvtagende=sortAvtagende)
#RegData inneholder nå variablene 'Variabel' og 'VariabelGr'
return(invisible(UtData))
}
R Package Documentation
Browse R Packages
We want your feedback!
Note that we can't provide technical support on individual packages. You should contact the package authors for that.
Embedding an R snippet on your website
Add the following code to your website.
For more information on customizing the embed code, read Embedding Snippets.