README.md

In carzamora/espobis: Tools for Easy Check Quality Control

espobis

La idea de esta librería es facilitar más las tareas de revisar la calidad de los datos antes de subirlos a OBIS

Installation

Paso 1

Como esta librería depende de “obistools” y esa librería no se encuentra en CRAN, es necesario instalarla antes:

devtools::install_github("iobis/obistools")

Paso 2

Intentar instalar con:

devtools::install_github("carzamora/espobis")

Paso 3 (resolver problemas)

1) Si te aparece este error:

WARNING: Rtools is required to build R packages but is not currently installed. Please download and install the appropriate version of Rtools before proceeding:

https://cran.rstudio.com/bin/windows/Rtools/

Es posible que necesites instalar RTools, lo descargas e instalas del link anterior.

2) También, es posible que aparezca el error:

Error in loadNamespace(j \<- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]) : there is no package called ‘digest’

En ese caso necesitas instalar la librería “digest”

install.packages("digest")

Example

Por ejemplo, es posible determinar si los puntos de ocurrencia están en tierra. Marcando de verde los puntos sin problema y en rojo los que caen en tierra.

# load the package
library(espobis)
library(readxl)

Cargamos unos datos de muestra directamente desde un archivo de Excel

datos <- read_excel("proofs/occurrence.xlsx")
head(datos)

y mapeamos

mapOccur(datos)

carzamora/espobis documentation built on Nov. 4, 2019, 8:45 a.m.