R/nkbc-diag-klar-innan-op-06.R

In oc1lojo/nkbcind: Verktyg för kvalitetsindikatorer och populationskarakteristik från NKBC

#' @export
nkbc06 <- list(
  code = "nkbc06",
  kortnamn = "nkbc_diag_klar_innan_op_06",
  lab = c(
    sv = "Fastställd diagnos innan operation",
    en = "Definitive diagnosis before surgery"
  ),
  pop = c(
    sv = "opererade fall utan fjärrmetastaser vid diagnos",
    en = "operated cases without distant metastasis at diagnosis"
  ),
  filter_pop = function(x, ...) {
    dplyr::filter(
      x,
      # Enbart opererade fall
      !is.na(op_kir_dat),

      # Ej fall med fjärrmetastaser vid diagnos
      !(a_tnm_mklass_Varde %in% 10)
    )
  },
  mutate_outcome = function(x, ...) {
    dplyr::mutate(x,
      outcome = dplyr::case_when(
        a_diag_preopmorf_Varde == 0L ~ FALSE,
        a_diag_preopmorf_Varde == 1L ~ TRUE,
        a_diag_preopmorf_Varde == 98L ~ NA
      )
    )
  },
  target_values = c(85, 90),
  period_dat_var = "op_kir_dat",
  sjhkod_var = "a_inr_sjhkod",
  other_vars = c("a_pat_alder", "d_invasiv"),
  om_indikatorn = list(
    sv = "En fastställd diagnos innan behandlingsstart är viktigt för planering och genomförande av behandling och undvikande av omoperationer.",
    en = "A definitive diagnosis before starting treatment is important for planning and implementing treatment and avoiding reoperations."
  ),
  vid_tolkning = list(
    sv = paste(
      "För att undvika alltför långa utredningstider kan det ibland vara nödvändigt att operera patienten innan diagnosen är helt fastställd.",
      "Fastställd diagnos måste vägas mot tidsåtgång."
    ),
    en = paste(
      "To reduce patients’ waiting time, it may sometimes be necessary to perform surgery before the diagnosis is fully established."
    )
  ),
  teknisk_beskrivning = NULL
)
class(nkbc06) <- c("keynkbcind", "nkbcind")