other/spell_check.R

In ropensci/phylotaR: Automated Phylogenetic Sequence Cluster Identification from 'GenBank'

ignore <- c('Args',
            'BLASTed',
            'BLASTing',
            'blastn',
            'cid',
            'clade',
            'ClstrArc',
            'ClstrRec',
            'ClstrRecs',
            'dfln',
            'dir',
            'downloader',
            'Downloader',
            'Entrez',
            'fasta',
            'gbwithparts',
            'GC',
            'GenBank',
            'hrdmx',
            'HSP',
            'HSPs',
            'lgfl',
            'makeblastdb',
            'mdlthrs',
            'MRCA',
            'mxsqs',
            'nm',
            'nucleotides',
            'orthologous',
            'Outfile',
            'paraphyletic',
            'paraphyly',
            'phylota',
            'Phylota',
            'rawToChar',
            'rentrez',
            'retmax',
            'retstart',
            'rnk',
            'SeqArc',
            'seqrec',
            'SeqRec',
            'SeqRecs',
            'sid',
            'sids',
            'stderr',
            'stdout',
            'str',
            'TaxDict',
            'taxids',
            'taxise',
            'TaxRec',
            'TreeMan',
            'treemap',
            'Treemaps',
            'txdct',
            'TxDct',
            'txid',
            'txids',
            'wd',
            'PhyLoTa',
            'REGEX',
            'res',
            'seq',
            'un')
devtools::spell_check(ignore = ignore, dict = 'en_GB')