In walmes/EACS: Estatística Aplicada à Ciência do Solo

Estatística Aplicada à Ciência do Solo

Organização

O EACS é um pacote não oficial para o software R. O pacote contém conjuntos de dados documentados e relatórios que exibem a análise dos dados. Veja na seção Uso do Pacote como acessar o conteúdo do pacote e na seção Instalação como instalar.

A documentação online do pacote está disponível no endereço: http://leg.ufpr.br/~walmes/pacotes/EACS. O código fonte está público no GitHub: https://github.com/walmes/EACS.

Instalação

O pacote pode ser instalado diretamente do repositório em que está hospedado no GitHub (https://github.com/walmes/EACS). Para isso é necessário ter o pacote devtools. Com ele, execute o código abaixo em uma sessão R.

# Carrega o devtools.
library(devtools)

# Instala do GitHub (estável)
install_github(repo =  "walmes/EACS", ref = "master")

Caso não consiga instalar o pacote, tente fazer a partir dos aquivos comprimidos listados abaixo. Se você usa Windows, use o zip, se Linux use o tar.gz. O código abaixo mostra como fazer a instalação. Substitua x.y-z pela versão do pacote conforme está no nome dos arquivos.

# setwd("./docs")
invisible(file.copy(from = list.files(pattern = "EACS_"),
                    to = "./docs",
                    overwrite = TRUE))
fls <- dir(path = ".",
           pattern = "*.(zip|tar\\.gz)$",
           full.names = TRUE)
if (length(fls) > 0) {
    bn <- basename(path = fls)
    cat(sprintf("  * [`%s`](./%s)", bn, bn), sep = "\n")
}

# Instalando a partir do tarball (Linux).
install.packages(pkgs = "EACS_x.y-z.tar.gz",
                 repos = NULL,
                 type = "source")

# Instalando a partir do zip (Windows).
install.packages(pkgs = "EACS_x.y.z.zip",
                 repos = NULL,
                 type = "source")

Lembre-se de apontar o diretório de trabalho para o local onde está o arquivo baixado (use setwd()) ou forneça o caminho completo para o arquivo. Instalar o pacote pelos arquivos comprimidos não instala as dependências do pacote. Portanto, na hora de usá-lo pode faltar algo. Para evitar isso, antes de instalar, procure instalar todos os pacotes que são dependências para o EACS. Eles são listados no arquivo DESCRIPTION.

# setwd("./docs")
fls <- list.files(path = "./EACS.Rcheck",
                  "EACS-manual.pdf",
                  full.names = TRUE)
if (length(fls)) {
    invisible(file.copy(fls, to = "./docs", overwrite = TRUE))
    txt <- sprintf(paste(
        "## Manual em PDF\n\n",
        "O manual em PDF do pacote está disponível para",
        "baixar: [`%s`](./%s)."),
        basename(fls),
        basename(fls))
    cat(txt, "\n")
}

Tour pelo pacote

O código abaixo permite que fazer um tour pelo pacote EACS.

# Carrega o pacote.
library(EACS)

# Lista os objetos do pacote.
ls("package:EACS")

# Abre a documentação do pacote.
help(package = "EACS", help_type = "html")

# Mostra as vinhetas disponíveis.
browseVignettes(package = "EACS")

# Abre alguma vinheta.
vignette(topic = "vignette_name_here", package = "EACS")

# Cita o pacote.
citation("EACS")

Uso dos dados

As análises e dados no pacote EACS foram feitos para serem de livre acesso. No entanto, todo e qualquer uso dos dados, científico ou não, que gere publicações tais como, mas não se limitando a, artigos, trabalhos em congressos, materias de blog e material didático devem ter o consentimento dos seus proprietários. Entendemos que os dados gerados pelas pesquisas com financiamentos governamentais devem ser públicos, mas o pesquisador responsável pela pesquisa tem precedência sobre o uso dos dados em respeito à sua dedicação.

Deseja-se ao fornecer acesso aos dados 1) gerar exemplos de análise que possam servir de base para outras pesquisas e 2) estimular pesquisas inovadoras de metodologia estatística a partir dos dados.

Os dados no pacote EACS se tornam públicos antes das publicações que irão utilizá-los, já que as análises feitas neste pacote são justamente para gerar os resultados que serão apresentados nas publicações.

walmes/EACS documentation built on Sept. 8, 2020, 12:50 p.m.