R/synDss-internal.R

In synDss: Recombination detection using synonymous distances

.Random.seed <-
c(403L, 1L, 1753296752L, -1316854002L, 538460537L, 1274762507L, 
-549859782L, -1253382852L, -2047038849L, 356463061L, 1846333420L, 
-1823641278L, -1131303267L, 292416279L, -1072309634L, 125438520L, 
-5845733L, 1695791737L, 1966765768L, -679375114L, -1800059087L, 
-1899913373L, -617777870L, -210483580L, 31150791L, 983069085L, 
665171220L, -1750115398L, -1344328187L, 124211167L, -1314789786L, 
1194660336L, -1065664749L, -99680079L, 750044000L, 1590219006L, 
-67542903L, 650260411L, 2003409290L, 1585080428L, -944813585L, 
1720156709L, 338187996L, -753513294L, -427360339L, -181017753L, 
-1363206002L, -1884160664L, -155329173L, -144822519L, -530087528L, 
1109969094L, 926784033L, 581313203L, 379269154L, -590353900L, 
1807232663L, 1649852557L, 1617278372L, 146241418L, -605998091L, 
1667447375L, -1381679786L, -590792704L, 1067673923L, 2025432289L, 
2133147216L, -1950276946L, -1006049703L, -1944867221L, 1701708762L, 
1443337372L, -116818273L, -1307323147L, 247960972L, 1449398370L, 
1243054141L, 1252686519L, -1395695266L, 462243992L, 1097470971L, 
1433559449L, -596188632L, 1594725078L, -1387964591L, 1177393667L, 
-1693676142L, -510846172L, 994475495L, -101721539L, -302173004L, 
-1397755110L, -264546203L, 49942783L, 2102681990L, -102574320L, 
80720819L, -441356207L, -1549401088L, -636255010L, -1422690519L, 
69651163L, -1614585366L, 1341426060L, 545566415L, -200306043L, 
1938319676L, -1696082926L, -1449444595L, 622929991L, 1949633070L, 
1314796424L, 469589643L, -1061318551L, -1707836360L, -890565402L, 
-2141719423L, 1083221011L, -1090407486L, -2118833036L, 1798496887L, 
862567277L, -274678780L, 285308714L, 1232569493L, 1477751599L, 
1969873462L, -1044646304L, 37676195L, -380440639L, 1237822384L, 
-128938290L, -1515246535L, -1734430133L, -197580806L, -1842683140L, 
-1205377217L, 485591061L, -43730132L, -1866330110L, -752469283L, 
-639491625L, 1099082942L, -1106073864L, -1677814565L, 737560377L, 
1159164552L, 90183222L, 884311665L, -507153245L, 362249714L, 
-1799205564L, -982340089L, -427308067L, 12788948L, 1062894586L, 
-498316475L, 1575358367L, -2043640538L, -1845457488L, -1304951213L, 
690651505L, -1378277216L, -923658178L, 1803300681L, 280434171L, 
-1059399222L, 1943361324L, -1923602641L, -1222957595L, 966551708L, 
-166912782L, 697390445L, -166882649L, -1806549810L, -466038232L, 
1457357355L, -2080511927L, -741861032L, 1118314502L, 1946218977L, 
1173683059L, 75911138L, 1925793620L, -1458501033L, -1445344691L, 
-1658130972L, 1785137098L, 448694837L, 1886867599L, 779424150L, 
913755456L, -1593409533L, -1200438751L, -440695536L, 741460718L, 
1230468761L, 822523691L, 897741338L, -1742008100L, -520598305L, 
-449512779L, 817261644L, 1120301218L, 124366845L, 627723511L, 
-262096354L, -730213160L, -620525509L, 726462937L, 1991583592L, 
1720658582L, 314594321L, 506086851L, -323892782L, -82263964L, 
-1633812569L, 2060734717L, 1986626804L, -21355558L, -456616155L, 
-405627329L, -2074393146L, 982557264L, -1034224013L, 1152479889L, 
-1778881856L, 311102622L, -819928983L, -1631726872L, -208378676L, 
-1266471428L, 906615282L, 1064171136L, -1625225740L, 258028168L, 
2090633018L, -396959920L, -184578964L, 1002900884L, 2101587026L, 
418380256L, 1954657484L, 1318072480L, 1411721602L, -301860632L, 
-1950719252L, 1588499772L, -342045582L, 1042392176L, -647959516L, 
-1325064136L, 1349380890L, -996041520L, -1353196740L, 148645780L, 
108900226L, 149829056L, 1535394364L, 377420176L, -919995870L, 
-1640010488L, 26131084L, 734844700L, 1615474834L, -1377951360L, 
1647837716L, 1437115176L, 1517381178L, -230041136L, -1940974228L, 
1114993588L, -1808147438L, 1657491936L, -2082511924L, 519188704L, 
-2073450462L, 1695571240L, 886191628L, -359832772L, 263345138L, 
-607355152L, -1306703292L, -1548816808L, 1400361786L, -531033616L, 
553418428L, 506305812L, 1068555970L, 1216061536L, -1727518852L, 
-1357882416L, 1806179618L, -2092030296L, -1547826292L, 1359805628L, 
-1190107342L, -1828949440L, 2030393524L, 901925448L, -312574534L, 
-1143492080L, 1892097772L, -708645548L, 722023698L, 2142304672L, 
1293622988L, -1753495968L, 332231618L, 1748304680L, 1968569260L, 
2079084348L, 1687829874L, 1241968432L, -1057131228L, -925836488L, 
-1000735014L, 2069349264L, -432465156L, 665588628L, 1408634946L, 
-415244032L, -1982262212L, -1237875376L, -1994891102L, 278879560L, 
-1501578484L, 1401225948L, 2128036178L, 96493696L, 1978502228L, 
-1465795608L, -1929669382L, -1396932784L, -480522452L, 1423080820L, 
1037983634L, -1740604320L, 1895880076L, -196768928L, -450583070L, 
466494376L, -890560308L, 2010397692L, 440553906L, 16899568L, 
-1779482684L, -1058283176L, 2137617786L, 60506032L, 906581436L, 
-1650170796L, 1406896066L, -1007994848L, -977876804L, -1298213296L, 
-974393374L, -1517881240L, -1209458612L, 145278204L, -1757161486L, 
891047168L, -1730415244L, 971401224L, 79983546L, 954033616L, 
-99454996L, 1431113108L, -1580295726L, -1582923424L, -1750668468L, 
436107552L, 1147647874L, -305297688L, 1392398572L, -1752369092L, 
-835244174L, -1022235024L, -616965084L, 2018465592L, -607468390L, 
-704036144L, 1703987388L, 1240917652L, 483364482L, 366995648L, 
-1927209156L, 1609547920L, 1327957538L, 1154878472L, -1511953140L, 
-120652644L, 568607250L, 181359488L, 924997140L, 1380140584L, 
-968577734L, -859425328L, -738123668L, -1343785676L, -1069907310L, 
189081440L, -1967497396L, -1563918368L, -1450660958L, 847641512L, 
611752332L, -1000811332L, 1196761458L, -266313488L, 537501764L, 
1197305176L, -247520710L, 1460629360L, 862821436L, -1328129260L, 
1532081602L, -630577440L, 588411772L, 1168069328L, -1459592030L, 
1299564584L, 1494505740L, -618388548L, 333042994L, -897642048L, 
-641871308L, 158803912L, -1148693318L, -163317360L, 1599939052L, 
-1213329836L, 1967180946L, 865794848L, -1999867444L, 1507855840L, 
1766055618L, -1256882136L, 534949548L, -1687473988L, 658978290L, 
239021360L, -368126812L, 1709773496L, 1993214298L, -1909493360L, 
-733347972L, 434256148L, -1375600830L, 652648192L, 1246913468L, 
1793592144L, 1225076514L, 856999240L, 1276577292L, 1814540380L, 
-256878943L, 1045395302L, -457215644L, -1029655403L, 536124863L, 
379953496L, 2127073142L, -1006289533L, -515516475L, 699747554L, 
50239824L, -266008455L, 1355041707L, -1730178788L, 2120652362L, 
-271969729L, -1360992631L, 327389854L, 734629708L, 683910941L, 
1410516647L, 1248480720L, -558410386L, -1101658085L, -1482987139L, 
1543696234L, 2046540296L, -501006671L, 393255203L, -818542044L, 
542908626L, 672340263L, -1135160463L, -212557386L, 1570707796L, 
-375433243L, -1331699217L, -1373912L, 1573593478L, -1954959949L, 
-608866027L, 1240302450L, 1016016832L, 1284538409L, 375233691L, 
142285164L, 466882938L, 766943919L, 1855502777L, -116268082L, 
-1970103524L, -2014727539L, -1213039881L, 540110336L, -1076066210L, 
-1230019797L, -483348435L, -1017177958L, 1381157976L, -321348671L, 
2038838387L, 1017585044L, -243948510L, -1220570313L, -691128831L, 
867718918L, 1044769604L, 196025973L, -1275207713L, -775556296L, 
339137814L, 1208985891L, -1171991835L, -1526088958L, -887025296L, 
-24954599L, 1521252619L, -1089136132L, -723766742L, -470441377L, 
2043003369L, -1238529282L, 1547756268L, -898092483L, 2017513991L, 
157554160L, -1265666674L, 2120575931L, 121415069L, 1124977482L, 
152686440L, -903323311L, -224202173L, 1288992580L, -1507394574L, 
268595655L, 1917003665L, 1758686998L, 1057831796L, -1435221499L, 
468013647L, -1765274040L, -64442394L, 1847910675L, -1967174027L, 
1902199890L, 724569760L, -119903351L, -976701509L, -1933035508L, 
-462580326L, 1686213903L, 157981529L, 1474217454L, 1873608828L, 
-3095315L, 31052695L, 952257632L, -263344578L, -1862662389L, 
1708621197L, -1549089094L, -468507400L, -866078047L, -2103307693L, 
898608500L, -1420852478L, 1068180375L, -913570463L, 1045333414L, 
1574303652L, 176091733L, 1508115199L, 1865697176L, 900368566L, 
-59024061L, 1239776389L, 2140161314L, 732745232L, 771583417L, 
-1509872021L, 1520165212L, 1034737802L, -144437121L, -1073921591L, 
-642006434L, -478324468L, 484580573L, -1066493465L, 1066205712L, 
138223406L, 1669374939L, -1995344707L, -351508950L, 211393224L, 
-97222671L, 68301155L, 1538138468L, 1069434002L, -556566169L, 
1547803441L, 1201873014L, -10815084L, -499278427L, 1091065519L, 
-520392856L, 422527814L, 947450611L, -2007487403L, -1606305836L
)