Files in boettiger-lab/taxadb-cache
Backend for generating taxadb cache

.Rbuildignore
.github/.gitignore
.github/workflows/quarto.yml
.gitignore
DESCRIPTION
LICENSE
LICENSE.md
NAMESPACE
R/col.R R/duckdb-direct-read.R R/fb.R R/gbif.R R/helper-routines.R R/itis.R R/iucn.R R/ncbi.R R/ott.R R/redlist.R R/slb.R R/tpl.R README.Rmd README.md
data/2022/common_col/part-0.parquet
data/2022/common_col/part-1.parquet
data/2022/common_col/part-2.parquet
data/2022/common_gbif/part-0.parquet
data/2022/common_gbif/part-1.parquet
data/2022/common_gbif/part-2.parquet
data/2022/common_itis/part-0.parquet
data/2022/common_itis/part-1.parquet
data/2022/common_ncbi/part-0.parquet
data/2022/common_ncbi/part-1.parquet
data/2022/common_ncbi/part-10.parquet
data/2022/common_ncbi/part-2.parquet
data/2022/common_ncbi/part-3.parquet
data/2022/common_ncbi/part-4.parquet
data/2022/common_ncbi/part-5.parquet
data/2022/common_ncbi/part-6.parquet
data/2022/common_ncbi/part-7.parquet
data/2022/common_ncbi/part-8.parquet
data/2022/common_ncbi/part-9.parquet
data/2022/common_slb/part-0.parquet
data/2022/dwc_col/part-0.parquet
data/2022/dwc_col/part-1.parquet
data/2022/dwc_col/part-10.parquet
data/2022/dwc_col/part-11.parquet
data/2022/dwc_col/part-12.parquet
data/2022/dwc_col/part-13.parquet
data/2022/dwc_col/part-14.parquet
data/2022/dwc_col/part-15.parquet
data/2022/dwc_col/part-16.parquet
data/2022/dwc_col/part-17.parquet
data/2022/dwc_col/part-18.parquet
data/2022/dwc_col/part-19.parquet
data/2022/dwc_col/part-2.parquet
data/2022/dwc_col/part-20.parquet
data/2022/dwc_col/part-21.parquet
data/2022/dwc_col/part-22.parquet
data/2022/dwc_col/part-23.parquet
data/2022/dwc_col/part-3.parquet
data/2022/dwc_col/part-4.parquet
data/2022/dwc_col/part-5.parquet
data/2022/dwc_col/part-6.parquet
data/2022/dwc_col/part-7.parquet
data/2022/dwc_col/part-8.parquet
data/2022/dwc_col/part-9.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-0.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-1.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-10.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-11.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-12.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-13.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-14.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-15.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-16.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-17.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-18.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-19.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-2.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-20.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-21.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-22.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-23.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-24.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-25.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-26.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-27.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-28.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-29.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-3.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-30.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-31.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-32.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-33.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-4.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-5.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-6.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-7.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-8.parquet
data/2022/dwc_gbif/part-9.parquet
data/2022/dwc_itis/part-0.parquet
data/2022/dwc_itis/part-1.parquet
data/2022/dwc_itis/part-2.parquet
data/2022/dwc_itis/part-3.parquet
data/2022/dwc_itis/part-4.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-0.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-1.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-10.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-11.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-12.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-13.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-14.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-15.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-2.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-3.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-4.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-5.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-6.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-7.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-8.parquet
data/2022/dwc_ncbi/part-9.parquet
data/2022/dwc_ott/part-0.parquet
data/2022/dwc_ott/part-1.parquet
data/2022/dwc_ott/part-10.parquet
data/2022/dwc_ott/part-11.parquet
data/2022/dwc_ott/part-12.parquet
data/2022/dwc_ott/part-13.parquet
data/2022/dwc_ott/part-14.parquet
data/2022/dwc_ott/part-15.parquet
data/2022/dwc_ott/part-16.parquet
data/2022/dwc_ott/part-17.parquet
data/2022/dwc_ott/part-18.parquet
data/2022/dwc_ott/part-19.parquet
data/2022/dwc_ott/part-2.parquet
data/2022/dwc_ott/part-20.parquet
data/2022/dwc_ott/part-21.parquet
data/2022/dwc_ott/part-22.parquet
data/2022/dwc_ott/part-23.parquet
data/2022/dwc_ott/part-24.parquet
data/2022/dwc_ott/part-25.parquet
data/2022/dwc_ott/part-26.parquet
data/2022/dwc_ott/part-27.parquet
data/2022/dwc_ott/part-28.parquet
data/2022/dwc_ott/part-29.parquet
data/2022/dwc_ott/part-3.parquet
data/2022/dwc_ott/part-30.parquet
data/2022/dwc_ott/part-31.parquet
data/2022/dwc_ott/part-32.parquet
data/2022/dwc_ott/part-33.parquet
data/2022/dwc_ott/part-4.parquet
data/2022/dwc_ott/part-5.parquet
data/2022/dwc_ott/part-6.parquet
data/2022/dwc_ott/part-7.parquet
data/2022/dwc_ott/part-8.parquet
data/2022/dwc_ott/part-9.parquet
data/2022/dwc_redlist/part-0.parquet
data/2022/dwc_slb/part-0.parquet
jobs/col.R jobs/gbif.R jobs/itis.R jobs/iucn.R jobs/ncbi.R jobs/ott.R jsonld-append.R make.R man/clean_names.Rd man/preprocess_col.Rd man/preprocess_fb.Rd man/preprocess_gbif.Rd man/preprocess_itis.Rd man/preprocess_iucn.Rd man/preprocess_slb.Rd man/preprocess_tpl.Rd
prov.json
schema.json
taxadb-cache.Rproj
upload-and-register.R
boettiger-lab/taxadb-cache documentation built on March 20, 2023, 10:09 p.m.