bigarx_boot: Biplot con bootstrap: intervalos de confianza

In BiGaRx: Unified Classical and Canonical Biplots

Biplot con bootstrap: intervalos de confianza

Description

Calcula intervalos de confianza bootstrap para los parámetros de un biplot, siguiendo la metodología de Nieto, Galindo, Leiva y Vicente-Galindo (2014), implementada originalmente en biplotbootGUI.

Usage

bigarx_boot(
  X,
  B = 1000,
  method = c("hj", "gh", "jk", "sqrt"),
  transform = c("standardize", "center", "double", "grand", "none"),
  alpha = NULL,
  axes = c(1, 2),
  conf = 0.95,
  ci = c("percentile", "normal"),
  seed = NULL,
  groups = NULL,
  progress = interactive()
)

Arguments

X	Matriz o data.frame numérico.
B	Número de réplicas bootstrap (por defecto 1000).
method, transform, alpha	Como en bigarx().
axes	Plano en el que se calculan coordenadas, calidades y ángulos.
conf	Nivel de confianza (por defecto 0,95).
ci	"percentile" (por defecto) o "normal".
seed	Semilla opcional para reproducir los resultados.
groups	Factor opcional para colorear el biplot.
progress	Mostrar una barra de progreso.

Details

Algoritmo. Se extraen B muestras de individuos (filas) con reemplazo. En cada una se repite el preprocesamiento (por ejemplo, se vuelve a estandarizar) y el biplot, y se guardan los parámetros:

• inercia: porcentaje de inercia de cada eje;

• bondad: bondad de ajuste de la matriz en el plano;

• coordenada: coordenadas de cada variable en cada eje del plano;

• calidad: calidad de representación de cada variable en el plano;

• contribucion: contribución de cada variable a cada eje;

• angulo_variables: ángulo entre cada par de variables (en grados);

• angulo_eje: ángulo entre cada variable y cada eje (en grados).

Alineación de ejes. La SVD de cada réplica puede devolver un eje con el signo invertido, lo que inflaría artificialmente los intervalos de las coordenadas y de los ángulos con los ejes. Por eso, en cada réplica se invierte el signo del eje si sus cargas apuntan en sentido contrario a las del análisis original. Los ángulos entre variables no dependen del signo. Si dos valores propios son muy parecidos, los ejes pueden intercambiarse entre réplicas; conviene revisar inercia antes de interpretar.

Intervalos (ci):

• "percentile" (boot-q): cuantiles \alpha/2 y 1-\alpha/2 de las réplicas (Algoritmo 3 del artículo);

• "normal" (boot-t): estimación \pm z_{1-\alpha/2} por el error estándar bootstrap, con t_{n-1} si n < 25 (Algoritmo 2).

Value

Un objeto "bigarx_boot" con

fit

El biplot original (bigarx()).

table

data.frame con una fila por parámetro: tipo, elemento, eje, estimación, media y error estándar bootstrap, sesgo, límites del intervalo y método.

replicates

Matriz de réplicas (una fila por réplica, una columna por parámetro).

B, conf, ci, axes

Configuración.

References

Nieto, A. B., Galindo, M. P., Leiva, V. y Vicente-Galindo, P. (2014). A methodology for biplots based on bootstrapping with R. Revista Colombiana de Estadística, 37(2), 367-397. \Sexpr[results=rd]{tools:::Rd_expr_doi("10.15446/rce.v37n2spe.47944")}

Efron, B. y Tibshirani, R. J. (1993). An Introduction to the Bootstrap. Chapman & Hall.

Examples

bt <- bigarx_boot(USArrests, B = 200, seed = 1)
bt
summary(bt, type = "angulo_variables")
plot(bt)
plot(bt, type = "angulo_variables")

BiGaRx documentation built on Oct. 30, 2026, 1:07 a.m.