grex: Gene ID Mapping for Genotype-Tissue Expression (GTEx) Data

Convert 'Ensembl' gene identifiers from Genotype-Tissue Expression (GTEx) data to identifiers in other annotation systems, including 'Entrez', 'HGNC', and 'UniProt'.

Author
Nan Xiao [aut, cre], Gao Wang [aut], Lei Sun [aut]
Date of publication
2016-11-21 12:01:57
Maintainer
Nan Xiao <me@nanx.me>
License
GPL
Version
1.4
URLs

View on CRAN

Man pages

cleanid
Remove Version Numbers in Raw GTEx (GENCODE) Gene IDs
grex
Gene ID Mapping for Genotype-Tissue Expression (GTEx) Data
grex-package
Gene ID Mapping for Genotype-Tissue Expression (GTEx) Data
gtexv6
Ensembl IDs from GTEx V6 Gene Read Count Data
gtexv6p
Ensembl IDs from GTEx V6p Gene Read Count Data

Files in this package

grex
grex/TODO
grex/inst
grex/inst/doc
grex/inst/doc/grex.html
grex/inst/doc/grex.Rmd
grex/inst/doc/grex.R
grex/NAMESPACE
grex/NEWS.md
grex/data
grex/data/gtexv6p.rda
grex/data/gtexv6.rda
grex/R
grex/R/grex-datalist.R
grex/R/sysdata.rda
grex/R/grex-package.R
grex/R/grex.R
grex/vignettes
grex/vignettes/grex.bib
grex/vignettes/header.html
grex/vignettes/grex.css
grex/vignettes/grex.Rmd
grex/README.md
grex/MD5
grex/build
grex/build/vignette.rds
grex/DESCRIPTION
grex/man
grex/man/gtexv6p.Rd
grex/man/grex.Rd
grex/man/cleanid.Rd
grex/man/grex-package.Rd
grex/man/gtexv6.Rd