hiertest: Convex Hierarchical Testing of Interactions

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Implementation of the convex hierarchical testing (CHT) procedure introduced in Bien, Simon, and Tibshirani (2015) Convex Hierarchical Testing of Interactions. Annals of Applied Statistics. Vol. 9, No. 1, 27-42.

Author
Jacob Bien, Noah Simon, and Rob Tibshirani
Date of publication
2015-05-05 07:53:06
Maintainer
Jacob Bien <jbien@cornell.edu>
License
GPL-3
Version
1.1

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Man pages

compute.contrasts
Computes contrasts
estimate.fdr
Estimate FDR
hiertest
Convex Hierarchical Testing Method
hiertest-package
Convex Hierarchical Testing of Interactions.
interactions.above
Get significant interactions above a threshold
plot.estfdr
Plot the estimated FDR
plot.hiertest
Plot Convex Hierarchical Testing Statistics
print.estfdr
Print the estimated FDR
print.hiertest
Print Convex Hierarchical Testing Statistics

Files in this package

hiertest
hiertest/NAMESPACE
hiertest/R
hiertest/R/hiertest-package.r
hiertest/R/hiertest.R
hiertest/MD5
hiertest/DESCRIPTION
hiertest/man
hiertest/man/plot.estfdr.Rd
hiertest/man/plot.hiertest.Rd
hiertest/man/hiertest.Rd
hiertest/man/print.hiertest.Rd
hiertest/man/hiertest-package.Rd
hiertest/man/compute.contrasts.Rd
hiertest/man/print.estfdr.Rd
hiertest/man/interactions.above.Rd
hiertest/man/estimate.fdr.Rd