In CCOMS-UAM/ecs-data: Funciones para la gestión de datos del proyecto "Edad con Salud"
Aviso preliminar
Esta plantilla está diseñada para la generación de "variables outcome" del
proyecto Edad con Salud. Su objetivo es ayudar a automatizar las tareas de
procesamiento de datos del proyecto.
Esta plantilla está basada en el documento
Outcome variable generation guidelines.docx
. Sin embargo, esta plantilla no sustituye a ese documento. Por favor, lee
dicho documento para conocer todas las instrucciones y convenciones del proceso
de generación de variables outcome de Edad con Salud.
Consideraciones generales
-
Puesto que nuestros datos son analizados por investigadores/as procedentes
de distintas partes del mundo, todos los documentos deben estar en inglés.
-
El nombre de este archivo debe tener la siguiente estructura:
"Description__". En '' se añadirá
cualquier particularidad, en caso que exista/n variable/s generadas en base a
distintos criterios (e.g., diagnóstico, versión reducida). Por favor, evita en
los nombres los espacios (sustituir por "_"), tildes, "ñ" y "Ñ". Por ejemplo:
"Description_cognitivereserve".
-
Si se trata de una variable que ya estaba generada en evaluaciones
anteriores/otras cohortes, puedes adaptar la información de ese documento. En
ese caso, por favor, revisa cuidadosamente que la información contenida se
ajusta a las particularidades de los datos.
# Activar los paquetes que R necesita para ejecutar el código:
library(Statamarkdown)
# Ruta al ejecutable de Stata (Ejecuta `sysdir` en Stata para encontrar la ruta)
## TODO: sustituir '<path\to\>' por la ubicación de Stata
## (ejecutar `sysdir` en Stata) y descomentar línea 62,
## o eliminar linea 62:
# STATA_PATH <- r"(<path\to\>StataSE-64.exe)"
# Opciones de configuración de las salidas de R y Stata:
options(width = 88) # Ancho de salida de texto en R
knitr::opts_chunk$set( # Para todos los 'chunks' de código:
## TODO: Descomentar si hace falta
# engine.path = list(stata = STATA_PATH),
echo = FALSE, # - No muestra la sintaxis en el documento
results = 'hide',# - Omite los resultados de ejecutar la sintaxis
cleanlog = TRUE, # - Omite repetir sintaxis en resultados de Stata
collectcode = TRUE, # - Reutiliza el código de Stata de 'chunks' anteriores
comment = '' # - No añade ningún prefijo a los resultados
)
TEST <- params$test
DOUBLE_CODING <- params$`double-coding` & TEST
Variable information
Aquí debes incluir una tabla con los datos principales de todas la/s variable/s
finales generada/s. Esto es, el nombre de la/s variable/s (tal y como aparece/n
en la base de datos), la/s etiqueta/s, el formato (discreta, continua, nominal,
ordinal, binaria) y los valores posibles (e.g., rango para continuas, opciones
de respuesta para variables categóricas).
En esta tabla debes incluir la variable principal, así como las transformaciones
pertinentes asociadas a esta variable, como ocurre con el ejemplo anterior. En
el caso de que la/s variable/s generada/s que requiera/n la creación previa de otras variables, solo se incluirán aquellas que pueden resultar clave para entender o analizar la variable final. Por ejemplo, si creas una variable a partir de otra existente en la que eliminas casos con datos inválidos o modificas las etiquetas, no es necesario que incluyas esta información en este punto (tampoco en la base de datos). Los/as investigadores/as podrán verlo en el algoritmo. En caso que tengas dudas sobre qué variables incluir en este punto, por favor, pregunta a alguno de los/as compañeros responsables del proyecto.
En la etiqueta de la/s variable/s generadas, por favor incluye información
acerca de la cohorte y la evaluación de la que se trata. El patrón es un
sufijo como (c_w), donde puede tomar los valores 2011 o
2019, y puede tomar los valores: 1, 2, 3, 4, etc. (COVID para el
subestudio COVID).
Ejemplos: (c2011_w1), (c2019_w3), (c2019_wCOVID). "w1" se correspondería con
la primera evaluación (línea base).
+--------------------+------------------------------------------+------------+----------------------+
| Main variable name | Label | Format | Code |
+:===================+:=========================================+:===========+:=====================+
| | | | |
+--------------------+------------------------------------------+------------+----------------------+
| bmi_cont | Body mass index, continuous (c2011_w4) | Continuous | 16-40 |
+--------------------+------------------------------------------+------------+----------------------+
| bmi_cont_std | Body mass index, standardized (c2011_w4) | Continuous | standardized |
+--------------------+------------------------------------------+------------+----------------------+
| bmi | Body mass index, categories (c2011_w4) | Ordinal | 1 = Underweight; |
| | | | |
| | | | 2 = Normal weight; |
| | | | |
| | | | 3 = Overweight; |
| | | | |
| | | | 4 = Obese |
+--------------------+------------------------------------------+------------+----------------------+
Variable description
Por favor, incluye aquí una breve descripción de la variable o constructo que
estás trabajando. Qué significa o qué evalúa esa variable y por qué es
importante. Incluye las referencias bibliográficas necesarias.
Explanation of how the variables were created
Este apartado es complementario al siguiente. Trata de describir, de forma clara
y concisa, cómo has generado la variable. El objetivo de esta sección es doble.
Por un lado, que sirva de apoyo para los/as investigadores/as que pudieran no
estar familiarizados con el código utilizado para generar la/s variable/s (e.g.,
R, Stata). Por otro, facilitar la información suficiente para describir
adecuadamente la/s variable/s en los artículos científicos.
Si se trata de variable/s que ya se había/n generado en ocasiones anteriores
(e.g., evaluaciones o cohortes distintas), por favor, documenta las potenciales
particularidades o modificaciones que realices (e.g., versión reducida,
detección de errores).
Como criterio general, esta sección debería ser suficiente para entender cómo
ha de generarse la variable sin necesidad de entender la sintaxis.
Syntax used to create the variable (Stata 15)
Aquí debes incluir el algoritmo o código empleado para generar la/s variable/s.
Es fundamental que revises minuciosamente esta sección. Cualquier
investigador/a debería poder generar la/s variable/s y obtener los mismos
resultados. Por favor, indica también el programa utilizado (e.g., Stata, R),
si bien ten en cuenta que el consenso es utilizar Stata. Incluye también una
pequeña tabla con los descriptivos principales de esta/s variable/s (i.e., n,
frecuencia absoluta y relativa, rango, media...).
``{stata load-data}
* TODO: Descomentar linea correspondiente a la base de datos maestra a utilizar
* TODO: Comprobar que la ruta de origen coincide con la localización deDB`
- Cohorte 2011, linea base:
-
use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Ola_1_Linea_base\All_COURAGE_VFINAL.dta"
-
Cohorte 2011, ola 2:
-
use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Ola_2\20150916 Database COURAGE wave 1.dta"
-
Cohorte 2011, ola 3:
-
use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Ola_3\Cohorte_2011\FINAL\20190208_PES16028242_Seguimiento_final_completo_V6.dta"
-
Cohorte 2011, ola 4:
-
use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Ola_4\Cohorte 2011\rawdata_c2011w4.dta"
-
Cohorte 2019, linea base:
-
use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Ola_3\Cohorte_2019\rawdata_c2019w1.dta"
-
Cohorte 2019, ola post-confinamiento:
- use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Subestudio_COVID\Edad_con_salud_Fichero_Completo.dta"
```{stata generate-outcomes, echo=!DOUBLE_CODING}
* TODO: Escribir aquí la sintaxis de generación de las variables
Otras consideraciones
- El **número de participantes (n) que debe aparecer en cada base de
datos** debe ser correspondiente con aquella que aparece en la base de datos
maestra u original. Para la **base de datos de la muestra completa serán
3002 participantes**. En el caso de la **muestra pre-confinamiento serán
1935 participantes**.
- Es recomendable que revises los descriptivos de la/s variable/s
generadas. De esta forma podrás detectar posibles errores (e.g., un
porcentaje de datos perdidos que no responde a lo esperado; una prevalencia
de x patología muy superior o inferior a lo que la evidencia científica
señala).
``{stata descriptives, cleanlog=FALSE, collectcode=FALSE, results='markup', include=!DOUBLE_CODING}
* TODO: Sustituir '<variable(s) generada(s)>' por las variables del dataset
* TODO: Añadirsubsample_pre interview_pre` si procede (sólo para Cohorte 2019, Ola 1)
keep ID_ECS q0007a_result proxy
- TODO: Sustituir '
' por las variables del dataset
codebook
<!--# TODO: Leer párrafos a continuación -->
- Variable/s de identificación
**La variable de identificación que debes incluir para la cohorte 2011 es
ID_ECS**. Para conocer la equivalencia y las particularidades de las distintas
variables de identificación, por favor, revisa la tabla 1 en el documento
[LÉEME. Pautas para la creación de variables..docx](https://dauam-my.sharepoint.com/:w:/r/personal/marta_miret_uam_es/Documents/Edad%20con%20Salud/Documentacion%20Edad%20con%20Salud/Edad%20con%20salud%20-%20Ola%203/Outcomes/L%C3%89EME.%20Pautas%20para%20la%20creaci%C3%B3n%20de%20variables..docx?d=wb61214c5b3e542638e3af80472f0089c&csf=1&web=1&e=GFJJ2i)
.
- Variable(s) generada(s)
Debes incluir la variable principal, así como las transformaciones pertinentes
asociadas a esta variable. En el caso de que la/s variable/s generada/s que
requiera/n la creación previa de otras variables, solo se incluirán aquellas que
pueden resultar clave para entender o analizar la variable final. Por ejemplo,
si creas una variable a partir de otra existente en la que eliminas casos con
datos inválidos o modificas las etiquetas, no es necesario que incluyas esta
información en este punto (tampoco en el documento de descripción). Los/as
investigadores/as podrán verlo en el algoritmo. En caso que tengas dudas sobre
qué variables incluir en este punto, por favor, pregunta a alguno de los/as
compañeros responsables del proyecto.
- Variables de apoyo
Puesto que en ocasiones no todos los individuos contactados participan en el
estudio (porque no quieren, porque no pueden, porque no los encontramos...) y
dado que no todos los participantes responden a todos los ítems, se incluirán
las siguientes variables como apoyo para la interpretación de los resultados:
- **Variable estado de entrevista**: `q0007a_result`. El código 1 hace
referencia a todas las personas que han participado en el estudio.
- **Variable proxy**: proxy El código 1 hace referencia a los
participantes que realizaron una entrevista proxy. Esto quiere decir que el
individuo seleccionado no contestó las preguntas, sino que otra persona
respondió en su lugar a una versión reducida del cuestionario. El código 2
hace referencia a los participantes que hicieron entrevista directa.
Otras consideraciones:
- Las bases de datos deben tener formato Stata 13 (.dta)
- El nombre de estos archivos debe tener la siguiente estructura:
"Outcome_[variablename]_[qualifier]". Se añadirá cualquier particularidad en
caso que exista/n variable/s generadas en base a distintos criterios (e.g.,
diagnóstico, versión reducida).
<!--# TODO: Borrar párrafos anteriores -->
```{stata save-data-test, eval=TEST}
* TODO: Sustituir '<variable>' y '<qualifier>' por los valores correspondientes
saveold "Outcome_<variable>_<qualifier>.dta", replace version(13)
``{stata save-data, eval=!TEST}
* TODO: Descomentar linea correspondiente a la cohorte y ola utilizada
* TODO: Comprobar que la ruta de destino coincide con la localización deDOC`
* TODO: Sustituir '' y '' por los valores correspondientes
- Cohorte 2011, ola 1:
-
saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Ola 1 - Línea base\Outcomes\Outcome datasets\Outcome__.dta", replace version(13) // TODO: Aviso! El acento en "Línea" puede dar problemas con la ruta del archivo
-
Cohorte 2011, ola 2:
-
saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Ola 2\Outcomes\Outcome datasets\Outcome__.dta", replace version(13)
-
Cohorte 2011, ola 3:
-
saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Ola 3\Outcomes\Cohorte 2011\Outcome datasets\Outcome__.dta", replace version(13)
-
Cohorte 2011, ola 4:
-
saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Ola 4\Outcomes\Cohorte 2011\Outcome datasets\Outcome__.dta", replace version(13)
-
Cohorte 2019, ola 1:
-
saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Ola 3\Outcomes\Cohorte 2019\Outcome datasets\Outcome__.dta", replace version(13)
-
Cohorte 2019, ola post-confinamiento:
- saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Subestudio COVID\Outcomes\Outcome datasets\Outcome_
_.dta", replace version(13)
<br>
# Contact person:
<!--# TODO: Leer párrafo a continuación -->
Incluye tu nombre completo, correo electrónico, teléfono e institución a la que
perteneces. Si el algoritmo que has generado ha estado basado en el trabajo que
ya había hecho otro/a compañero/a, por favor, indícalo.
<!--# TODO: Borrar párrafo anterior -->
<!--# TODO: Completar '<Nombre y apellidos>', 'nombre.buzon@institucion.org>', y
'<prefijo>' y '<teléfono>' -->
- Name: <Nombre y apellidos>
- e-mail:
[\<nombre.buzon\@institucion.org\>](mailto:nombre.buzon@institucion.org){.email}
- Phone number: (+<prefijo>) <teléfono>
<br>
<!--# TODO: Completar / eliminar "original version" según corresponda -->
\< Original version:
- Name: <Nombre y apellidos>
- e-mail:
[\<nombre.buzon\@institucion.org\>](mailto:nombre.buzon@institucion.org){.email}
- Phone number: (+<prefijo>) <teléfono> \>
# References
<!--# TODO: Leer párrafo a continuación -->
Indica las referencias utilizadas para explicar o generar la/s variable/s. Esta
información será igualmente útil para citar apropiadamente en nuestros artículos
científicos.
<!--# TODO: Borrar párrafo anterior -->
::: {#refs}
:::
\newpage
<!--# TODO: Leer párrafos a continuación -->
He terminado de generar la/s variable/s.
¡Maravilloso, enhorabuena! Cuando hayas terminado de generar la/s variable/s,
por favor, actualiza el documento
[C2011_W4_Planning_outcomes.xlsxl](https://dauam.sharepoint.com/:x:/r/sites/EdadconSalud-OutcomesC2011W4/Documentos compartidos/Outcomes C2011 W4/C2011_W4_Planning_outcomes.xlsx?d=w3e49821bd21047ab8f57ab5837db2393&csf=1&web=1&e=QQRWdn)
\*Este documento hace referencia exclusiva a las variables de cohorte 2011, Ola
4.
Así, el/la compañero/a al que le corresponda podrá examinar los distintos
archivos y, sobre todo, el algoritmo. En caso de que se detecten
inconsistencias, errores o surjan dudas, se te comunicará para proceder con su
revisión.
Finalmente, cuando todas las variables estén generadas y revisadas se creará una
base de datos común con todas ellas y los datos sociodemográficos principales de
los participantes.
<!--# TODO: Borrar párrafos anteriores -->
# Session info
```r
devtools::session_info()
CCOMS-UAM/ecs-data documentation built on May 26, 2023, 7:03 p.m.
R Package Documentation
Browse R Packages
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Note that we can't provide technical support on individual packages. You should contact the package authors for that.
Aviso preliminar
Esta plantilla está diseñada para la generación de "variables outcome" del proyecto Edad con Salud. Su objetivo es ayudar a automatizar las tareas de procesamiento de datos del proyecto.
Esta plantilla está basada en el documento Outcome variable generation guidelines.docx . Sin embargo, esta plantilla no sustituye a ese documento. Por favor, lee dicho documento para conocer todas las instrucciones y convenciones del proceso de generación de variables outcome de Edad con Salud.
Consideraciones generales
-
Puesto que nuestros datos son analizados por investigadores/as procedentes de distintas partes del mundo, todos los documentos deben estar en inglés.
-
El nombre de este archivo debe tener la siguiente estructura: "Description_
_ ". En ' ' se añadirá cualquier particularidad, en caso que exista/n variable/s generadas en base a distintos criterios (e.g., diagnóstico, versión reducida). Por favor, evita en los nombres los espacios (sustituir por "_"), tildes, "ñ" y "Ñ". Por ejemplo: "Description_cognitivereserve". -
Si se trata de una variable que ya estaba generada en evaluaciones anteriores/otras cohortes, puedes adaptar la información de ese documento. En ese caso, por favor, revisa cuidadosamente que la información contenida se ajusta a las particularidades de los datos.
# Activar los paquetes que R necesita para ejecutar el código: library(Statamarkdown) # Ruta al ejecutable de Stata (Ejecuta `sysdir` en Stata para encontrar la ruta) ## TODO: sustituir '<path\to\>' por la ubicación de Stata ## (ejecutar `sysdir` en Stata) y descomentar línea 62, ## o eliminar linea 62: # STATA_PATH <- r"(<path\to\>StataSE-64.exe)" # Opciones de configuración de las salidas de R y Stata: options(width = 88) # Ancho de salida de texto en R knitr::opts_chunk$set( # Para todos los 'chunks' de código: ## TODO: Descomentar si hace falta # engine.path = list(stata = STATA_PATH), echo = FALSE, # - No muestra la sintaxis en el documento results = 'hide',# - Omite los resultados de ejecutar la sintaxis cleanlog = TRUE, # - Omite repetir sintaxis en resultados de Stata collectcode = TRUE, # - Reutiliza el código de Stata de 'chunks' anteriores comment = '' # - No añade ningún prefijo a los resultados ) TEST <- params$test DOUBLE_CODING <- params$`double-coding` & TEST
Variable information
Aquí debes incluir una tabla con los datos principales de todas la/s variable/s finales generada/s. Esto es, el nombre de la/s variable/s (tal y como aparece/n en la base de datos), la/s etiqueta/s, el formato (discreta, continua, nominal, ordinal, binaria) y los valores posibles (e.g., rango para continuas, opciones de respuesta para variables categóricas).
En esta tabla debes incluir la variable principal, así como las transformaciones pertinentes asociadas a esta variable, como ocurre con el ejemplo anterior. En el caso de que la/s variable/s generada/s que requiera/n la creación previa de otras variables, solo se incluirán aquellas que pueden resultar clave para entender o analizar la variable final. Por ejemplo, si creas una variable a partir de otra existente en la que eliminas casos con datos inválidos o modificas las etiquetas, no es necesario que incluyas esta información en este punto (tampoco en la base de datos). Los/as investigadores/as podrán verlo en el algoritmo. En caso que tengas dudas sobre qué variables incluir en este punto, por favor, pregunta a alguno de los/as compañeros responsables del proyecto.
En la etiqueta de la/s variable/s generadas, por favor incluye información
acerca de la cohorte y la evaluación de la que se trata. El patrón es un
sufijo como (c
Ejemplos: (c2011_w1), (c2019_w3), (c2019_wCOVID). "w1" se correspondería con la primera evaluación (línea base).
+--------------------+------------------------------------------+------------+----------------------+
| Main variable name | Label | Format | Code |
+:===================+:=========================================+:===========+:=====================+
|
Variable description
Por favor, incluye aquí una breve descripción de la variable o constructo que estás trabajando. Qué significa o qué evalúa esa variable y por qué es importante. Incluye las referencias bibliográficas necesarias.
Explanation of how the variables were created
Este apartado es complementario al siguiente. Trata de describir, de forma clara y concisa, cómo has generado la variable. El objetivo de esta sección es doble. Por un lado, que sirva de apoyo para los/as investigadores/as que pudieran no estar familiarizados con el código utilizado para generar la/s variable/s (e.g., R, Stata). Por otro, facilitar la información suficiente para describir adecuadamente la/s variable/s en los artículos científicos.
Si se trata de variable/s que ya se había/n generado en ocasiones anteriores (e.g., evaluaciones o cohortes distintas), por favor, documenta las potenciales particularidades o modificaciones que realices (e.g., versión reducida, detección de errores).
Como criterio general, esta sección debería ser suficiente para entender cómo ha de generarse la variable sin necesidad de entender la sintaxis.
Syntax used to create the variable (Stata 15)
Aquí debes incluir el algoritmo o código empleado para generar la/s variable/s. Es fundamental que revises minuciosamente esta sección. Cualquier investigador/a debería poder generar la/s variable/s y obtener los mismos resultados. Por favor, indica también el programa utilizado (e.g., Stata, R), si bien ten en cuenta que el consenso es utilizar Stata. Incluye también una pequeña tabla con los descriptivos principales de esta/s variable/s (i.e., n, frecuencia absoluta y relativa, rango, media...).
``{stata load-data}
* TODO: Descomentar linea correspondiente a la base de datos maestra a utilizar
* TODO: Comprobar que la ruta de origen coincide con la localización deDB`
- Cohorte 2011, linea base:
-
use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Ola_1_Linea_base\All_COURAGE_VFINAL.dta"
-
Cohorte 2011, ola 2:
-
use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Ola_2\20150916 Database COURAGE wave 1.dta"
-
Cohorte 2011, ola 3:
-
use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Ola_3\Cohorte_2011\FINAL\20190208_PES16028242_Seguimiento_final_completo_V6.dta"
-
Cohorte 2011, ola 4:
-
use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Ola_4\Cohorte 2011\rawdata_c2011w4.dta"
-
Cohorte 2019, linea base:
-
use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Ola_3\Cohorte_2019\rawdata_c2019w1.dta"
-
Cohorte 2019, ola post-confinamiento:
- use "~\UAM\Marta Miret Garcia - Bases de datos maestras Edad con Salud\Subestudio_COVID\Edad_con_salud_Fichero_Completo.dta"
```{stata generate-outcomes, echo=!DOUBLE_CODING}
* TODO: Escribir aquí la sintaxis de generación de las variables
Otras consideraciones
- El **número de participantes (n) que debe aparecer en cada base de datos** debe ser correspondiente con aquella que aparece en la base de datos maestra u original. Para la **base de datos de la muestra completa serán 3002 participantes**. En el caso de la **muestra pre-confinamiento serán 1935 participantes**. - Es recomendable que revises los descriptivos de la/s variable/s generadas. De esta forma podrás detectar posibles errores (e.g., un porcentaje de datos perdidos que no responde a lo esperado; una prevalencia de x patología muy superior o inferior a lo que la evidencia científica señala).
``{stata descriptives, cleanlog=FALSE, collectcode=FALSE, results='markup', include=!DOUBLE_CODING}
* TODO: Sustituir '<variable(s) generada(s)>' por las variables del dataset
* TODO: Añadirsubsample_pre interview_pre` si procede (sólo para Cohorte 2019, Ola 1)
keep ID_ECS q0007a_result proxy
- TODO: Sustituir '
<!--# TODO: Leer párrafos a continuación -->
- Variable/s de identificación
**La variable de identificación que debes incluir para la cohorte 2011 es
ID_ECS**. Para conocer la equivalencia y las particularidades de las distintas
variables de identificación, por favor, revisa la tabla 1 en el documento
[LÉEME. Pautas para la creación de variables..docx](https://dauam-my.sharepoint.com/:w:/r/personal/marta_miret_uam_es/Documents/Edad%20con%20Salud/Documentacion%20Edad%20con%20Salud/Edad%20con%20salud%20-%20Ola%203/Outcomes/L%C3%89EME.%20Pautas%20para%20la%20creaci%C3%B3n%20de%20variables..docx?d=wb61214c5b3e542638e3af80472f0089c&csf=1&web=1&e=GFJJ2i)
.
- Variable(s) generada(s)
Debes incluir la variable principal, así como las transformaciones pertinentes
asociadas a esta variable. En el caso de que la/s variable/s generada/s que
requiera/n la creación previa de otras variables, solo se incluirán aquellas que
pueden resultar clave para entender o analizar la variable final. Por ejemplo,
si creas una variable a partir de otra existente en la que eliminas casos con
datos inválidos o modificas las etiquetas, no es necesario que incluyas esta
información en este punto (tampoco en el documento de descripción). Los/as
investigadores/as podrán verlo en el algoritmo. En caso que tengas dudas sobre
qué variables incluir en este punto, por favor, pregunta a alguno de los/as
compañeros responsables del proyecto.
- Variables de apoyo
Puesto que en ocasiones no todos los individuos contactados participan en el
estudio (porque no quieren, porque no pueden, porque no los encontramos...) y
dado que no todos los participantes responden a todos los ítems, se incluirán
las siguientes variables como apoyo para la interpretación de los resultados:
- **Variable estado de entrevista**: `q0007a_result`. El código 1 hace
referencia a todas las personas que han participado en el estudio.
- **Variable proxy**: proxy El código 1 hace referencia a los
participantes que realizaron una entrevista proxy. Esto quiere decir que el
individuo seleccionado no contestó las preguntas, sino que otra persona
respondió en su lugar a una versión reducida del cuestionario. El código 2
hace referencia a los participantes que hicieron entrevista directa.
Otras consideraciones:
- Las bases de datos deben tener formato Stata 13 (.dta)
- El nombre de estos archivos debe tener la siguiente estructura:
"Outcome_[variablename]_[qualifier]". Se añadirá cualquier particularidad en
caso que exista/n variable/s generadas en base a distintos criterios (e.g.,
diagnóstico, versión reducida).
<!--# TODO: Borrar párrafos anteriores -->
```{stata save-data-test, eval=TEST}
* TODO: Sustituir '<variable>' y '<qualifier>' por los valores correspondientes
saveold "Outcome_<variable>_<qualifier>.dta", replace version(13)
``{stata save-data, eval=!TEST}
* TODO: Descomentar linea correspondiente a la cohorte y ola utilizada
* TODO: Comprobar que la ruta de destino coincide con la localización deDOC`
* TODO: Sustituir '
- Cohorte 2011, ola 1:
-
saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Ola 1 - Línea base\Outcomes\Outcome datasets\Outcome_
_ .dta", replace version(13) // TODO: Aviso! El acento en "Línea" puede dar problemas con la ruta del archivo -
Cohorte 2011, ola 2:
-
saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Ola 2\Outcomes\Outcome datasets\Outcome_
_ .dta", replace version(13) -
Cohorte 2011, ola 3:
-
saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Ola 3\Outcomes\Cohorte 2011\Outcome datasets\Outcome_
_ .dta", replace version(13) -
Cohorte 2011, ola 4:
-
saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Ola 4\Outcomes\Cohorte 2011\Outcome datasets\Outcome_
_ .dta", replace version(13) -
Cohorte 2019, ola 1:
-
saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Ola 3\Outcomes\Cohorte 2019\Outcome datasets\Outcome_
_ .dta", replace version(13) -
Cohorte 2019, ola post-confinamiento:
- saveold "~\UAM\Marta Miret Garcia - Documentacion Edad con Salud\Edad con salud - Subestudio COVID\Outcomes\Outcome datasets\Outcome_
_ .dta", replace version(13)
<br>
# Contact person:
<!--# TODO: Leer párrafo a continuación -->
Incluye tu nombre completo, correo electrónico, teléfono e institución a la que
perteneces. Si el algoritmo que has generado ha estado basado en el trabajo que
ya había hecho otro/a compañero/a, por favor, indícalo.
<!--# TODO: Borrar párrafo anterior -->
<!--# TODO: Completar '<Nombre y apellidos>', 'nombre.buzon@institucion.org>', y
'<prefijo>' y '<teléfono>' -->
- Name: <Nombre y apellidos>
- e-mail:
[\<nombre.buzon\@institucion.org\>](mailto:nombre.buzon@institucion.org){.email}
- Phone number: (+<prefijo>) <teléfono>
<br>
<!--# TODO: Completar / eliminar "original version" según corresponda -->
\< Original version:
- Name: <Nombre y apellidos>
- e-mail:
[\<nombre.buzon\@institucion.org\>](mailto:nombre.buzon@institucion.org){.email}
- Phone number: (+<prefijo>) <teléfono> \>
# References
<!--# TODO: Leer párrafo a continuación -->
Indica las referencias utilizadas para explicar o generar la/s variable/s. Esta
información será igualmente útil para citar apropiadamente en nuestros artículos
científicos.
<!--# TODO: Borrar párrafo anterior -->
::: {#refs}
:::
\newpage
<!--# TODO: Leer párrafos a continuación -->
He terminado de generar la/s variable/s.
¡Maravilloso, enhorabuena! Cuando hayas terminado de generar la/s variable/s,
por favor, actualiza el documento
[C2011_W4_Planning_outcomes.xlsxl](https://dauam.sharepoint.com/:x:/r/sites/EdadconSalud-OutcomesC2011W4/Documentos compartidos/Outcomes C2011 W4/C2011_W4_Planning_outcomes.xlsx?d=w3e49821bd21047ab8f57ab5837db2393&csf=1&web=1&e=QQRWdn)
\*Este documento hace referencia exclusiva a las variables de cohorte 2011, Ola
4.
Así, el/la compañero/a al que le corresponda podrá examinar los distintos
archivos y, sobre todo, el algoritmo. En caso de que se detecten
inconsistencias, errores o surjan dudas, se te comunicará para proceder con su
revisión.
Finalmente, cuando todas las variables estén generadas y revisadas se creará una
base de datos común con todas ellas y los datos sociodemográficos principales de
los participantes.
<!--# TODO: Borrar párrafos anteriores -->
# Session info
```r
devtools::session_info()
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