extract_labkey: Extract data from Labkey

In CeliaPontet/RLabkey: Extraction de donnees Labkey

Description

Extract data from Labkey

Usage

extract_labkey(rodbc_chan, cultures = NULL, protocols = NULL,
  annees = NULL, essais = NULL, na.col = FALSE)

Arguments

rodbc_chan	channel odbc created by labkey_connectRLabkey. Connexion à Labkey créée au préalable
cultures	a vector of character (length 1 = code culture). Un vecteur contenant l'ensemble des codes à 1 lettre labkey correspond aux cultures souhaitées.
protocols	a vector of character (length 3 = protocol code). Un vecteur contenant les codes protocoles à 3 lettres Labkey souhaités
annees	a vector of years. Un vecteur d'années à 4 chiffre.
essais	a vector of character (max length = 11). Un vecteur pouvant contenir des "bouts" de codes essais, donc de 1 à 11 caractères
na.col	a logical. FALSE pour ne pas conserver les variables vides, TRUE pour les conserver

Value

a dataframe

CeliaPontet/RLabkey documentation built on May 31, 2019, 1:52 p.m.