library(CampR)
Este documento R Markdown. resume y propone un protolo para realiar la comprobación de errores en los datos recogidos y tecleados a lo largo de una campaña de arrastre con datos almacenados con las bases de datos de CAMP 12 Harbour Windows 10 version.
El protocolo debe incluir la revisión de:
lancesXXX.dbf
La revisión puede incluir un mapa con la distribución de los lances que permite encontrar errores de bulto rápidamente. La función armap.camp(camp="N12",dns="Cant")
permite incluir el número del lance con Nlans=TRUE
que también puede ayudar a localizar errores
armap.camp("N12","Cant")
La función qcdistlan.camp
permite ver errores en la distancia recorrida y la velocidad incluida en los datos y su relación, además de la duración del lance y el rumbo.
qcdistlan.camp("N12","Cant",todos=FALSE,pc.error=2)
log
del ITI, MARPORT, SCANMAR...)Los datos se pueden tomar directamente del equipo a través de los telegramas que se pasan al PescaWin
y procesarlo: preparar ejemplos a partir de un archivo de log
del MARPORT u otro monitor de funcionamiento del aparejo.
La función qcLW.camp(1,51,"N12","Cant")
produce un gráfico con los pesos por lance en función de la captura y el peso estimado para esa captura a partir de la distribución de tallas medidas. El error respecto a la mediana permite también ver qué lances dan error por categoría. qcLWbucl.camp
permite revisar todas las especies de la campaña sucesivamente, y con out.dat=TRUE
produce una tabla con todos los errores de todas las especies de peces sin necesidad de revisar todos los gráficos.
qcLW.camp(1,51,"N12","Cant",margerr=14)
La función qcdtall.camp(gr,esp,"N12","Cant",lance=xxx)
permite revisar la distribución de tallas medida para el lance xxx
junto con las categorías medidas y los factores de ponderación captura/muestra
para cada categoría, añadiendo cual habría sido el tamaño de muestra suficiente en función del rango de tallas encontrado.
qcdtall.camp(1,51,"N12","Cant",107)
La función qcdtallrev.camp
permite sacar las distribuciones de todas las especies y lances, se puede cortar pulsando ESCAPE
en cualquier momento, y resulta muy útil para revisar posibles datos de especies con identificación de sexos en especies que habitualmente no se miden por sexos.
La función qcTalPez.lan(camp,dns="Cant",lan,gr=1)
revisa que haya datos de tallas en el fichero de tallas NTALLxxx.DBF
para todas las especies registradas en el fichero FAUNAXXX.DBF
y viceversa, localizando especies que no se han medido en un lance, o especies que se han medido pero no se ha registrado el peso de captura y discordancias entre inviduos medidos en NTALLxxx.DBF
y los registrados para el lance correspondiente en FAUNAxxx.DBF
.
qcTalPez.lan("P18",dns="Porc",16,gr=1)
Provisionalmente existe una función qcTalPez.camp(camp,dns,gr)
que recorre todos los lances de la campaña buscando errores, habrá que mejorarla, porque va haciendo pausas entre lances y no es una salida muy amigable
La función grafedtal.camp
permite ver la composción por edades de cada talla, identificando posibles errores de tecleo y dando una imágen de la composición por edades de la captura en el lance.
grafedtal.camp(1,42,"N12","Cant",plus=6)
La función GetAlk.camp(gr,esp,camp,dns,plus)
permite sacar la clave talla edad utilizada para convertir los datos de tallas en la distribución por edades variando como sea necesario la edad plus
y utilizar una clave alternativa si acaso.
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