DpthPrfl | R Documentation |
Crea un gráfico de perfil de distribución por profundidad de la biomasa o número de una especie o grupo de especies a partir de los datos de peso y número de la faunística tomados en una campaña
DpthPrfl(
gr,
esp,
camps,
dns = "Porc",
cor.time = TRUE,
incl2 = TRUE,
ind = "p",
es = TRUE,
ti = TRUE,
idi = "l",
xmax = NA,
nlans = TRUE,
spl = FALSE,
brks = "Sturges",
overdpth = TRUE,
tabres = TRUE
)
gr |
Grupo de la especie: 1 peces, 2 crustaceos 3 moluscos 4 equinodermos 5 invertebrados |
esp |
Código de la especie numerico o caracter con tres espacios. 999 para todas las especies del grupo |
camps |
Campañas de las que se obtiene la distribución de profundidades (XX): Demersales "NXX", Porcupine "PXX", Arsa primavera "1XX" y Arsa otoño "2XX" |
dns |
Elige el origen de las bases de datos: Porcupine "Porc" or "Pnew", Cantábrico "Cant", Golfo de Cádiz "Arsa" (únicamente para sacar datos al IBTS, no gráficos) |
cor.time |
Si T corrige las abundancias en función de la duración del lance |
ind |
Parámetro a representar, saca los datos en "p"eso o "n"úmero |
es |
Si T gráfico en castellano, si F gráfico en inglés |
ti |
Si T añade título al gráfico, el nombre de la especie en latín |
idi |
Nombre científico de la especie ("l") o nombre común ("e") |
xmax |
Valor máximo del eje x |
nlans |
Si T añade el número de lances en cada rango de profundidad |
spl |
Si T incluye una curva spline en el gráfico |
brks |
Especifica los rangos de profundidad: "norte" estratificación de Demersales, "porcupine" estratificación de Porcupine, las opciones "FD", "Sturges" y "scott" también son válidas como están implenmentadas en hist. También se pueden fijar unos límites a voluntad, si da error de hay datos fuera de los rangos (de norte o porcupine, se cogen los límites de la campaña y se fija el último rango a la prof máxima) |
overdpth |
En el caso de que, con brks=norte o porcupine de un aviso de que hay profundidades fuera de la estratificación fija el límite del estrato máximo al de la profundidad máxima detectada más 10 m, se aconseja tenerlo en T, y da error si hay profundidades fuera de brks . |
tabres |
Muestra una tabla resumen del total de lances, media y total de biomasa o número y frecuencia de la especie por estrato según el brks especificado |
DpthPrflTals
DpthPrfl(1, 50, "N08", "Cant",brks = "norte",tabres=TRUE,ind="p")
DpthPrfl(1,50,"P08","Porc",brks="porcupine",ti=TRUE)
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