In Freguglia/datacovidbr: What the Package Does (One Line, Title Case)

knitr::opts_chunk$set(
  collapse = TRUE,
  comment = "#>",
  fig.path = "man/figures/README-",
  out.width = "60%"
)

datacovidbr

O datacovidbr é um pacote em R com o objetivo de facilitar a importação e leitura dos dados da COVID-19 de fontes brasileiras e mundiais, automatizando os mecanismos de análise desses dados em R. No momento as fontes de dados disponíveis são:

Dados do Ministério da Saúde para dados brasileiros por estados e regiões.
Repositório Brasil.io para dados brasileiros por município.
Repositório CSSEGISandData/COVID-19 mantido pela Johns Hopkins University Center for Systems Science and Engineering (JHU CSSE).
Dados do infoGripe.

Algumas funções fazem download de fontes de dados quando estão disponíveis e fazem um mínimo de pré-processamento, outras obtém os dados das fontes por web-scraping.

Instalação

Pela alta demanda no momento no CRAN, que gera muita demora no processo de aceitação de novos pacotes e atualizações, o datacovidbr será mantido apenas no Github. Para instalação de pacotes disponíveis no Github, basta utilizar a função abaixo:

# install.packages("devtools")
devtools::install_github("Freguglia/datacovidbr")

Exemplo

Os dados podem ser carregados com as funções brMinisterioSaude(), brasilio(), CSSEGISandData(), infoGripe():

library(datacovidbr)
# Dados do Ministério da Saúde
est <- brMinisterioSaude()
est

# Dados do Brasil.io
mun <- brasilio()
mun

#Dados da CSSEGISandData
wor <- CSSEGISandData()
wor

Os data.frames já vem em um formato que pode ser utilizado com todas as outras ferramentas disponíveis em R, por exemplo, o ggplot2.

library(ggplot2)
ggplot(est[est$regiao != "Brasil" & is.na(est$municipio) & is.na(est$codmun),],
       aes(x = date, y = casosAcumulado, group = estado, color = regiao)) +
  geom_line() +
  scale_x_date(limits = c(as.Date("2020-03-15"),NA))