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R package to parse and order data from the AccuPAR LP-80 output files.

Instalación

Antes de instalar este paquete hay que instalar la herramienta devtools ejecutanto el siguiente comando en R studio

install.library("devtools")

Instalar el paquete para procesar datos del ceptómetro con:

devtools::install_github("IvanPrzOl/AccuPAR_LP-80_Parsing")

Descripción del archivo de salida

El ceptómetro LP-80 puede exportar datos en diferentes formatos de salida como .csv, .txt o .xls El formato .xls es un archivo de excel dos hojas:

Ejemplo de archivo

Ejemplo de archivo

La hoja "Summary Data" contiene los promedios de cada anotación guardada en el ceptómetro.

La hoja "All Data" contiene la información detalla de cada anotación que se guardó en el ceptómetro y es la hoja que nos interesa procesar.

Uso

  1. Cargar el paquete a la sesión de R con:

    library(AccuPARParsing)
    
  2. Importar la hoja "All Data" como un dataframe a R studio con el paquete readxl, xlsx o XLConnect. Ejemplo:

    library(xslx)
    cept_data <- read.xlsx("cept_file.xls",sheetIndex = 2, header = TRUE)
    
  3. Llamar a la función SubsetAnn para procesar los datos del ceptometro indicando los siguientes parámetros.

    # df, dataframe importado del archivo excel.
    # tName, Iniciales del ensayo que se desea extraer.
    # nRecords, Número de muestras tomadas por cada anotación que corresponden a cada uno de los estratos medidos.
    # segments, El número de los segmentos a extraer.
    # raw, Indica si la salida de la función contiene los promedios de cada estrato o los datos crudos.
    cept_procesado <- SubsetAnn( df = cept_data,
                                 tName = "HIB", 
                                 nRecords =3, 
                                 segments = 1:8,
                                 raw = TRUE)
    
  4. Dependiendo del valor pasado al parámetro raw (TRUE o FALSE), cept_procesado puede tener los siguientes formatos:

raw=TRUE

Salida en Raw

raw = FALSE

Salida en means



IvanPrzOl/AccuPAR_LP-80_Parsing documentation built on Nov. 19, 2022, 1:40 p.m.