In LimaRAF/plantR: Managing Species Records from Biological Collections

knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)

Introdução

Esse tutorial ...

Obtendo os registros

Antes de começar precisamos carregar o pacote usando a função library(), assumindo que você tem o pacote instalado junto ao seu R. Se você ainda não tem o pacote instalado em seu computador, siga as instruções do tutorial geral do pacote (i.e. 'plantr_tutorial.html').

library("plantR")

Definindo os critérios de busca

Para esse tutorial iremos usar como exemplo a Reserva Biológica de Duas Bocas, no município de Cariacica no Espírito Santo. Iremos baixar os registros do speciesLink (INCT) e do GBIF.

municipios <- c("Cariacica")

Baixando os registros do speciesLink e GBIF

occs_county_splk <- rspeciesLink(country = c("Brasil", "Brazil", "BR", "BRA"),
                            county = municipios,
                            Scope = "plants")
table(occs_county$country)
table(occs_county$county)

occs_county_gbif <- rgbif2(species = "Plantae",
                       n.records = 500000,
                       country = "BR",
                       stateProvince = "Espírito Santo")
table(occs_county1$country)
table(occs_county1$stateProvince)