utlede_kvalitetsindikatorer: Kvalitetsindikatorer for AblaNor

In Rapporteket/ablanor: AblaNor- Rapporteket

Kvalitetsindikatorer for AblaNor

Description

Oppdaterte versjoner av kvalitetsindikatorer. I bruk fra og med våren 2022.

Usage

utlede_dager_sensur(df, dato_sensur)

indik_overlevelse30dg(df)

indik_tamponade(df)

indik_prom_klineff(df)

indik_ferdig_komplik(df)

indik_akuttsuksess(df)

indik_pacemaker(df)

indik_avbrudd(df)

Arguments

df	data.frame med ablanor-data. Må inneholde ulike variabler for de ulike funksjonene. F.eks. forlopstype, abla_strat_av_his og komp_tamp for indikatoren "Komplikasjon tamponade for AFLI uten AV knuter".
dato_sensur	dato for sensur til overlevelsesanalyser. Anbefaler 3mnd før datadump, da det kan ta så lang tid å få overført datoen fra folkeregisteret.

Details

For hver av kvalitetsindikatorene, legge til en variabel for datagrunnlag (suffix 'data') og en for indikatoren ja/nei.

Overlevelse 30 dager etter prosedyren indik_overlevelse30dg

• nevneren indik_overlevelse30dg_data (datagrunnlag) har verdien ja dersom forløpstype er AFLI (forlopstype = 1) uten AV-knuter (abla_strat_av_his = 0) og dersom tid til sensur er over 30 dager (dager_pros_sensur_gyldig = ja]). Variabelen har verdi nei for andre forløpstyper, for kort sensur-tid. Dersom flere enn et forløp (AFLI, uten AV knuter, med gyldig tid) i et 30-dagers intervall, brukes kun nyeste forløp og alle eldre forløp har verdi indik_overlevelse_30dg = nei.

• telleren indik_overlevelse30dg har verdien ja dersom pasienten er levende 30 dager etter prosedyren, var verdien nei dersom pasienten er død 0-29 dager etter prosedyren.

indik_overlevelse30dg bruker hjelpe-funksjonen utlede_dager_sensur som lager to nye variabler dager_pros_sensur og dager_pros_sensur_gyldig. indik_overlevelse30dg inneholder antall dager fra proseyre til dødsdato for avdøde pasienter og antall dager fra proseydre til sensurdato (dato for nedlastet datadump) for levende pasienter. indik_overlevelse30dg_gyldig har verdien nei/manglende dersom for kort sensur-tid eller datoer er manglende.

Tamponade i forbindelse med prosedyren indik_tamponade()

• nevneren indik_tamponade_data (datagrunnlag) har verdien ja dersom forløpstype er AFLI (forlopstype = 1) uten AV-knuter (abla_strat_av_his = 0).

• telleren indik_tamponade har verdien ja dersom indik_tamp_data = ja og komp_tamp = 1, verdien nei dersom indik_tamp_data = ja og komp_tamp = 0, verdien manglende dersom indik_tamp_data = ja og komp_tamp er manglende, og verdien NA dersom forløpet ikke er i datagrunnlaget (indik_tamp_data = nei).

Klinisk effekt 12 måneder etter prosedyren indik_prom_klineff

• nevneren indik_prom_klineff_data (datagrunnlag) har verdien ja dersom forløpstype er AFLI (forlopstype = 1) uten AV-knuter (abla_strat_av_his = 0) og dersom oppfølgingsskjema er utfylt. Variabelen har verdi nei for andre forløpstyper eller manglende oppfølging.

• telleren indik_prom_klineff har verdien ja dersom pasienten har svart Helt bra, Mye bedre eller Bedre sammenlignet med før prosedyre. Variabelen har verdien nei dersom pasienten svarer Uforandret eller Verre. Variabelen har verdien manglende dersom oppfølgingsskjemaet er fylt ut, men spørsmålet om klinisk effekt er ubesvart.

Ferdig utfylt komplikasjonsskjema indik_ferdig_komplik

• nevneren indik_ferdig_komp_data har verdien ja for alle prosedyrer.

• tellerne indik_ferdig_komp har verdien ja dersom spørsmålet komp_janei er utfylt med en av verdiene ja eller nei, indik_ferdig_komp har verdien nei dersom komp_janei er manglende.

Vellykket prosedyre (akutt suksess) indik_akuttsuksess

• nevneren indik_akuttsuksess_data (datagrunnlag) har verdiene AFLI, VT, AVRT eller AVNRT avhenging av forløpstype (forlopstype og aryt_i47_1_underkat) og kun dersom pasienten er abladert (abla_strat_ingen =0) og uten AV-knuter (abla_strat_av_his = 0). Variabelen har verdi nei for andre forløpstyper, ikke abladert, eller AV-knuter.

• telleren indik_akuttsuksess har verdien ja dersom akutt_suksess = 1. Variabelen har verdien nei dersom akutt_suksess = 0 eller 2, og verdien manglende dersom akutt_suksess mangler.

Behov for pacemaker indik_pacemaker

• nevneren indik_pacemaker_data (datagrunnlag) har verdien ja dersom forløpstype er SVT (forlopstype = 3) uten AV-knuter (abla_strat_av_his = 0). Variabelen har verdi nei for andre forløpstyper.

• telleren indik_pacemaker har verdien ja dersom pasienten har hatt komplikasjon AV-blokk etterfulgt av innsetting av pacemaker (komp_avblokk_pm = 1). Variabelen har verdien nei eller og verdien manglende dersom komp_avblokk_pm mangler.

Prosedyreavbrudd på grunn av tekniske problemer eller komplikasjoner indik_avbrudd()

• nevneren indik_avbrudd_data (datagrunnlag) har verdiene AFLI eller VT, SVT, AV-knuter avhengig av forløpstype, og verdien nei dersom forløpstype EFU.

• telleren indik_avbrudd har verdien ja dersom indik_avbrudd_data = AFLU eller VT, SVT, AV-knuter og abla_strat_ingen_arsak = 4(tekniske problemer) eller 5(Komplikasjon), verdien nei dersom indik_avbrudd_data = ja og ingen avbrudd eller avbrudd av andre årsaker. Verdien NA dersom forløpet ikke er i datagrunnlaget.

Examples

# OVERLEVELSE
data.frame(
    patient_id = rep(1, 3),
    mceid =  1:3,
    forlopstype = rep(1, 3),
    abla_strat_av_his = rep(0, 3),
    dato_pros = as.Date(c(rep("2020-10-15",2),"2021-10-15"),
                        format = "%Y-%m-%d"),
    deceased = c(0, 1, 0),
    deceased_date = as.Date(c(NA, "2020-10-18", NA),
                        format = "%Y-%m-%d")) %>%
ablanor::utlede_dager_sensur(
    df=.,
    dato_sensur = as.Date("2021-10-20", format = "%Y-%m-%d")) %>%
ablanor::indik_overlevelse30dg()

# TAMPONADE
 df <- data.frame(forlopstype = c(2, 3, 4, NA, 1, 1, 1, 1),
                  abla_strat_av_his = c(NA, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0),
                  komp_tamp = c(rep(0, 6), 1, 1))
ablanor::indik_tamponade(df = df)

# KLINISK EFFEKT
df <- data.frame(forlopstype = c(2, 3, 4, NA, 1, 1, 1, 1),
                  abla_strat_av_his = c(NA, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0),
                  followup_status = c(0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1),
                  q2 = c(NA, NA, NA, 1:5))
ablanor::indik_prom_klineff(df = df)

# FERDIG UTFYLT KOMPLIKASJONER
ablanor::indik_ferdig_komplik(df = data.frame(komp_janei = c(NA, 0, 1)))

# AKUTT SUKSESS
df <- data.frame(
   abla_strat_ingen = c(1, NA, rep(0, 18)),
   abla_strat_av_his = c(0, 0, 1, NA,  rep(0, 16)),
   forlopstype = c(rep(1, 4), NA, rep(1, 5), rep(2, 3), rep(3, 6), 4),
   aryt_i47_1_underkat = c(rep(NA, 13), NA, 1:5, NA),
   akutt_suksess = c(rep(NA, 5), NA, 9, 0, 1, 2, 0:2, 0:2, 0:2 , 1))
ablanor::indik_akuttsuksess(df)



#PACEMAKERBEHOV
df <- data.frame(forlopstype = c(2, 3, 4, NA, 1, 3, 3, 3),
                  abla_strat_av_his = c(NA, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0),
                  komp_avblokk_pm = c(NA, NA, NA, 0, 1, 0, 1, 0))
ablanor::indik_pacemaker(df = df)

# AVBRUDD
 df <- data.frame(forlopstype = c(3, 4, NA, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1),
                  abla_strat_av_his = c(1, 0, 0, 1, NA, 0, 0, 0, 0, 0, 0),
                  abla_strat_ingen = c(rep(0, 5), NA,  1, 1,1, 1, 0),
                  abla_strat_ingen_arsak = c(rep(NA, 6), 1, 4,5, NA, NA))
 ablanor::indik_avbrudd(df = df)

Rapporteket/ablanor documentation built on Feb. 27, 2025, 8:26 p.m.