import_biologie: Importeer biologie-meetwaarden

In RedTent/JT: My Personal Functions

Description

De functie helpt bij het importeren van biologische data. De functie leest de kolom datum als Date. Verder wordt er een kolom monster_id toegevoegd op basis van meetpunt, datum en methode.

Usage

import_biologie(biologie_csv = "data/biologie.csv")

import_biologie_stadia(biologie_csv = "data/biologie.csv")

Arguments

biologie_csv

Een characterstring met het pad naar het te importeren bestand. Het bestand moet in csv-formaat zijn met ; als scheidingsteken en , als scheidingsteken. Default is "data/biologie.csv". Het is ook mogelijk om een zip-bestand in te lezen waar het csv-bestand in zit.

Details

Er is enige vrijheid t.a.v. de inhoud van het bestand. De functie verwacht ten minste een kolom mp, datum, methode, stadium en stadiumwaarde. Een standaard bestand heeft gewoonlijk de kolommen:

• mp Code met de aanduiding van het meetpunt

• datum Datum in het format dd-mm-yyyy hh:mm:ss

• taxatype Type taxon cf. aquo

• naam Latijnse naam, conform TWN

• nednaam Nederlandse naam indien beschikbaar

• waarde Meetwaarde (voor alle stadia gezamenlijk)

• stadium Code voor het stadium, indien beschikbaar

• stadiumwaarde Meetwaarde voor het stadium, indien beschikbaar

• eenheid Eenheid van de meetwaarden

• taxniv Code voor het taxonomisch niveau

Value

Een dataframe met biologische meetwaarden.

Functions

• import_biologie: Importeer biologische meetwaarden zonder stadiumwaarden

• import_biologie_stadia: Importeer biologische meetwaarden met stadium informatie

Examples

## Not run: 

biologie <- import_biologie()
biologie_met_stadium <- import_biologie_stadia()


## End(Not run)

RedTent/JT documentation built on May 10, 2019, 9:58 a.m.