In ReseauBiodiversiteQuebec/tableaudelta: Tableau-delta

knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)

1. Import data

Espèces invasives

# Liste d'espèces invasives selon le programme sentinelle
espece_invasives = data.frame(nom_scientifique = c(## Insectes
                                                  "Harmonia axyridis",
                                                  "Anoplophora glabripennis",
                                                  "Popillia japonica",
                                                  ## Mollusques & Crustacés
                                                  "Bythotrephes longimanus",
                                                  "Eriocheir sinensis",
                                                  "Hemimysis anomala",
                                                  "Orconectes rusticus",
                                                  "Dreissena bugensis",
                                                  "Dreissena polymorpha",
                                                  "Potamopyrgus antipodarum",
                                                  "Corbicula fluminea",
                                                  "Echinogammarus ischnus",
                                                  "Bellamya chinensis",
                                                  ## Oiseaux et mammifères
                                                  "Cervus elaphus",
                                                  "Cygnus olor",
                                                  ## Reptiles et poissons
                                                  "Ctenopharyngodon idella",
                                                  "Lepomis cyanellus",
                                                  "Pseudorasbora parva",
                                                  "Scardinius erythrophthalmus",
                                                  "Neogobius melanostomus",
                                                  "Carassius auratus",
                                                  "Tinca tinca",
                                                  "Trachemys scripta elegans",
                                                  "Channa", # Tête de serpent
                                                  "Parachanna", # Tête de serpent
                                                  ## Plantes flottantes
                                                  "Trapa natans",
                                                  "Nymphoides peltata",
                                                  "Hydrocharis morsus-ranae",
                                                  "Eichhornia crassipes",
                                                  "Pistia stratiotes",
                                                  "Salvinia", # Genre
                                                  ## Plantes submergées
                                                  "Cabomba caroliniana",
                                                  "Brazilian waterweed",
                                                  "Hydrilla verticillata",
                                                  "Myriophyllum aquaticum",
                                                  "Myriophyllum spicatum",
                                                  "Potamogeton crispus",
                                                  ## Plantes émergentes
                                                  "Phalaris arundinacea",
                                                  "Butomus umbellatus",
                                                  "Glyceria maxima",
                                                  "Iris pseudacorus",
                                                  "Rorippa amphibia",
                                                  "Phragmites australis australis",
                                                  "Lythrum salicaria",
                                                  "Stratiotes aloides",
                                                  ## Plantes de milieux terrestres
                                                  "Alliaria petiolata",
                                                  "Anthriscus sylvestris",
                                                  "Heracleum sphondylium",
                                                  "Heracleum mantegazzianum",
                                                  "Symphytum officinale",
                                                  "Vincetoxicum rossicum",
                                                  "Vincetoxicum nigrum",
                                                  "Aegopodium podagraria",
                                                  "Acer platanoides",
                                                  "Acer negundo",
                                                  "Galium mollugo",
                                                  "Impatiens glandulifera",
                                                  "Miscanthus sacchariflorus",
                                                  "Frangula alnus",
                                                  "Rhamnus carthartica",
                                                  "Ulmus pumila",
                                                  "Pastinaca sativa",
                                                  "Petasites japonicus",
                                                  "Reynoutria xbohemica",
                                                  "Reynoutria sachalinensis",
                                                  "Reynoutria japonica",
                                                  "Helianthus tuberosus",
                                                  "Valeriana officinalis"),
                                no_ref = NA_integer_)

# Match ref number
# - ITIS ?
# - GBIF ?