fibdl_listflor_qualify: Qualification des listes floristiques

In SebastienBoutry/IBDL: Outil de calcul l'Indice Biologique Diatomées en Lac

Qualification des listes floristiques

Description

Qualification des listes floristiques

Usage

fibdl_listflor_qualify(
  data,
  seuil_nbr_valves = 350,
  seuil_pour_valves_sp = 0.5,
  seuil_pour_taxons_indiciels = 0.75,
  table_tax_alerts = IBDL:::Table_taxons_alertes
)

Arguments

data	tableau representant la liste floristique
seuil_nbr_valves	nombre de valves compte dans le prelevement. Dans la norme, il est demande de compter 400 valves.
seuil_pour_valves_sp	seuil en pourcentage de valves determinees au rang taxonomique espece dans le prelevement. Petite specificite, on ne prend pas compte le code taxon ADMI (complexe taxonomique).
seuil_pour_taxons_indiciels	seuil en pourcentage des taxons indiciels dans le prelevement
table_tax_alerts	tableau de reference au format binaire des taxons d'alertes et indiciels, par defaut Table_taxons_alertes (table interne embarquee)

Value

tableau avec les informations liees au prelevement. La colonne validation renseigne la selection finale.

Examples

list_flor <- read.csv2(system.file("listflor.csv", package = "IBDL"),fileEncoding = "utf-8") %>%
IBDL::fibdl_listflor_transcode()
fibdl_listflor_qualify(data=list_flor)

SebastienBoutry/IBDL documentation built on May 31, 2024, 2:29 a.m.