README.md

In TheoreticalEcosystemEcology/rcoleo: rcoleo

Documentation du paquet rcoleo

rcoleo un paquet R permettant le retrait et l'analyse des données collectées dans le cadre du programme de suivi de la biodiversité (BdQc).

Ce paquet R expose les services RESTFull de l'API de Coléo. Colée est un système d'information sur la biodiversité du Québec développé par le laboratoire d'Écologie Intégrative de l'Université de Sherbrooke.

Pour en savoir davantage...

Installer le paquet rcoleo

devtools::install_github("TheoreticalEcosystemEcology/rcoleo")

S'authentifier auprès de l'API

Stratégie 1: Mise en cache

Il est fortement recommandé de mettre en cache votre jeton d'accès (jeton d'accès stocké dans un fichier rds) afin de s'assurer qu'il ne soit pas visible ou transmis avec votre code à un autre utilisateur. Ce jeton d'accès est unique et révocable.

Pour cela, il vous suffit simplement d'enregistrer le jeton d'accès directement dans votre répertoire/projet R utilisant la librairie rcoleo.

getwd()
saveRDS("7f8df438e1be96a18436e9dab5d97d68ed0e0441d9b68f59e0ce631b2919f3aa",".httr-oauth")

Le jeton d'accès est un exemple ici et n'est aucunement valide.

Stratégie 2: Argument

Vous pouvez également passer votre jeton d'accès comme un argument pour chacune des fonctions GET:

sites <- get_sites(token="7f8df438e1be96a18436e9dab5d97d68ed0e0441d9b68f59e0ce631b2919f3aa")

Le jeton d'accès est un exemple ici et n'est aucunement valide.

Roadmap to 2.0.0

• [ ] Use the login page to stored the token
• [ ] Export DwC-A

TheoreticalEcosystemEcology/rcoleo documentation built on Oct. 20, 2020, 6:42 p.m.