find_peaks: Funkcja do szukania pików fluorescencji w danych z time lapse

In astrzalka/findpeaks: findpeaks

Funkcja do szukania pików fluorescencji w danych z time lapse

Description

Funkcja do szukania pików fluorescencji w danych z time lapse

Usage

find_peaks(
  ramka,
  s = 2,
  m = FALSE,
  procent = 1,
  threshold = 10,
  back = "No",
  lapse = 10,
  filter_local = FALSE,
  filter_local_int = 1.1,
  filter_local_width = 2,
  ...
)

Arguments

ramka	tabela z danymi (kolumna 1 - odległości, 2 - intensywność fluorescencji)
s	sigma - dokładność dopasowania pików, im wyższa tym mniej znajdzie
m	jak ma wygładzać dane, przy FALSE znajduje więcej pików
procent	ile tła ma odjąć, rozsądny zakres to od 1(całość) do 0.01 (1 procent)
threshold	powyżej jakiego poziomu ma zaznaczać piki, procent wysokości najwyższego piku
back	"No" odejmie tylko procent tła, "minimum" zostanie odjęta wartość minimalna, "Peaks" zostanie użyta funkcja obecna w pakiecie Peaks
lapse	czas pomiędzy klatkami
...

Value

ramkę danych zawierającą pozycje wszystkich pików razem z czasem i intensywnośćią fluorescencji

astrzalka/findpeaks documentation built on Sept. 2, 2022, 6:37 p.m.