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In brendanf/spoar: SIMD Partial Order Alignment in R

spoaConsensus does not regress

"CATAAAAGAACGTAGTCGCCTGTCCGTAATCTGTCGATTCACCGGAAGAGGACCCGTAAAGTGATAATGATATCATACAT"

"CATAAAAGAACGTAGTCGCCTGTCCGTAACCTGTCGGATTCACCGGAAGAGGACCCGTAAAGTGATAATGATTATCATCTACAT"

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spoaAlign does not regress

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weighted spoaConsensus does not regress

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weighted spoaAlign does not regress

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brendanf/spoar documentation built on Dec. 19, 2021, 11:43 a.m.