TODO/README.md

In cayek/TESS3_encho_sen: Inference of Spatial Population Genetic Structure

Olivier

-

Kevin

• option names must be consistent with name in article (mettre APLS et AQP)
• check function : control class : "matrix" %in% class(Q) etc...
• option chisq = TRUE (use chisq to compute pvalue)
• Documentation : TODOC comments and others...
• Release sur CRAN : http://r-pkgs.had.co.nz/release.html + Release sur github
• plot with ggplot and add to vignette
• error : envoyer vers issus de github

Vignette

• css
• publish on BioShock38 site

Matrice de likelihood :

• Trouver des data au format vcf avec la likelihood
• Faire la vignette de cette feature

gplot

• implement all graphics function with gplot (see TESS3Article figures)

Geodesic distance

• Use geodesic distance to compute geographic distance between indiv rather than euclidean distance

Flora

• pie chart

Someone

• vignette for different data format files

cayek/TESS3_encho_sen documentation built on July 4, 2023, 7:51 p.m.