Man pages for covid19br/now_fcts
Auxiliary functions for analyzing COVID-19 data from different sources
| beta.cumsum | Médias e ICs das probabilidades de notificação cumulativa a... |
| beta.summary | Médias e ICs das probabilidades de notificação a cada dia |
| check.geocode | Função para extrair nome do path a partir do geocode |
| classifyAgeFast | classifyAgeFast |
| countByAgeClass | countByAgeClass |
| count.lines | Conta número de linhas de um arquivo de texto, zipado ou... |
| diazero | Corta uma série temporal no dia zero. |
| dt.rw | Tempo de duplicação ao longo de uma serie temporal de n de... |
| estima.not | Estima numero de notificacoes por dia a partir de um vetor de... |
| estimate.R0 | Estimating R accounting for uncertainty on the serial... |
| existe.nowcasting | Função para checar se existem dados de nowcasting para a... |
| existe.nowcasting2 | Função para checar se existem dados de nowcasting para a... |
| fill.dates | Fill dates |
| fillNowcastedLines | Using Nowcast and survival analysis to complete covid table... |
| fillNowcastedLinesFast | fillNowcastedLinesFast |
| filtros.esusve | Title |
| filtros.sivep | Title |
| fitP.exp | Ajusta um modelo exponencial para n de casos em função de n... |
| fixUTIDates | Title |
| forecast.exponential | Forecast usando regressão Poisson sobre série dos casos... |
| formata.now.df | Funcao para formatar data.frame para o grafico de nowcasting... |
| gera.nowcasting | Função para gerar nowcasting |
| getCurrentInBed | getCurrentInBed |
| get.data.base | Extrai as datas de um vetor (para pegar a última data ver... |
| get.data.base2 | Extrai a data mais recente de nowcasting por localidade |
| get.geocode | get geocode |
| get.last.date | Pega a data mais recente da base de dados |
| getProbDeath | Probabilidade de morte de hospitalizado comum, e em UTI, |
| getProbUTI | getProbUTI |
| getTimes | getTimes |
| inv.logit | Inverso da logit |
| join_nowcasting | Join nowcasting |
| makeHospitalTable | makeHospitalTable |
| makeNamedList | makeNamedList |
| na.zero | substitui NAS por zeros |
| NobBS.posterior | NobBS.posterior |
| NobBS.posterior2 | NobBS.posterior2 |
| nowcasting.cumsum | Médias e ICs das estimativas de nowcasting cumulativa a cada... |
| nowfcts-package | nowfcts: Auxiliary functions for analyzing COVID-19 data from... |
| now.proj | Funcao para projecao do n acumulado de casos por data do... |
| pipe | Pipe operator |
| plotEstimateR0 | Funcao para plot do R efetivo |
| plotNowcastAcumulado | Funcao para fazer o plot de nowcasting acumulado, com valores... |
| plotNowcastDiario | Funcao para fazer plot nowcast de casos diarios (notificado e... |
| plotTempoDupl | Title |
| plotTimesValidation | plotTimesValidation |
| posteriors | Estimate posterior probabilities for nowcasting AND SI... |
| preenche.now | Preenche NA's iniciais do vetor de estimado pelo nowcasting |
| prepara.dados | Função para automatizar a preparação dos dados de nowcasting... |
| read.esus.generica | Função para ler base da eSUS-VE |
| read.sivep | Função para ler base da sivep |
| read.sivep.generica | Função para ler base da sivep |
| Re.com.data | Calcula R efetivo sobre a estimativas de nowcasting... |
| re.nowcasting | Calcula R efetivo sobre as trajetórias de nowcasting... |
| rwaittime | rwaittime |
| rwaittime_age | rwaittime_age |
| rwaittime_posterior_age | rwaittime_posterior_age |
| tabelas.web | Funcao para gerar tabelas que vao para o site |
| themeObservatorio | Theme to use following Observatorio COVID BR website... |
| write.notificacoes.data | Formata as tabelas de numero de casos por data de notificacao... |
| write.nowcasting | Writes nowcasting |
| zoo2df | zoo2df funcao para converter zoo em df |
