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In curso-r/mcUFSCar2015:
Minicurso R: Ferramentas práticas
Bem-vindo ao minicurso sobre R da SEst-UFSCar 2015!
Este minicurso é voltado a pessoas que já têm algum background básico com a
linguagem R, interessadas em aumentar a produtividade nas análises e tornar
seus trabalhos reproduzíveis.
A filosofia do minicurso é que um estatístico precisa ter liberdade
e transparência ao realizar suas análises, mas também precisa focar na
modelagem, gastando o menor tempo possível na organização dos arquivos
e na manipulação de dados.
Programa
O minicurso tem apenas 6 horas de duração e abordará uma quantidade razoável de
tópicos, portanto terá um caráter bastante introdutório e superficial. Vamos
discutir sobre
- manipulação de dados com
dplyr e tidyr (2h),
- visualização de dados com
ggplot2 (1h),
- elaboração de relatórios com
rmarkdown e knitr (1h) e
- desenvolvimento de pacotes com
devtools (2h)
No decorrer do minicurso também apresentaremos algumas ferramentas que ajudam
muito em diversas tarefas dentro e fora do R, que geralmente perdemos muito
tempo:
stringr e lubridade para manipulação de textos e datasreadr, readxl e haven para leitura de dadosrvest e xml2 para web scrapinggit e github para versionamento e compartilhamento de código
Como é possível observar, o curso é fortemente baseado nos pacotes do cientista
chefe do RStudio Hadley Wickham. Para complementar o conteúdo do curso,
recomendamos a leitura dos livros
- Advanced R para informações gerais e avançadas sobre R.
- R packages para desenvolvimento de pacotes no R.
Pré-requisitos
- Funcionalidades básicas do R.
- R como calculadora
- Flow control:
if, else, for, while etc.
- Vetorização
- Leitura de dados
- Utilização do RStudio.
- Instalação do RStudio
- Criação de projetos
Caso tenha dificuldades, recomendamos a leitura do material básico
do Curso R neste link. É rápido!
Setup
Utilizaremos as seguintes configurações (não se assuste)
Session info ------------------------------------------------------------------
setting value
version R version 3.2.2 (2015-08-14)
system x86_64, linux-gnu
ui RStudio (0.99.667)
language en_US
collate en_US.UTF-8
tz <NA>
Packages ----------------------------------------------------------------------
package * version date source
assertthat 0.1 2013-12-06 CRAN (R 3.2.0)
BradleyTerry2 1.0-6 2015-02-09 CRAN (R 3.2.0)
brglm 0.5-9 2013-11-08 CRAN (R 3.2.0)
car 2.1-0 2015-09-03 CRAN (R 3.2.2)
caret * 6.0-52 2015-07-17 CRAN (R 3.2.2)
codetools 0.2-14 2015-07-15 CRAN (R 3.2.2)
colorspace 1.2-6 2015-03-11 CRAN (R 3.2.0)
curl 0.9.3 2015-08-25 CRAN (R 3.2.2)
DBI 0.3.1 2014-09-24 CRAN (R 3.2.0)
devtools * 1.8.0 2015-05-09 CRAN (R 3.2.2)
digest 0.6.8 2014-12-31 CRAN (R 3.2.0)
dplyr * 0.4.3.9000 2015-09-04 Github (hadley/dplyr@5489216)
foreach 1.4.2 2014-04-11 CRAN (R 3.2.0)
ggplot2 * 1.0.1.9003 2015-09-01 Github (hadley/ggplot2@816d789)
git2r 0.11.0 2015-08-12 CRAN (R 3.2.2)
gtable 0.1.2 2012-12-05 CRAN (R 3.2.0)
gtools 3.5.0 2015-05-29 CRAN (R 3.2.2)
htmltools 0.2.6 2014-09-08 CRAN (R 3.2.0)
httr * 1.0.0 2015-06-25 CRAN (R 3.2.2)
iterators 1.0.7 2014-04-11 CRAN (R 3.2.0)
knitr * 1.11 2015-08-14 CRAN (R 3.2.2)
lattice * 0.20-33 2015-07-14 CRAN (R 3.2.1)
lme4 1.1-9 2015-07-05 Github (lme4/lme4@a8538aa)
lubridate * 1.3.3 2013-12-31 CRAN (R 3.2.0)
magrittr 1.5 2014-11-22 CRAN (R 3.2.0)
MASS 7.3-44 2015-08-30 CRAN (R 3.2.2)
Matrix 1.2-2 2015-07-08 CRAN (R 3.2.1)
MatrixModels 0.4-1 2015-08-22 CRAN (R 3.2.2)
memoise 0.2.1 2014-04-22 CRAN (R 3.2.0)
mgcv 1.8-7 2015-07-23 CRAN (R 3.2.1)
minqa 1.2.4 2014-10-09 CRAN (R 3.2.0)
munsell 0.4.2 2013-07-11 CRAN (R 3.2.0)
nlme 3.1-122 2015-08-19 CRAN (R 3.2.2)
nloptr 1.0.4 2014-08-04 CRAN (R 3.2.0)
nnet 7.3-11 2015-08-30 CRAN (R 3.2.2)
pbkrtest 0.4-2 2014-11-13 CRAN (R 3.2.0)
plyr * 1.8.3.9000 2015-08-10 Github (hadley/plyr@9d8294e)
quantreg 5.19 2015-08-31 CRAN (R 3.2.2)
R6 2.1.1 2015-08-19 CRAN (R 3.2.2)
Rcpp 0.12.0 2015-07-25 CRAN (R 3.2.1)
reshape2 1.4.1 2014-12-06 CRAN (R 3.2.0)
rmarkdown * 0.8 2015-08-30 CRAN (R 3.2.2)
rsconnect 0.4.1.4 2015-08-28 Github (rstudio/rsconnect@295276c)
rversions 1.0.2 2015-07-13 CRAN (R 3.2.2)
rvest * 0.2.0.9000 2015-09-02 Github (hadley/rvest@d482ed0)
scales * 0.3.0.9000 2015-09-09 Github (hadley/scales@7fc502c)
SparseM 1.7 2015-08-15 CRAN (R 3.2.2)
stringi 0.5-5 2015-06-29 CRAN (R 3.2.2)
stringr * 1.0.0.9000 2015-09-04 Github (hadley/stringr@5f9319b)
tidyr * 0.3.1.9000 2015-09-14 Github (hadley/tidyr@49b30ea)
xml2 * 0.1.2 2015-09-01 CRAN (R 3.2.2)
yaml 2.1.13 2014-06-12 CRAN (R 3.2.0)
Além disso, teremos o programa pandoc já instalado.
Local e data
Dias 17, 18 e 19 de setembro de 2015, das 10h às 12h.
Universidade Federal de São Carlos.
Centro de Ciências Exatas e Tecnológicas - Departamento de Estatística.
Via Washington Luís, km 235. Bairro Monjolinho, São Carlos, SP, Brasil.
CEP 13.565-905.
curso-r/mcUFSCar2015 documentation built on May 14, 2019, 12:51 p.m.
R Package Documentation
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Minicurso R: Ferramentas práticas
Bem-vindo ao minicurso sobre R da SEst-UFSCar 2015!
Este minicurso é voltado a pessoas que já têm algum background básico com a
linguagem R, interessadas em aumentar a produtividade nas análises e tornar
seus trabalhos reproduzíveis.
A filosofia do minicurso é que um estatístico precisa ter liberdade e transparência ao realizar suas análises, mas também precisa focar na modelagem, gastando o menor tempo possível na organização dos arquivos e na manipulação de dados.
Programa
O minicurso tem apenas 6 horas de duração e abordará uma quantidade razoável de tópicos, portanto terá um caráter bastante introdutório e superficial. Vamos discutir sobre
- manipulação de dados com
dplyretidyr(2h), - visualização de dados com
ggplot2(1h), - elaboração de relatórios com
rmarkdowneknitr(1h) e - desenvolvimento de pacotes com
devtools(2h)
No decorrer do minicurso também apresentaremos algumas ferramentas que ajudam muito em diversas tarefas dentro e fora do R, que geralmente perdemos muito tempo:
stringrelubridadepara manipulação de textos e datasreadr,readxlehavenpara leitura de dadosrvestexml2para web scrapinggitegithubpara versionamento e compartilhamento de código
Como é possível observar, o curso é fortemente baseado nos pacotes do cientista chefe do RStudio Hadley Wickham. Para complementar o conteúdo do curso, recomendamos a leitura dos livros
- Advanced R para informações gerais e avançadas sobre R.
- R packages para desenvolvimento de pacotes no R.
Pré-requisitos
- Funcionalidades básicas do R.
- R como calculadora
- Flow control:
if,else,for,whileetc. - Vetorização
- Leitura de dados
- Utilização do RStudio.
- Instalação do RStudio
- Criação de projetos
Caso tenha dificuldades, recomendamos a leitura do material básico do Curso R neste link. É rápido!
Setup
Utilizaremos as seguintes configurações (não se assuste)
Session info ------------------------------------------------------------------
setting value
version R version 3.2.2 (2015-08-14)
system x86_64, linux-gnu
ui RStudio (0.99.667)
language en_US
collate en_US.UTF-8
tz <NA>
Packages ----------------------------------------------------------------------
package * version date source
assertthat 0.1 2013-12-06 CRAN (R 3.2.0)
BradleyTerry2 1.0-6 2015-02-09 CRAN (R 3.2.0)
brglm 0.5-9 2013-11-08 CRAN (R 3.2.0)
car 2.1-0 2015-09-03 CRAN (R 3.2.2)
caret * 6.0-52 2015-07-17 CRAN (R 3.2.2)
codetools 0.2-14 2015-07-15 CRAN (R 3.2.2)
colorspace 1.2-6 2015-03-11 CRAN (R 3.2.0)
curl 0.9.3 2015-08-25 CRAN (R 3.2.2)
DBI 0.3.1 2014-09-24 CRAN (R 3.2.0)
devtools * 1.8.0 2015-05-09 CRAN (R 3.2.2)
digest 0.6.8 2014-12-31 CRAN (R 3.2.0)
dplyr * 0.4.3.9000 2015-09-04 Github (hadley/dplyr@5489216)
foreach 1.4.2 2014-04-11 CRAN (R 3.2.0)
ggplot2 * 1.0.1.9003 2015-09-01 Github (hadley/ggplot2@816d789)
git2r 0.11.0 2015-08-12 CRAN (R 3.2.2)
gtable 0.1.2 2012-12-05 CRAN (R 3.2.0)
gtools 3.5.0 2015-05-29 CRAN (R 3.2.2)
htmltools 0.2.6 2014-09-08 CRAN (R 3.2.0)
httr * 1.0.0 2015-06-25 CRAN (R 3.2.2)
iterators 1.0.7 2014-04-11 CRAN (R 3.2.0)
knitr * 1.11 2015-08-14 CRAN (R 3.2.2)
lattice * 0.20-33 2015-07-14 CRAN (R 3.2.1)
lme4 1.1-9 2015-07-05 Github (lme4/lme4@a8538aa)
lubridate * 1.3.3 2013-12-31 CRAN (R 3.2.0)
magrittr 1.5 2014-11-22 CRAN (R 3.2.0)
MASS 7.3-44 2015-08-30 CRAN (R 3.2.2)
Matrix 1.2-2 2015-07-08 CRAN (R 3.2.1)
MatrixModels 0.4-1 2015-08-22 CRAN (R 3.2.2)
memoise 0.2.1 2014-04-22 CRAN (R 3.2.0)
mgcv 1.8-7 2015-07-23 CRAN (R 3.2.1)
minqa 1.2.4 2014-10-09 CRAN (R 3.2.0)
munsell 0.4.2 2013-07-11 CRAN (R 3.2.0)
nlme 3.1-122 2015-08-19 CRAN (R 3.2.2)
nloptr 1.0.4 2014-08-04 CRAN (R 3.2.0)
nnet 7.3-11 2015-08-30 CRAN (R 3.2.2)
pbkrtest 0.4-2 2014-11-13 CRAN (R 3.2.0)
plyr * 1.8.3.9000 2015-08-10 Github (hadley/plyr@9d8294e)
quantreg 5.19 2015-08-31 CRAN (R 3.2.2)
R6 2.1.1 2015-08-19 CRAN (R 3.2.2)
Rcpp 0.12.0 2015-07-25 CRAN (R 3.2.1)
reshape2 1.4.1 2014-12-06 CRAN (R 3.2.0)
rmarkdown * 0.8 2015-08-30 CRAN (R 3.2.2)
rsconnect 0.4.1.4 2015-08-28 Github (rstudio/rsconnect@295276c)
rversions 1.0.2 2015-07-13 CRAN (R 3.2.2)
rvest * 0.2.0.9000 2015-09-02 Github (hadley/rvest@d482ed0)
scales * 0.3.0.9000 2015-09-09 Github (hadley/scales@7fc502c)
SparseM 1.7 2015-08-15 CRAN (R 3.2.2)
stringi 0.5-5 2015-06-29 CRAN (R 3.2.2)
stringr * 1.0.0.9000 2015-09-04 Github (hadley/stringr@5f9319b)
tidyr * 0.3.1.9000 2015-09-14 Github (hadley/tidyr@49b30ea)
xml2 * 0.1.2 2015-09-01 CRAN (R 3.2.2)
yaml 2.1.13 2014-06-12 CRAN (R 3.2.0)
Além disso, teremos o programa pandoc já instalado.
Local e data
Dias 17, 18 e 19 de setembro de 2015, das 10h às 12h.
Universidade Federal de São Carlos. Centro de Ciências Exatas e Tecnológicas - Departamento de Estatística.
Via Washington Luís, km 235. Bairro Monjolinho, São Carlos, SP, Brasil. CEP 13.565-905.
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