knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)

這是一個資料結構為phyloseq的菌相分析套件. 有一些函數會運用其他軟體及資料庫, 如mothur, userach, greengene等等, 使用時請先安裝.

安裝本套件

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("phyloseq")
biocLite("ShortRead")
biocLite("DirichletMultinomial")
require(devtools)
install_github("mhahsler/rBLAST")
install_github("hsiujho/distRcpp")
install_github("hsiujho/BacteriaIden")


hsiujho/BacteriaIden documentation built on May 17, 2019, 5:55 p.m.