README.md

In lenaringstado/SoknadNSMoppg: Oppgave

title: 'Veiledning' author: 'Intervjukomiteen, SKDE' date: '19. juni 2019' output: html_document: keep_md: yes

Lag en resultattjeneste i R-Shiny

En resultattjeneste er en interaktiv løsning hvor man kan se på/leke med resultater for sine data. Det er utarbeidet et templat (en mal) i Shiny som man tar utgangspunkt i for å lage en interaktiv resultattjeneste.

Beskrivelsen under er ikke nødvendigvis utfyllende og forutsetter kjennskap til RStudio. Det er også en fordel med litt kjennskap til bruk av git og GitHub. Som en ekstra støtte anbefales R packages av Hadley Wickham og spesielt beskrivelsen av git og GitHub.

Prøv templatet

1. Installér pakken SoknadNSMoppg i RStudio (devtools::install_github("lenaringstado/SoknadNSMoppg"))
2. Hent ned prosjektet SoknadNSMoppg til RStudio (for mer info, se her) (Hvis du ikke klarer å sette opp en direkte kobling til github kan du kopiere filene til din datamaskin, pakke de ut og installere pakken.)
3. Åpne fila inst/shinyApps/app1/ui.R og start Shiny-applikasjonen ("Run App")
4. Navigér i applikasjonen for å se på struktur og farger (innhold mangler)

Last data

1. Åpne fila R/GetFakeRegData.R
2. Se at funksjonen returnerer et datasett.
3. Prøv funksjonen fra kommandolinja (Console i RStudio), e.g. df <- getFakeRegData()
4. Sjekk at du får returnert ei dataramme med X observasjoner for Y variabler, e.g. attributes(df)

Lag innhold i Shiny-applikasjonen, steg 1

Utgangspunket for de neste stegene er bruk av det innebygde datasettet "mtcars".

1. I shiny-applikasjonen, navigér til arkfanen "Figur og tabell"
2. Åpne fila inst/shinyApps/app1/ui.R
3. Bla ned til linja tabPanel("Figur og tabell"
4. Kommenter inn linjene under, lagre fila og last applikasjonen på nytt ("Reload App")
5. Sjekk at det er kommet inn GUI-elementer i arkfanen "Figur og tabell" som før var tom
6. Prøv gjerne de brukervalg som er i venstre kolonne
7. Oppgave: gjør endringer i inst/shinyApps/app1/ui.R (på de linjene som nettopp er kommentert inn) slik at maks antall grupper endres fra 10 til 12 i applikasjonen

Lag innhold i Shiny-applikasjonen, steg 2

1. Åpne fila inst/shinyApps/app1/server.R
2. Bla ned til kommentaren # Last inn data og kommenter inn linja under
3. Bla videre ned til kommentaren # Figur og tabell og kommenter inn de linjene som ligger under ## Figur og ## Tabell, hhv
4. Sjekk at det er samsvar mellom id-ene definert i inst/shinyApps/app1/ui.R og de datastrukturene (output$distPlot og output$distTable) du nå har definert i inst/shinyApps/app1/server.R
5. Se at regData gis inn til de funksjoner som lager figur og tabell, hhv
6. Se også at de samme funksjonene tar i mot de brukervalg som er definert i inst/shinyApps/app1/ui.R (input$var og input$bins)
7. Ta en titt på funksjonen som lager innholdet i figur og tabell: ?makeHist
8. Lagre fila, start applikasjonen på nytt og sjekk at figur og tabell er på plass og at disse reagerer på ulike brukervalg
9. Oppgave A: lag en ny arkfane "Sammendrag" (etter "Figur" og "Tabell") ved å legge til kode i inst/shinyApps/app1/ui.R
10. Oppgave B: fyll "Sammendrag" med en tabell som viser summary av valgt variabel ved å legge til kode i inst/shinyApps/app1/server.R

Tips til oppgave B:

## Sammendrag
output$distSummary <- renderTable({
  as.data.frame(sapply(regData, summary))[input$var]
}, rownames = TRUE)

Hovedoppgave

Nå er du ferdig med oppvarminga og klar for den egentlige oppgaven. Til denne oppgaven kan du velge å lage en egen Shiny-app for å løse oppgaven, eller du kan legge til faner i den du har startet på. Til del 1. og 2. kan du benytte markdown-dokumentet "Samlerapport" som mal/utgangspunkt, du kan lage en egen Beamer-presentasjon (eller PowerPoint) eller du kan legge presentasjonen direkte inn på ei (eller flere) Shiny-sider.

Se vedlagte datasett Eksempeldata. (Datasettet kan lastes ved å benytte kommandoen data('EksempelData')). Samme datasett finnes også som csv-fil i katalogen /data, dvs. /data/EksempelData.csv. Sykehusnavn er tilfeldig fordelt og data representerer ikke virkelige enkeltpersoner.

1. Hva ville du ønske å vite om hver variabel for å kunne bruke de i en rapport/grafisk fremstilling?
2. Lag et metadatasett som beskriver alle variable og deres egenskaper. (Dikt opp der du ikke har mulighet for å vite alle detaljer du ønsker å vite om variabelen.)
3. Presenter kort kvalitetsindikatoren reinnleggelse. Dvs. lag en interaktiv visualisering av den. Hvis du ikke får til å lage en interaktiv presentasjon, lager du bare en figur som legges inn i presentasjonen. Reinnleggelse representeres av variabelen ReAdmitted hvor 1=ja og 2=nei. Du står helt fritt i hvilken type figur(er) du vil benytte til visualisering/presentasjon. Se gjerne www.kvalitetsregistre.no for å finne relevante eksempler.

lenaringstado/SoknadNSMoppg documentation built on June 22, 2019, 3:59 a.m.