RawdataQC_stack: 质控指标整理（比对区域）
In lizhihui1996/RawdataQC: RawdataQC

Description Usage Arguments Examples

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质控指标整理（比对区域）

RawdataQC_stack(
  data = data,
  xlab = xlab,
  var1 = "exonic",
  var2 = "intronic",
  var3 = "intergenic",
  limit_var1 = 0.4,
  limit_var2 = 0.3,
  limit_var3 = 0,
  changelabname = F,
  xlabname = xlabname,
  ylabname = ylabname,
  var1labname = "Exonic rate",
  var2labname = "Intronic rate",
  var3labname = "Intergenic rate",
  var3_color = "#66C2A5",
  var2_color = "#FC8D62",
  var1_color = "#8DA0CA",
  title = F,
  titlename = titlename,
  baralpha = 0.5,
  barwidth = 0.8,
  bar_pass_color = "#ACACAC",
  bar_fail_color = "#D32F2E",
  facet = F,
  facet_label = "batch",
  showerror = F,
  showsample = F,
  axisx_size = 12,
  axisy_size = 16,
  axis_title_size = 16
)

`data`	样本质控结果表格，数据框，必填，具体格式参考QC数据
`xlab`	可视化结果x轴，通常为样本，字符型，必填
`var1`	堆叠图第一个变量名称，字符型，选填，默认为“exonic”
`var2`	堆叠图第二个变量名称，字符型，选填，默认为“intronic”
`var3`	堆叠图第三个变量名称，字符型，选填，默认为“intergenic”
`limit_var1`	堆叠图第一个变量的阈值，整型，选填，默认为0.4
`limit_var2`	堆叠图第二个变量的阈值，整型，选填，默认为0.3
`limit_var3`	堆叠图第三个变量的阈值，整型，选填，默认为0
`changelabname`	是否需要更改x轴，逻辑型（T or F)，选填，默认为F
`xlabname`	可视化结果x轴的新名字，字符型，选填，默认为“”
`ylabname`	可视化结果y轴的新名字，字符型，选填，默认为“”
`var1labname`	堆叠图第一个变量在表格中的命名，字符型，选填，默认为"Exonic rate"
`var2labname`	堆叠图第二个变量在表格中的命名，字符型，选填，默认为"Intronic rate"
`var3labname`	堆叠图第三个变量在表格中的命名，字符型，选填，默认为"Intronic rate"
`var3_color`	堆叠图第一个变量在图中的颜色，字符型，选填，默认为"#66C2A5"
`var2_color`	堆叠图第二个变量在图中的颜色，字符型，选填，默认为"#FC8D62"
`var1_color`	堆叠图第三个变量在图中的颜色，字符型，选填，默认为“#8DA0CA”
`title`	可视化结果是否需要标题，逻辑型（T or F)，选填，默认为F
`titlename`	可视化结果标题，字符型，选填，默认为“”
`baralpha`	可视化结果柱状图透明度，整型，选填，默认为0.5
`barwidth`	可视化结果柱状图宽度，整型，选填，默认为0.8
`bar_pass_color`	可视化结果柱状图中合格样本颜色，字符型，选填，默认为"#ACACAC"（灰色）
`bar_fail_color`	可视化结果柱状图中合格样本颜色，字符型，选填，默认为"#D32F2E"（红色）
`facet`	可视化结果是否需要分面，逻辑型（T or F)，选填，默认为F
`facet_label`	可视化结果分面依据，字符型，如果facet=T，必填（如"batch"）
`showerror`	可视化结果下是否需要整理整体结果，逻辑型（T or F)，选填，默认为F
`showsample`	可视化结果的x轴内容是否显示，逻辑型（T or F)，选填，默认为F
`axisx_size`	可视化结果x轴字体大小，整型，选填，默认为12
`axisy_size`	可视化结果y轴字体大小，整型，选填，默认为16
`axis_title_size`	可视化结果标题字体大小，整型，选填，默认为16