sp_temporal_data: Function create a Species Temporal Data object (STD object).
In luismurao/hdm: hdm: "Habitat distribution models"

This function creates Species Temporal Data object.

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sp_temporal_data(occs = NA, longitude = NULL, latitude = NULL,
  sp_year_var = NA, layers_by_year_dir = NA, layers_ext = "*.tif$",
  reclass_year_data = TRUE)

`occs`	A data.frame or a SpatialPointsDataFrame with coordinates of the occurrence records. The data must have a time variable indicating the year of each observation.
`longitude`	If occs is a data.frame the user must indicate the variable name of logitude data.
`latitude`	If occs is a data.frame the user must indicate the variable name of latitude data.
`sp_year_var`	A time variable indicating the year of each observation.
`layers_by_year_dir`	El directorio que contiene las carpetas donde estan las capas raster que se usaran para modelar; estas deben estar clasificadas por anio.
`layers_ext`	Extension de los archivos de las capas raster.
`reclass_year_data`	Logico. Si TRUE aquellos datos cuyos registros no coincidan con los anios de las capas de modelamiento seran reclasificados.

Returns un sp.temporal.modeling object (list) con las coordenadas de los puntos de presencia, los anios las observaciones, el path de las capas temporales.

luismurao/hdm documentation built on May 24, 2019, 5:06 a.m.