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In mellohenrique/codeplan.boletim2: Gerador dos dados do Boletim da Codeplan

Pacote codeplan.boletim2

O pacote codeplan.boletim2 foi criado para automatizar várias das operações realizadas para a produção do boletim codeplan sobre a pandemia de coronavírus. O objetivo do pacote é diminuir o trabalho necessário para o boletim e reduzir a quantidade de erros possíveis por meio da automatização dos processos para criação do boletim.

A utilização do pacote requer a linguagem R

O pacote é instalado por meio do comando:

devtools::instal_github("mellohenrique/codeplan.boletim2")

A utilização do pacote é realizada em um ambiente de trabalho com uma pasta chamada "produto". São necessárias as seguintes fontes de dados:

1. Dados de cadastro da SSP-DF (Secretária de Segurança Pública do Distrito Federal);
2. Dados de primeiros sintomas da SSP-DF;
3. Dados de vacinas do SUS (Sistema Único de Saúde);
4. Dados de casos e óbitos do (MS) Ministérios da Saúde.

Os dados da SSP são obtidos internamente pela Codeplan, enquanto os dados do MS e do SUS podem ser obtidos em:

• Dados do MS;
• Dados do Sus.

O pacote pode ser utilizado com o seguinte comando em uma sessão R, com o pacote instalado e com a presença da pasta produto no diretório de trabalho:

gera_boletim(
  caminho_ms = "local com os dados de covid do MS",
  caminho_cadastro = "local com os dados de cadastro da SSP",
  caminho_ps = "local com os dados de primeiro sintomas da SSP",
  caminho_vacinas = "local com os dados de vacina do SUS"
)

O comando gerará os seguintes resultados na pasta produto:

1. Gráfico de crescimento de casos por UF;
2. Gráfico de crescimento de óbitos por UF;
3. Gráfico de casos por ra das 6 ras com maior número de casos nas últimas duas semanas;
4. Gráfico de óbitos por ra das 6 ras com maior número de óbitos nas últimas duas semanas;
5. Gráfico da série de casos por primeiro sintomas e por cadastro do Distrito Federal;
6. Gráfico da série de óbitos por primeiro sintomas e por cadastro do Distrito Federal;
7. Tabela com dados de casos mensais por faixa etária por 100.000 habitantes;
8. Tabela com dados de óbitos mensais por faixa etária por 100.000 habitantes;
9. Tabela com dados de casos diários por faixa etária;
10. Tabela com dados de óbitos diários por faixa etária;
11. Tabela com dados de covid por UF;
12. Tabela com dados de covid por capitais das UFs;
13. Tabela com dados de vacinação por faixa etária no Distrito Federal;

mellohenrique/codeplan.boletim2 documentation built on March 20, 2022, 3:15 a.m.