GetGenAreas: Obtiene las areas relacionadas con un Gen específico

Description Usage Arguments Value See Also Examples

Description

Con esta función se pueden buscar los genes estudiados en uno de los dataset, buscandolo por el nombre o por el identificador ensembl.

Usage

1
2
GetGenAreas(gene.name.pattern = NULL, ensembl.id = NULL,
  selected.dataset = "dataset_adult", intersec.data = TRUE)

Arguments

gene.name.pattern

Nombre completo o nombre parcial del gen en cuestión

ensembl.id

Nombre completo o nombre parcial del identificador

selected.dataset

Selección de una de las tres bases de datos disponibles en ABA

intersec.data

Si es TRUE (opción default) se muestran los resultados encontrados para **gene.name.pattern** y **ensembl.id**. Cunado es FALSE se muestran los resultados para los dos

Value

Data.table con las areas en las que se expresa el gen seleccionado.

See Also

GetAreasGenes para obtener areas

Examples

1
2
3
GetGenAreas(gene.name.pattern = 'A1BG', selected.dataset = "dataset_5_stages")
GetGenAreas(ensembl.id = 'ENSG', selected.dataset = "dataset_5_stages")
GetGenAreas(gene.name.pattern = 'A1BG', ensembl.id = 'ENSG', selected.dataset = "dataset_5_stages")

nekrum/QuickAndDirtyABAAnalisis documentation built on June 16, 2020, 2:45 a.m.