combinacoes: Combina<c3><a7><c3><b5>es formadas nos cruzamentos

In samuel-rosa/biotrigo: Ferramentas para a Biotrigo Genética no R

Description

Identificar as combina<c3><a7><c3><b5>es formadas durante os cruzamentos de gen<c3><b3>tipos.

Usage

combinacoes(base.de.dados, cruzamento)

Arguments

base.de.dados	Objeto do tipo data.frame contendo a base de dados dos gen<c3><b3>tipos.
cruzamento	Objeto do tipo data.frame especificando os cruzamentos realizados.

Details

Base de dados

A base de dados consiste em uma tabela com tr<c3><aa>s colunas: genotipo_id, com o n<c3><ba>mero de identifica<c3><a7><c3><a3>o <c3><ba>nico de cada gen<c3><b3>tipo, genotipo_nome, com o nome atribu<c3><ad>do <c3><a0> cada gen<c3><b3>tipo, e cruzamento_fonte, com o cruzamento que deu origem <c3><a0> cada gen<c3><b3>tipo.

Cruzamentos

Os cruzamentos s<c3><a3>o organizados em uma tabela com tr<c3><aa>s colunas: mae_id, com o n<c3><ba>mero de identifica<c3><a7><c3><a3>o <c3><ba>nico dos gen<c3><b3>tipos usados como m<c3><a3>es, pai_id, com o n<c3><ba>mero de identifica<c3><a7><c3><a3>o <c3><ba>nico dos gen<c3><b3>tipos usados como pais, e sementes_numero, com o n<c3><ba>mero de sementes.

Value

Um objeto do tipo data.frame contendo o n<c3><ba>mero de identifica<c3><a7><c3><a3>o dos gen<c3><b3>tipos m<c3><a3>e e pai, o nome do cruzamento e o n<c3><ba>mero de sementes.

Note

Tome cuidado com o sistema de codifica<c3><a7><c3><a3>o de caracteres usados ao salvar os arquivos da base de dados e cruzamentos. D<c3><aa> prefer<c3><aa>ncia ao sistema UTF-8. No MS Excel use Arquivo > Salvar como > CSV UTF-8.

Author(s)

Alessandro Samuel-Rosa [email protected]

Examples

## Not run: 
tmp <- combinacoes(
  base.de.dados = read.csv(
    'data/database.csv', sep = ",", header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE, na.strings = "", 
    encoding = "UTF-8"),
  cruzamento = read.csv(
    'data/cruzas.csv', sep = ",", header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE, encoding = "UTF-8"))
tmp
write.csv(tmp, "data/combinations.csv")

## End(Not run)

samuel-rosa/biotrigo documentation built on May 25, 2017, 11:41 p.m.