knitr::opts_chunk$set(collapse = T, comment = "#>") knitr::opts_chunk$set(fig.width=7, fig.height=5) options(tibble.print_min = 6L, tibble.print_max = 6L) library(forestmangr) library(dplyr)
Primeiro Carregamos os pacotes e dados:
library(forestmangr) library(dplyr) data(exfm16) dados <- exfm16 dados
O objetivo aqui é estimar volume e área basal futuros, utilizando o modelo de Clutter.
$$ \left{ \begin{array}{ll} Ln(B_2) = LnB_1\begin{pmatrix} \frac{I_1}{I_2} \end{pmatrix} + \alpha_0\begin{pmatrix} 1 - \frac{I_1}{I_2} \end{pmatrix} + \alpha_1\begin{pmatrix} 1 - \frac{I_1}{I_2} \end{pmatrix} S + ln(\varepsilon_2)\ Ln(V_2) = \beta_0 + \beta_1 \begin{pmatrix} \frac{1}{I_2}\end{pmatrix} + \beta_2 S + \beta_3 Ln(B_2) + Ln(\varepsilon_1) \end{array} \right. $$
Para isso, primeiro precisamos estimar o site. Vamos utilizar o modelo de Chapman & Richards:
$$ DH = \beta_0 * (1 - exp^{-\beta_1 * Age})^{\beta_2} $$
Este modelo é não linear, portanto, vamos estima-lo com a função nls_table
,obter os seus coeficientes e estimar o site utilizando a equação para site, considerando a idade índice:
$$ S = DH* \frac{(1 - exp^{- \frac{ \beta_1}{Age} })^{\beta_2}} {(1 - exp^{- \frac{ \beta_1}{IndexAge}})^{\beta_2}} $$
Vamos utilizar uma idade índice de 64
meses.
index_age <- 64 dados <- dados %>% nls_table(DH ~ b0 * (1 - exp( -b1 * age ) )^b2, mod_start = c( b0=23, b1=0.03, b2 = 1.3), output = "merge" ) %>% mutate(S = DH *( ( (1- exp( -b1/age ))^b2 ) / (( 1 - exp(-b1/index_age))^b2 )) ) %>% select(-b0,-b1,-b2) head(dados)
Com o site estimado, podemos ajustar o modelo de Clutter:
coefs_clutter <- fit_clutter(dados, "age", "DH", "B", "V", "S", "plot") coefs_clutter
Agora, podemos dividir a área em classes, e verificar a produção de cada classe com o modelo.
Primeiro, vamos classificar os dados:
dados_class <- classify_site(dados, "S", 3, "plot") head(dados_class)
Agora, estimamos área basal e volume com a função est_clutter
. Também iremos calcular os valores de Incremento Médio Mensal (MMI) e Incremento Corrente Mensal (CMI).
Fornecemos a ela os dados, um vetor com a idade desejada, as variáveis área basal inicial, site e de classificação (criada anteriormente), e um dataframe com os coeficientes do ajuste de clutter (criado anteriormente):
dados_est <- est_clutter(dados_class, 20:125,"B", "S", "category_", coefs_clutter) dados_est
Podemos também gerar um gráfico com a idade técnica de corte de cada classe:
est_clutter(dados_class, 20:125,"B", "S", "category_", coefs_clutter,output="plot")
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