In vguillemot/debuter: Le package de la formation DebuteR

knitr::opts_chunk$set(
  collapse = TRUE,
  comment = "#>",
  echo = TRUE
)

Avant de commencer

Nous aurons besoin de charger les librairies suivantes :

library(dplyr)
library(tidyr)

D'où ça vient ?

• Questionnaire : "ne se prononce pas"
• "Erreur" de mesure
• Données perdues
• Opérations interdites

Comment ça se présente ?

R | Description | Exemple --|-------------|--------------- NaN | Le résultat impossible (e.g.) | 1 / 0 NULL | L'objet vide | fruits$umami "" | La chaîne de caractères vide | "" NA | La vraie donnée manquante | x <- c(NA, 2, 3)

Et quel effet cela a ? {.columns-2}

Valeur manquante

Opération | Résultat ----------|------------ 3 + NA | NA NA/2 | NA TRUE & NA | NA TRUE | NA | TRUE x + 1 | [1] NA 3 4 sum(x) | [1] NA

NaN

Opération | Résultat ----------|------------ 3 + NaN | NaN NaN/2 | NaN TRUE & NaN | NA TRUE | NaN | TRUE

Construire son exemple

L'intérêt de construire un petit exemple est de tester des fonctions qui ne nous sont pas familières!

fruits_na <- tibble(
  name = c("Apple", "Banana", "Cherry", "Date", "Elderberry", "Fig", "Grape"),
  sugar = c(10.3, 17.2, NA, 63.3, 6.5, 16.2, 16.0), 
  # sugar content in g/100g
  water = c(86, 74, 82, 20, 80, NA, 81)
  # water content as a percentage
)

J'ai demandé à ChatGPT de créer un petit exemple

Comment on gère ?

Enlever les observations avec données manquantes

fruits_na %>% drop_na()

Remplacer les observations avec données manquantes

fruits_na %>% replace_na(list(sugar = 0, water = 1))

Utiliser des fonctions qui peuvent enlever les valeurs manquantes

fruits_na %>% summarize(
  MeanSugar = mean(sugar, na.rm = TRUE),
  MeanWater = mean(water, na.rm = TRUE),
  MedianSugar = median(sugar, na.rm = TRUE),
  MedianWater = median(water, na.rm = TRUE))

cor(fruits_na$sugar, fruits_na$water, use = "complete.obs")

Aller plus loin

• Visualisation des données manquantes avec le package naniar
• Imputation de données manquantes avec le package mice
• La Task View sur les données manquantes

vguillemot/debuter documentation built on Oct. 8, 2024, 10:47 p.m.