R/egg_parasitoid.R

In walmes/RDASC: Reproducible Data Analysis of Cientific Cooperations

#' @name egg_parasitoid
#' @title Efeito de Inseticidas no Parasitismo de \emph{Trichogramma}
#'     em Ovos de Lagartas da Soja
#' @description Resultados de um experimento que estudou o efeito de 6
#'     inseticidas (mais a testemunha) sobre o parasitismo de duas
#'     espécies de \emph{Trichogramma} em ovos de dois hospedeiros que
#'     são lagartas defolhadoras na cultura da soja. O experimento foi
#'     instalado em delineamento inteiramente casualizado com 20
#'     repetições. Os tratamentos são proveninetes do arranjo em esquema
#'     fatorial completo \eqn{7 \times 2 \times 2} (28 celas),
#'     perfazendo 560 obsevações.
#'
#'     A unidade experimental foi uma cartela com ovos do hospedeiro
#'     previamente tratados, por uma hora, com um inseticida. Uma fêmea,
#'     de uma das espécies de parasitóide, foi liberada dentro de um
#'     tubo de ensaio unto com a cartela contendo ovos do hopedeiro para
#'     parasitá-los. Depois de 24 horas foi verificado se a fêmea estava
#'     viva. Ela foi então removida do recipiente. Os ovos da cartela
#'     foram observados diariamente até que acontecesse a emergência dos
#'     parasitóides. Ao término do experimento, quando todos os insetos
#'     nascidos morreram, o número de ovos parasitados, total de
#'     parasitóides mortos e nascidos de cada sexo e número de dias de
#'     incubação dos parasitóides foram algumas das variáveis
#'     registradas.
#'
#'     Quando as fêmeas morrem antes de fazer o parasitismo, não existem
#'     registros para ovos parasitados e para as demais variáveis
#'     dependentes do evento "parasitar os ovos".
#'
#' @format Um \code{data.frame} com 560 observações e 12 variáveis, em
#'      que
#'
#' \describe{
#'
#' \item{\code{inset}}{Fator que representa o inseticica aplicado aos
#'     ovos do hospedeiro. A testemunha foi a aplicação de água.}
#'
#' \item{\code{paras}}{Fator que representa a espécie do parasitóide:
#'     \emph{Trichogramma atopovirilia} e \emph{Trichogramma
#'     pretiosum}.}
#'
#' \item{\code{hosp}}{Fator que representa o hospedeiro cujos ovos são
#'     colocados em uma cartela e oferecidos para serem parasitados:
#'     \emph{Anticarsia gemmatalis} (lagarta-da-soja) e
#'     \emph{Chrysodeixis includens} (lagarta-falsa-medideira).}
#'
#' \item{\code{rept}}{Número que indentifica as repetições de cada cela
#'     experimental. A unidade experimental é uma cartela com ovos do
#'     hospedeiro (\code{hosp}) tratado previamente com um inseticida
#'     (\code{inset}) e exposta a um parasitóide (\code{paras}).}
#'
#' \item{\code{otot}}{Número total de ovos para serem parasitados na
#'     cartela (unidade experimental) colocada dentro do tubo de
#'     ensaio.}
#'
#' \item{\code{mort}}{Variável binária que indica a sobrevivência (1) ou
#'     não (2) da fêmea 24 horas após ser liberada na cartela.}
#'
#' \item{\code{incub}}{Tempo para incubação dos parasitóides. É o
#'     intervalo de tempo (em dias) entre o dia da liberação da fêmea
#'     junto a cartela com ovos (início do parasitismo) e a emergência
#'     dos parasitóides dos ovos. Os parasitóides de uma mesma cartela
#'     emergiram todos no mesmo dia.}
#'
#' \item{\code{opar}}{Número de ovos parasitados da cartela pela fêmea
#'     do parasitóide 24h após a sua liberação.}
#'
#' \item{\code{oeme}}{Número de ovos com orifício de emergência de
#'     parasitóide, o que indica que o ovo foi parasitado e emergiram
#'     parasitóides dele (pelo menos um parasitóide).}
#'
#' \item{\code{pne}}{Parasitóides não emergidos por cartela. É o total
#'     de parasitóides encontrados nos ovos da cartela que não
#'     emergiram, por não sobreviver ao inseticida ou não ter vigor para
#'     sair.}
#'
#' \item{\code{macho}}{Número de parasitóides machos na cartela
#'     emergidos com vida. A diferença entre os sexos é morfológica,
#'     marcada pelo tipo de antena dos parasitóides. Depois de mortos,
#'     os parasitóides emergidos do tubo de ensaio foram avaliados com
#'     lupa para determinação dos sexos pela forma da antena.}
#'
#' \item{\code{femea}}{Número de parasitóides fêmeas na cartela
#'     emergidos com vida. A soma dois sexos resulta no total de
#'     parasitóides vivos, enquanto que \code{pne} é o total de
#'     mortos. Com essas variáveis é possível determinar a proporção de
#'     emergência.}
#'
#' }
#' @source Tamara Akemi Takahashi (\email{tamaratakahashi@@gmail.com}),
#'     estudante de Mestrado do Programa de Pós Graduação em Produção
#'     Vegetal da UFPR (\url{http://www.pgapv.agrarias.ufpr.br/}). Luís
#'     Amilton Foerster (\email{lfoerster888@@gmail.com}, orientador).
#' @examples
#'
#' data(egg_parasitoid)
#' str(egg_parasitoid)
#'
#' # Frequência planejada.
#' xtabs(~inset + paras + hosp, data = egg_parasitoid)
#'
#' # Frequência dos casos completos.
#' xtabs(~inset + paras + hosp, data = na.omit(egg_parasitoid))
#'
NULL