inst/doc/mcsSubset.R

### R code from vignette source 'mcsSubset.Rnw'

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### code chunk number 1: preliminaries
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options(width = 70, prompt = "R> ", continue = "+  ")
library("mcsSubset")


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### code chunk number 2: AirPollution
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library("mcsSubset")
data("AirPollution", package = "mcsSubset")
for(i in 12:14) AirPollution[[i]] <- log(AirPollution[[i]])


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### code chunk number 3: mcsSubset
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xs <- mcsSubset(mortality ~ ., data = AirPollution)
xs


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### code chunk number 4: summary
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plot(xs)
summary(xs)


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### code chunk number 5: deviance
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deviance(xs)
logLik(xs)
AIC(xs)
AIC(xs, k = log(nrow(AirPollution)))


###################################################
### code chunk number 6: deviance-all
###################################################
deviance(xs, size = 1:16)
AIC(xs, size = 1:16)
AIC(xs, size = 1:16, k = log(nrow(AirPollution)))


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### code chunk number 7: refit
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lm5 <- refit(summary(xs))
summary(lm5)

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