Files in GOfuncR
Gene ontology enrichment using FUNC
README.md
GOfuncR documentation built on Nov. 8, 2020, 8:27 p.m.
NAMESPACE
DESCRIPTION
build/vignette.rds
build/partial.rdb
src/go_obj_binom.cc
src/go_obj.h
src/ran_genelen.h
src/genes.cc
src/go_groups_binom.h
src/go_groups_conti.h
src/go_groups_hyper.cc
src/genes_binom.h
src/gene_conti.h
src/binom_categorytest.cc
src/go_obj_hyper.h
src/go_graph_conti.h
src/go_groups_binom.cc
src/gene_conti.cc
src/wilcox_categorytest.cc
src/go_obj_binom.h
src/gene_binom.cc
src/RcppExports.cpp
src/idmap.h
src/go.h
src/go.cc
src/go_obj_conti.cc
src/init.c
src/go_graph.cc
src/go_graph.h
src/go_groups.h
src/genes_binom.cc
src/conti_randset.cc
src/conti_categorytest.cc
src/transitions.cc
src/go_obj_hyper.cc
src/gene_binom.h
src/hyper_randset.cc
src/go_groups.cc
src/go_graph_binom.cc
src/go_graph_hyper.h
src/go_groups_hyper.h
src/hyper_categorytest.cc
src/structures.h
src/roll.cpp
src/unlock_environment.cc
src/gene.h
src/read_bed.cpp
src/go_groups_conti.cc
src/blocks.cpp
src/wilcox_randset.cc
src/binom_randset.cc
src/genes_conti.h
src/transitions.h
src/fish_test.h
src/read_bed.h
src/genes_conti.cc
src/genes.h
src/go_obj_conti.h
src/go_graph_hyper.cc
src/go_graph_conti.cc
src/go_graph_binom.h
src/roll.h
src/idmap.cc
src/gene.cc
src/blocks.h
src/go_obj.cc
src/ran_genelen.cpp
R/go_enrich.R
R/sysdata.rda
R/category_tests.R
R/get_anno_genes.R
R/plot_anno_scores.R
R/RcppExports.R
R/plot_wilcox.R
R/plot_hyper.R
R/get_child_parent_nodes.R
R/get_names.R
R/plot_conti.R
R/plot_binom.R
R/get_ids.R
R/get_anno_categories.R
R/refine.R
R/helper.R
R/blocks_to_genes.R
vignettes/GOfuncR.Rmd
vignettes/Skizze_Fig1.png
vignettes/Input_data_test_selection.png
vignettes/Skizze_Fig2.png
man/get_anno_genes.Rd
man/go_enrich.Rd
man/get_child_nodes.Rd
man/refine.Rd
man/plot_anno_scores.Rd
man/get_names.Rd
man/get_ids.Rd
man/get_anno_categories.Rd
man/get_parent_nodes.Rd
tests/testthat.R
tests/testthat/test_go_enrich_input_checking.R
tests/testthat/test_go_enrich.R
tests/testthat/test_refinement.R
inst/NEWS
inst/WORDLIST
inst/doc/GOfuncR.Rmd
inst/doc/GOfuncR.R
inst/doc/GOfuncR.html
