HDPenReg: High-Dimensional Penalized Regression

Algorithms for lasso and fused-lasso problems: implementation of the lars algorithm for lasso and fusion penalization and EM-based algorithms for (logistic) lasso and fused-lasso penalization.

AuthorQuentin Grimonprez [aut, cre], Serge Iovleff [aut]
Date of publication2016-01-26 23:06:38
MaintainerQuentin Grimonprez <quentin.grimonprez@inria.fr>
LicenseGPL (>= 2)
Version0.93.1

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HDPenReg
HDPenReg/TODO
HDPenReg/inst
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HDPenReg/inst/doc/HDPenReg.R
HDPenReg/src
HDPenReg/src/Makevars
HDPenReg/src/EMPenModels.cpp
HDPenReg/src/EMPenModels.h
HDPenReg/src/larsR.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg
HDPenReg/src/HDPenReg/Makefile
HDPenReg/src/HDPenReg/lars.mk
HDPenReg/src/HDPenReg/lib
HDPenReg/src/HDPenReg/lib/empty
HDPenReg/src/HDPenReg/EMCVmain.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/IPenalizedSolver.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/CV.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/FusedLassoPenalty.cpp
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HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/CV.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/LassoSolver.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/LogisticLassoSolver.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/CVFusedLasso.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/EnetSolver.cpp
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HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/LassoSolver.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/EnetSolver.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/IMeasure.h
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HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/IAlgo.h
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HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/FusedLassoSolver.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/FusedLassoPenalty.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/EM.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/FusedLassoSolver.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/LogisticFusedLassoSolver.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels/LassoPenalty.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lassoModels.mk
HDPenReg/src/HDPenReg/lars
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/Path.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/Lars.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/Lars.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/makefile
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/functions.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/Cvlars.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/Cvlars.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/PathState.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/functions.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/Fusion.h
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/PathState.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/Fusion.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/lars/Path.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/EMmain.cpp
HDPenReg/src/HDPenReg/larsRmain.cpp
HDPenReg/src/larsR.h
HDPenReg/NAMESPACE
HDPenReg/NEWS
HDPenReg/R
HDPenReg/R/HDPenReg-package.R HDPenReg/R/predict.R HDPenReg/R/cvEM.R HDPenReg/R/EM.R HDPenReg/R/simulation.R HDPenReg/R/LarsPath.R HDPenReg/R/cvlars.R HDPenReg/R/lars.R
HDPenReg/vignettes
HDPenReg/vignettes/HDPenReg.Rnw
HDPenReg/vignettes/HDPenReg.bib
HDPenReg/MD5
HDPenReg/build
HDPenReg/build/vignette.rds
HDPenReg/DESCRIPTION
HDPenReg/man
HDPenReg/man/plot.HDcvlars.Rd HDPenReg/man/listToMatrix.Rd HDPenReg/man/plot-methods.Rd HDPenReg/man/simul.Rd HDPenReg/man/coeff.Rd HDPenReg/man/coef.LarsPath.Rd HDPenReg/man/EMcvlasso.Rd HDPenReg/man/HDlars.Rd HDPenReg/man/EMcvfusedlasso.Rd HDPenReg/man/predict.LarsPath.Rd HDPenReg/man/HDcvlars.Rd HDPenReg/man/EMfusedlasso.Rd HDPenReg/man/LarsPath-class.Rd HDPenReg/man/EMlasso.Rd HDPenReg/man/computeCoefficients.Rd HDPenReg/man/HDfusion.Rd HDPenReg/man/HDPenReg-package.Rd HDPenReg/man/plotCoefficient.Rd
HDPenReg/cleanup

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