PHYLOGR: Functions for Phylogenetically Based Statistical Analyses

Manipulation and analysis of phylogenetically simulated data sets and phylogenetically based analyses using GLS.

AuthorRamon Diaz-Uriarte <rdiaz@cnio.es> and Theodore Garland, Jr <theodore.garland@ucr.edu>
Date of publication2014-11-10 01:39:39
MaintainerRamon Diaz-Uriarte <rdiaz02@gmail.com>
LicenseGPL (>= 2)
Version1.0.8
http://ligarto.org/rdiaz

View on CRAN

Files in this package

PHYLOGR
PHYLOGR/COPYING
PHYLOGR/inst
PHYLOGR/inst/Examples
PHYLOGR/inst/Examples/iclag.pdi
PHYLOGR/inst/Examples/49hmt.sim
PHYLOGR/inst/Examples/49hmt.inp
PHYLOGR/inst/Examples/49ms.sim
PHYLOGR/inst/Examples/ifsmi.pdi
PHYLOGR/inst/Examples/icfxx.sim
PHYLOGR/inst/Examples/ihshw.sim
PHYLOGR/inst/Examples/ihshw.fic
PHYLOGR/inst/Examples/49ms.fic
PHYLOGR/inst/Examples/49lbr.pdi
PHYLOGR/inst/Examples/ihshw.pdi
PHYLOGR/inst/Examples/49hmt.pdi
PHYLOGR/inst/Examples/ifsmi.sim
PHYLOGR/inst/Examples/49hmt.fic
PHYLOGR/inst/Examples/49lbr.inp
PHYLOGR/inst/Examples/Rplots.ps
PHYLOGR/inst/Examples/iclag.sim
PHYLOGR/inst/Examples/49ms.dsc
PHYLOGR/inst/Examples/LacertidData.PhylipIntree
PHYLOGR/inst/Examples/49ms.pdi
PHYLOGR/inst/Examples/Examples-code.R
PHYLOGR/inst/Examples/LacertidData.PhylipInfile
PHYLOGR/inst/Examples/Index
PHYLOGR/inst/Examples/iclag.fic
PHYLOGR/inst/Examples/ifsmi.fic
PHYLOGR/inst/Examples/icfxx.pdi
PHYLOGR/inst/Examples/ifsmi.dsc
PHYLOGR/inst/Examples/Examples.pdf
PHYLOGR/inst/Examples/49lbr.sim
PHYLOGR/inst/Examples/icfxx.fic
PHYLOGR/NAMESPACE
PHYLOGR/data
PHYLOGR/data/GarlandJanis.Original.txt.gz
PHYLOGR/data/Lacertid.varcov.txt.gz
PHYLOGR/data/GarlandJanis.varcov.txt.gz
PHYLOGR/data/SimulExample.txt.gz
PHYLOGR/data/Lacertid.IC.txt.gz
PHYLOGR/data/GarlandJanis.IC.txt.gz
PHYLOGR/data/Lacertid.Original.txt.gz
PHYLOGR/R
PHYLOGR/R/PHYLOGR.R
PHYLOGR/MD5
PHYLOGR/DESCRIPTION
PHYLOGR/man
PHYLOGR/man/plot.phylog.lm.Rd PHYLOGR/man/read.pdi.data.Rd PHYLOGR/man/summary.phylog.lm.Rd PHYLOGR/man/cor.origin.Rd PHYLOGR/man/read.sim.data.Rd PHYLOGR/man/Lacertid.varcov.Rd PHYLOGR/man/matrix.D.Rd PHYLOGR/man/Lacertid.IC.Rd PHYLOGR/man/cancor.phylog.Rd PHYLOGR/man/Helper.functions.Rd PHYLOGR/man/summary.phylog.prcomp.Rd PHYLOGR/man/SimulExample.Rd PHYLOGR/man/phylog.gls.fit.Rd PHYLOGR/man/GarlandJanis.IC.Rd PHYLOGR/man/GarlandJanis.varcov.Rd PHYLOGR/man/GarlandJanis.Original.Rd PHYLOGR/man/prcomp.phylog.Rd PHYLOGR/man/read.phylog.matrix.Rd PHYLOGR/man/lm.phylog.Rd PHYLOGR/man/plot.phylog.prcomp.Rd PHYLOGR/man/print.summary.phylog.Rd PHYLOGR/man/plot.phylog.cancor.Rd PHYLOGR/man/read.phylip.data.Rd PHYLOGR/man/Lacertid.Original.Rd PHYLOGR/man/summary.phylog.cancor.Rd PHYLOGR/man/read.inp.data.Rd
PHYLOGR/INDEX
PHYLOGR/CHANGES

Questions? Problems? Suggestions? or email at ian@mutexlabs.com.

All documentation is copyright its authors; we didn't write any of that.