vignettes/files/Example1_R.r

In REDCapDM: 'REDCap' Data Management

#Clear existing data and graphics

graphics.off()
#Load Hmisc library
library(Hmisc)
#Read Data
data=read.csv('Example1_DATA.csv')
#Setting Labels

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label(data$borrar_suma)="borrar_suma"
label(data$reinicio_motivo)="Motivo de reinicio"
label(data$reinicio_motivo_otro)="Especifique motivo de reinicio"
label(data$switch_motivo)="Motivo de switch"
label(data$switch_motivo_otro)="Especifique motivo de switch"
label(data$fecha_suspension)="Fecha de suspensión"
label(data$suspension_motivo)="Motivo de suspensión"
label(data$suspension_motivo_otro)="Especifique motivo de suspensión"
label(data$fecha_administracion)="Fecha de administración "
label(data$num_administracion_anti)="Número de administración"
label(data$efectos_adversos_anti)="Efectos adversos"
label(data$efectos_adversos_tipo_anti___0)="Tipo de efectos adversos (choice=Estreñimiento)"
label(data$efectos_adversos_tipo_anti___1)="Tipo de efectos adversos (choice=Prurito)"
label(data$efectos_adversos_tipo_anti___2)="Tipo de efectos adversos (choice=Reacción en el lugar de inyección)"
label(data$efectos_adversos_tipo_anti___3)="Tipo de efectos adversos (choice=Cuadro catarral)"
label(data$efectos_adversos_tipo_anti___4)="Tipo de efectos adversos (choice=Dolor muscular)"
label(data$efectos_adversos_tipo_anti___5)="Tipo de efectos adversos (choice=Astenia)"
label(data$efectos_adversos_tipo_anti___6)="Tipo de efectos adversos (choice=Mareo o vértigo)"
label(data$efectos_adversos_tipo_anti___7)="Tipo de efectos adversos (choice=Cambios en la tensión arterial)"
label(data$efectos_adversos_tipo_anti___8)="Tipo de efectos adversos (choice=Dolor torácico)"
label(data$efectos_adversos_tipo_anti___9)="Tipo de efectos adversos (choice=Otro {efectos_adversos_tipo_otro_anti})"
label(data$efectos_adversos_tipo_otro_anti)="Especifique otro efecto adverso"
label(data$seguimiento_trat_oral_anti)="Sigue con tratamiento oral asociado"
label(data$anticgrp_tipo_anti)="Seleccionar anti-CGRP"
label(data$anticgrp_dosis_eren)="Seleccionar dosis"
label(data$anticgrp_dosis_fremanez)="Seleccionar dosis"
label(data$tratamiento_previo)="Tratamiento preventivo previo"
label(data$topiramato___1)="Topiramato (choice=Topiramato)"
label(data$topiramato_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$topiramato_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$topiramato_motivo_otro)="Especifique"
label(data$propranolol___1)="Propranolol (choice=Propranolol)"
label(data$propranolol_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$propranolol_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$propranolol_motivo_otro)="Especifique"
label(data$metoprolol___1)="Metoprolol (choice=Metoprolol)"
label(data$metoprolol_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$metoprolol_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$metoprolol_motivo_otro)="Especifique"
label(data$nadolol___1)="Nadolol (choice=Nadolol)"
label(data$nadolol_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$nadolol_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$nadolol_motivo_otro)="Especifique"
label(data$atenolol___1)="Atenolol (choice=Atenolol)"
label(data$atenolol_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$atenolol_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$atenolol_motivo_otro)="Especifique"
label(data$timolol___1)="Timolol (choice=Timolol)"
label(data$timolol_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$timolol_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$timolol_motivo_otro)="Especifique"
label(data$nevibolol___1)="Nevibolol (choice=Nevibolol)"
label(data$nevibolol_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$nevibolol_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$nevibolol_motivo_otro)="Especifique"
label(data$amitriptilina___1)="Amitriptilina (choice=Amitriptilina)"
label(data$amitriptilina_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$amitriptilina_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$amitriptilina_motivo_otro)="Especifique"
label(data$venlafaxina___1)="Venlafaxina (choice=Venlafaxina)"
label(data$venlafaxina_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$venlafaxina_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$venlafaxina_motivo_otro)="Especifique"
label(data$zonisamida___1)="Zonisamida (choice=Zonisamida)"
label(data$zonisamida_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$zonisamida_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$zonisamida_motivo_otro)="Especifique"
label(data$flunarizina___1)="Flunarizina (choice=Flunarizina)"
label(data$flunarizina_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$flunarizina_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$flunarizina_motivo_otro)="Especifique"
label(data$lisinopril___1)="Lisinopril (choice=Lisinopril)"
label(data$lisinopril_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$lisinopril_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$lisinopril_motivo_otro)="Especifique"
label(data$candesartan___1)="Candesartan (choice=Candesartan)"
label(data$candesartan_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$candesartan_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$candesartan_motivo_otro)="Especifique"
label(data$valproato___1)="Valproato (choice=Valproato)"
label(data$valproato_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$valproato_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$valproato_motivo_otro)="Especifique"
label(data$lamotrigina___1)="Lamotrigina (choice=Lamotrigina)"
label(data$lamotrigina_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$lamotrigina_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$lamotrigina_motivo_otro)="Especifique"
label(data$botox___1)="Botox (choice=Botox)"
label(data$botox_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$botox_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$botox_motivo_otro)="Especifique"
label(data$erenumab___1)="Erenumab (choice=Erenumab)"
label(data$erenumab_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$erenumab_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$erenumab_motivo_otro)="Especifique"
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label(data$galcanezumab_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$galcanezumab_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$galcanezumab_motivo_otro)="Especifique"
label(data$fremanezumab___1)="Fremanezumab (choice=Fremanezumab)"
label(data$fremanezumab_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$fremanezumab_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$fremanezumab_motivo_otro)="Especifique"
label(data$eptinezumab___1)="Eptinezumab (choice=Eptinezumab)"
label(data$eptinezumab_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$eptinezumab_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$eptinezumab_motivo_otro)="Especifique"
label(data$otro___1)="Otro (choice=Otro {otro_descripcion})"
label(data$otro_descripcion)="Otro descripción"
label(data$otro_trat)="Continua con el tratamiento"
label(data$otro_motivo)="Motivo de retirada"
label(data$otro_motivo_otro)="Especifique"
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label(data$enero_timestamp)="Survey Timestamp"
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label(data$triptanes_compri_dia1_m1)="Número de comprimidos"
label(data$simples_dia1_m1___2)="Tipo de analgésicos (choice=Analgésicos simples)"
label(data$simples_compri_dia1_m1)="Número de comprimidos"
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label(data$opioides_compri_dia1_m1)="Número de comprimidos"
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label(data$ergo_compri_dia1_m1)="Número de comprimidos"
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label(data$benzo_compri_dia1_m1)="Número de comprimidos"
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label(data$combin_compri_dia1_m1)="Número de comprimidos"
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label(data$aines_compri_dia22_m12)="Número de comprimidos"
label(data$triptanes_dia22_m12___1)="Tipo de analgésicos (choice=Triptanes)"
label(data$triptanes_compri_dia22_m12)="Número de comprimidos"
label(data$simples_dia22_m12___2)="Tipo de analgésicos (choice=Analgésicos simples)"
label(data$simples_compri_dia22_m12)="Número de comprimidos"
label(data$opioides_dia22_m12___3)="Tipo de analgésicos (choice=Opioides)"
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label(data$ergo_dia22_m12___4)="Tipo de analgésicos (choice=Ergotamínicos)"
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label(data$benzo_dia22_m12___5)="Tipo de analgésicos (choice=Benzodiacepinas)"
label(data$benzo_compri_dia22_m12)="Número de comprimidos"
label(data$combin_dia22_m12___6)="Tipo de analgésicos (choice=Combinados)"
label(data$combin_compri_dia22_m12)="Número de comprimidos"
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label(data$simples_dia23_m12___2)="Tipo de analgésicos (choice=Analgésicos simples)"
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label(data$opioides_dia23_m12___3)="Tipo de analgésicos (choice=Opioides)"
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label(data$ergo_dia23_m12___4)="Tipo de analgésicos (choice=Ergotamínicos)"
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label(data$diciembre_complete)="Complete?"
#Setting Units


#Setting Factors(will create new variable for factors)
data$redcap_event_name.factor = factor(data$redcap_event_name,levels=c("basal_arm_1","followup_arm_1"))
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data$efectos_adversos_tipo_anti___6.factor = factor(data$efectos_adversos_tipo_anti___6,levels=c("0","1"))
data$efectos_adversos_tipo_anti___7.factor = factor(data$efectos_adversos_tipo_anti___7,levels=c("0","1"))
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data$flunarizina___1.factor = factor(data$flunarizina___1,levels=c("0","1"))
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data$candesartan___1.factor = factor(data$candesartan___1,levels=c("0","1"))
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data$valproato___1.factor = factor(data$valproato___1,levels=c("0","1"))
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data$lamotrigina___1.factor = factor(data$lamotrigina___1,levels=c("0","1"))
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data$botox___1.factor = factor(data$botox___1,levels=c("0","1"))
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data$galcanezumab___1.factor = factor(data$galcanezumab___1,levels=c("0","1"))
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data$opioides_dia16_m1___3.factor = factor(data$opioides_dia16_m1___3,levels=c("0","1"))
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