R/data-deadlianas2.r

In biometrics: A Package for Biometrics and Modelling

#' Datos de mortalidad de lianas en árboles tropicales
#'
#' @description
#' Los datos provienen de un estudio que fue parte del proyecto "Diversidad y
#' dinámica de epífitas vasculares en los Andes colombianos".
#' apoyado por COLCIENCIAS (contrato 2115-2013). Este conjunto de datos tiene
#'  43 columnas
#'  y 4247 filas. Cada fila corresponde a un individuo epifito ubicado en
#'  secciones confiables de los árboles hospedantes
#' Los datos corresponden a la primera gran escala
#' evaluación de la mortalidad de epífitas vasculares en los neotrópicos.
#' Basado en dos encuestas anuales consecutivas,
#' Seguimos el destino de 4247 epífitas para estimar la tasa de mortalidad
#' de epífitas en 116 árboles hospedantes.
#' en nueve sitios. Se tomaron variables adicionales del area de estudio
#'  para encontrar relaciones
#' con mortalidad de epifitas.
#' @usage
#' data(deadlianas2)
#' @format Variables se describen a continuación::
#' \describe{
#' \item{PlotSite}{Nombre del municipio de los 9 sitios de estudio.}
#' \item{Y.Plot}{Latitud del grafico en grados decimales.}
#' \item{X.Plot}{Longitud de la grafica en grados decimales.}
#' \item{PhoroNo}{número de identificacion de los árboles hospedantes
#' muestreados en cada sitio}
#' \item{EpiFam}{Familia taxonomica de epifitas.}
#' \item{EpiGen}{Genero taxonomico de epifitas.}
#' \item{cf.aff}{Abreviaturas de terminos latinos en el contexto de la
#' taxonomia. cf. "conferir" que significa "comparar con". aff .: "affinis"
#' que significa "similar a".}
#' \item{Species}{Nombre de la especie epifita (morfo)}
#' \item{Author}{Autor del nombre científico.}
#' \item{EpiAzi}{Azimut del individuo epifito en cada árbol huesped.}
#' \item{BraAzi}{Azimut de la rama en la que se encontro el individuo epifito.}
#' \item{EpiDisTru}{Distancia en metros desde el tronco hasta el sitio de union
#'  de la epifita en una rama.}
#' \item{EpiSize}{Tamaño estimado del individuo epifito en centimetros.}
#' \item{EpiAttHei}{Altura del accesorio de la epifita en metros.}
#' \item{Date0}{Fecha del primer censo.}
#' \item{Date1}{Fecha del censo final.}
#' \item{Location}{Seccion (raices, troncos, ramas) del árbol anfitrion en el
#'  que se encontro el individuo epifito.}
#' \item{Mortality}{Variable dicotomica. 0 si el individuo epifito estaba
#' muerto en el censo final y 1 si no.}
#' \item{MorCat}{Causa de mortalidad mecanica o no mecánica.}
#' \item{Elevation}{Elevacion (msnm) de la parcela.}
#' \item{AP_bio12}{Precipitación anual en la parcela, en mm.}
#' \item{PDM_bio14}{Precipitación del mes más seco en la parcela, en mm.}
#' \item{PS_bio15}{Estacionalidad de la precipitacion en la parcela
#'  (coeficiente de variacion)}
#' \item{MDT_bio2}{Rango diurno medio (Media mensual
#' (temperatura maxima - temperatura minima)) en la grafica (10°C)}
#' \item{TS_bio4}{Estacionalidad de la temperatura en la grafica
#' (desviacion estandar * 100)}
#' \item{ATR_bio7}{Rango de temperatura anual en la parcela
#' (10 grados centigrados)}
#' \item{AET}{Evapotranspiración anual en la parcela, en mm.}
#' \item{BasAre}{Area basal de árboles con DAP mayor o igual a 5 cm en
#' la parcela, en m\eqn{^{2}}{^2}/ha.}
#' \item{BasAre5_10}{Area basal de árboles con DAP mayor o igual a 5 y
#' menor a 10 cm en la parcela (m\eqn{^{2}}{^2}/ha)}
#' \item{BasAre10}{Area basal de árboles con DAP mayor o igual a 10 cm en
#'  la parcela (m\eqn{^{2}}{^2}/ha)}
#' \item{Ind10}{Número de árboles del dosel (con un DAP superior o
#' igual a 10 cm) en la parcela}
#' \item{Ind5}{Número de árboles de sotobosque (con DAP mayor o igual
#' a 5 y menor a 10 cm) en la parcela}
#' \item{Ind5_10}{Número de árboles con un DAP mayor o igual a 5 y menos
#' de 10 cm en la parcela}
#' \item{Ind10_15}{Número de árboles con un DAP mayor o igual a 10 y menos
#'  de 15 cm en la parcela}
#' \item{Ind15_20}{Número de árboles con un DAP mayor o igual a 15 y menos
#' de 20 cm en la parcela}
#' \item{Ind20_25}{Número de árboles con un DAP mayor o igual a 20 y menos
#' de 25 cm en la parcela}
#' \item{Ind25_30}{Número de árboles con un DAP mayor o igual a 25 y menos
#' de 30 cm en la parcela}
#' \item{Ind30}{Número de árboles con DAP mayor o igual a 30 cm en la parcela}
#' \item{TreeHei}{Altura total del árbol en metros}
#' \item{MedHei}{Altura media de los árboles en cada parcela}
#' \item{MaxHei}{Altura maxima de los árboles en cada parcela}
#' \item{BranchNumb}{Número de ramas del árbol anfitrion}
#' \item{Obs}{Observaciones y notas en español}
#'  }
#' @source
#' Los datos fueron obtenidos desde el repositorio
#' DRYAD \doi{10.5061/dryad.g5510}.
#' @references
#' Zuleta D, Benavides AM, Lopez-Rios V, Duque A. 2016. Local and
#' regional determinants
#' of vascular epiphyte mortality in the Andean mountains of Colombia.
#' Journal of Ecology 104(3): 841-843. \doi{10.1111/1365-2745.12563}
#' @examples
#' data(deadlianas2)
#' head(deadlianas2)
'deadlianas2'