lle: Locally linear embedding

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LLE is a non-linear algorithm for mapping high-dimensional data into a lower dimensional (intrinsic) space. This package provides the main functions to performs the LLE alogrithm including some enhancements like subset selection, calculation of the intrinsic dimension etc.

Author
Holger Diedrich, Dr. Markus Abel (Department of Physics, University Potsdam)
Date of publication
2012-03-21 12:52:58
Maintainer
Holger Diedrich <holgerdiedrich@gmx.net>
License
GPL-3
Version
1.1

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Man pages

calc_k
Calculation of the optimal number of neighbours.
find_coords
Calculate embedded data.
find_nn_eps
Find nearest neighbours in epsilon environment.
find_nn_k
Find k nearest neighbours.
find_weights
Calculate weight matrix.
lle
Locally linear embedding main function.
lle_rectangular
Example on a rectangular signal.
lle_scurve
Example application on a three-dimensional S-curve dataset.
lle_scurve_data
S-curve data
lle_sound
Example application on a soundfile.
lle_spiral
Example application on a n-dimensional spiral
lle_swissrole
Example application on a swissrole.
lle_wave
wavefile
plot_lle
Plot LLE results

Files in this package

lle
lle/MD5
lle/data
lle/data/lle_scurve_data.rda
lle/data/lle_wave.rda
lle/DESCRIPTION
lle/man
lle/man/lle_rectangular.Rd
lle/man/lle.Rd
lle/man/lle_swissrole.Rd
lle/man/find_nn_eps.Rd
lle/man/lle_scurve.Rd
lle/man/find_weights.Rd
lle/man/lle_spiral.Rd
lle/man/calc_k.Rd
lle/man/lle_wave.Rd
lle/man/plot_lle.Rd
lle/man/find_nn_k.Rd
lle/man/figures
lle/man/figures/rect.png
lle/man/lle_scurve_data.Rd
lle/man/find_coords.Rd
lle/man/lle_sound.Rd
lle/R
lle/R/lle_rectangular.R
lle/R/find_nn_k.R
lle/R/lle_spiral.R
lle/R/calc_k.R
lle/R/find_nn_eps.R
lle/R/lle.R
lle/R/plot_lle.R
lle/R/lle_swissrole.R
lle/R/find_weights.R
lle/R/find_coords.R
lle/R/lle_sound.R
lle/R/lle_scurve.R
lle/NAMESPACE
lle/demo
lle/demo/00Index
lle/demo/lle.R