struct_RxAnalyse: Structure RxAnalyse

Description Usage Arguments Value

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Description

Structure le dataset d'analyse pour l'étude de la polymédication.

Usage

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struct_RxAnalyse(
  data_Rx,
  data_Cohorte,
  data_Hospit = NULL,
  IDs = list(type = "ech", value = 0.1),
  ParamsAnalyse = list(dataDurees = DureesSpecifiques, facteur = 0.5, fixe = 0),
  HospitAjust = list(nbrJours_avant = 0, nbrJours_apres = 0),
  max_reserve = NULL
)

Arguments

data_Rx

list()

  • data : Dataset des services.

  • ID : Nom de la colonne contenant le numéro du ID.

  • Rx : Nom de la colonne indiquant le code d'analyse/médicament/molécule.

  • DateServ : Nom de la colonne indiquant la date de service.

  • Duree : Nom de la colonne indiquant la durée du service.

data_Cohorte

list()

  • data : Dataset de la cohorte d'analyse.

  • ID : Nom de la colonne contenant le numéro du ID.

  • sexe : Nom de la colonne indiquant le sexe de l'individu.

  • age : Nom de la colonne indiquant l'âge de l'individu. Peut-être NULL si on utilise plutôt la colonne indiquant la date de naissance.

  • naiss : Nom de la colonne indiquant la date de naissance de l'individu. Peut-être NULL si on utilise plutôt la colonne indiquant l'âge.

  • origin : "AAAA-MM-JJ". Date de référence pour le calcul de l'âge à partir de la colonne naiss. Peut-être NULL si on utilise plutôt la colonne indiquant l'âge.

data_Hospit

list()

  • data : Dataset des services hospitaliers, les hospitalisations.

  • ID : Nom de la colonne contenant le numéro du ID.

  • adm : Nom de la colonne indiquant la date d'admission à l'hôpital.

  • dep : Nom de la colonne indiquant la date de départ de l'hôpital.

  • ajust : Nombre de jours sans activité permis entre deux hospitalisations dans le but de les fusionner.

IDs

list() sinon NULL.

  • type : "ech" pour extraire aléatoirement des ID, "select"pour sélectionner des ID.

  • value : Si type=="ech", nombre entre 0 et 1 indiquant le ratio (pourcentage) de ID à extraire tiré de data_Cohorte. Si type=="select", liste des ID à extraire.

ParamsAnalyse

list()

  • dataDurees : Dataset indiquant pour un code Rx une durée fixe.

  • facteur : Calcul de la période de grâce = Durée x facteur.

  • fixe : Nombre. Calcul de la période de grâce = Période de grâce + fixe.

HospitAjust

list()

  • nbrJours_avant : Nombre de jours sans activité permis entre un Rx et une Hospit pour qu'on fusionne les deux observations.

  • nbrJours_apres : Nombre de jours sans activité permis entre une Hospit et un Rx pour qu'on fusionne les deux observations.

max_reserve

Entier, nombre de jours qu'un individu peut accumuler des médicaments pour s'en faire une réserve. NULL implique une réserve sans limite.

Value

list()


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