krw_mafy_ekr_ss: KRW-toetsing macrofyten soortensamenstelling

Description Usage Arguments Details Value Note Examples

View source: R/krw_mafy_toetsing.R

Description

Deze functie voert de KRW-toetsing uit voor de macrofyten-soortensamenstelling voor een of meerdere monsters. De toetsing is gebaseerd op de maatlatten uit het jaar 2018.

Usage

1
2
3
4
5
6
7
krw_mafy_ekr_ss(
  df,
  krwwatertype.code,
  biotaxon.naam,
  abundantieklasse,
  verbose = FALSE
)

Arguments

df

Een dataframe met macrofyten. Als het dataframe meerdere monsters bevat moet dit dataframe een grouped dataframe worden met de functie dplyr::group_by()

krwwatertype.code

Naam van de kolom met de KRW-watertype code

biotaxon.naam

Naam van de kolom met de taxonnamen.

abundantieklasse

Naam van de kolom met de abundantieklassen van het betreffende taxon. De abundantieklasse dient de waarde 1, 2, of 3 te bevatten. De functie AANVULLEN kan worden gebruikt om om te rekenen naar abundantieklassen.

verbose

Logical. Als TRUE dan worden behalve de EKR ook de onderliggende parameters en constanten in de uitvoer meegenomen. Deze zijn vooral relevant om e.e.a. te kunnen controleren.

Details

De kolomnamen van de kolommen met taxon, watertype en waarde kunnen zowel met als zonder quotes ("") worden ingevoerd door het gebruik van non-standard-evaluation (NSE).

Value

Een dataframe met groepkolommen (alleen indien van toepassing), het watertype en:

Note

Het is van belang dat de biotaxonnamen in de TWN-lijst voorkomen. De KRW-watertypecode dient overeen te komen met de codes uit de codes uit de aquo-standaard.

Examples

 1
 2
 3
 4
 5
 6
 7
 8
 9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
## Not run: 

# Een enkel monster

krw_mafy_ekr_ss(df_1_monster, watertype, taxon, abundantie)
krw_mafy_ekr_ss(df_1_monster, "watertype", "taxon", "abundantie")

 
# Meerdere monsters in 1 dataframe

grouped_df <- group_by(df_meerdere_monsters, meetpunt, datum)
krw_mafy_ekr_ss(grouped_df, watertype, taxon, abundantie)  

# of met het pipe-teken (%>%)

df_meerdere_monsters %>% 
  group_by(meetpunt, datum) %>% 
  krw_mafy_ekr_ss(watertype, taxon, abundantie)


## End(Not run)

RedTent/krw documentation built on Nov. 14, 2021, 1:07 p.m.