CAMPtoHL: Exporta datos de formato CAMP a formato DATRAs HL. Depende de...

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Description

Función de Salida de datos a DATRAS: Extrae las características de las capturas por lance para una campaña desde el fichero NTALLxxx.DBF y los transforma en formato DATRAS HL. De momento sólo funciona con peces y en el SPNGFS y SPPORC (Para completar crustáceos y moluscos hay que añadir los AphiaID, y para ARSA añadirlos al especies de ARSA)

Usage

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2
CAMPtoHL(camp, dns, inclSpecie = FALSE, quart = TRUE, incl2 = FALSE,
  export = FALSE)

Arguments

camp

Campaña de la que se extraen los datos: año concreto (XX): Demersales "NXX", Porcupine "PXX", Arsa primavera "1XX" y Arsa otoño "2XX"

dns

Elige el origen de las bases de datos: Porcupine "Porc", Cantábrico "Cant, Golfo de Cádiz "Arsa"

inclSpecie

si T incluye el nombre de la especie y el Código, si no sólo el Aphia

quart

si F deja en cada lance el valor del trimestre en que se realizó el lance, si T se deja el que tiene la campaña por defecto, 1 para Arsa 1Q, 3 para Porcupine y 4 para Arsa 4Q y Demersales Northern Shelf

incl2

Si F deja fuera los lances especiales que actualmente no se transmiten a DATRAS, si T los incluye

export

Si T crea un fichero csv con todos los datos corregidos (APHIAs) en el directorio CAMP donde está el especies.dbf este es importable al especies.dbf con un append from deli with , quitando todos los peces grupo="1"

Value

Devuelve un data.table con datos de cada especie en el formato HL de DATRAS. DATRAS requiere que los datos no tengan cabecera y el trimestre sea el que corresponde a la campaña, además de no tener "". Por ello se debe pasar a fichero con la orden: write.table(CAMPtoHH(Xyy,dns),"nombrearchivo.csv",sep=",",quote=F,col.names=F,row.names=F))

Examples

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# CAMPtoHL("P14","Porc")

fvgls/CampR documentation built on Dec. 7, 2018, 11:06 a.m.