datlan.camp | R Documentation |
Función de acceso a datos: Extrae las características de los lances para una campaña determinada
datlan.camp(
camp,
dns,
incl2 = TRUE,
incl0 = FALSE,
outhidro = FALSE,
excl.sect = NA,
redux = FALSE,
year = TRUE,
quarter = TRUE,
bio = FALSE
)
camp |
Campaña de la que se extraen los datos: año comcreto (XX): Demersales "NXX", Porcupine "PXX", Arsa primavera "1XX" y Arsa otoño "2XX" |
dns |
Elige el origen de las bases de datos: Porcupine "Pnew", Cantábrico "Cant", Golfo de Cádiz "Arsa", combinados con "dnsred" busca los datos en el servidor de Santander si se han creado las odbcs |
incl2 |
Si T se incluyen los lances extra no incluidos para las abundancias o biomasas estratificadas |
incl0 |
Si T se incluyen los lances nulos |
outhidro |
si T saca los datos del fichero hidro al final de todo el proceso como salida |
excl.sect |
Sectores a excluir como carácter, se pueden elegir tanto los sectores como estratos |
redux |
Si T elimina datos de longitud y latitud de virada y muestra la media de las profundidades de largada y virada |
year |
si T incluye una columna con el año al final de los datos |
quarter |
si T incluye una columna con el trimestre de los datos teniendo en cuenta la fecha del lance, puede cambiar a mitad de la campaña, cuidado con campañas IBTS adscritas a un trimestre particular. |
bio |
reduce el data.frame a los datos para los proyectos de biología, con datos en formato decimal y hexadecimal y las zonas ICES |
Un problema que ocurre al utilizar el CampR con ficheros dbf de las primeras campañas puede ser que al fichero lanceXXX.dbf le falte algún campo, habitualmente el campo ESTN utilizado en las últimas versiones del CAMP para ligar lances con las estaciones de CTD. El error usual es $ operator is invalid for atomic vectors Si se detecta este error revisar la estructura de lanceXXX.dbf con la de otros ficheros de lances de los últimos años
Devuelve un data.frame con datos de cada lance, las variables dependen de la selección de hidro y redux. En cualquier caso incluye variables weight.time con el factor de calibración para lances con menos tiempo del estándar y arsect: el área del sector al que corresponde el lance dentro del muestreo
MapLansGPS
print(datlan.camp(Nsh[24:28],"Cant",hidro=FALSE,excl.sect=c("A")))
print(datlan.camp("P16","Porc",bio=T))
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