chronique.degresjours: Calcul d'une durée de degrés-jours

In jbfagotfede39/aquatools: Tools for freshwater managers

Calcul d'une durée de degrés-jours

Description

Cette fonction permet de calcul une date de démarrage et de fin de reproduction à partir de données de degrés-jours

Usage

chronique.degresjours(
  data = data,
  espece = NA_character_,
  valeurdeclenchement = 10,
  typeseuildeclenchement = c("Montant", "Descendant"),
  nbjourssuccessifsdeclenchement = 2,
  datedeclenchementmanuelle = NA_character_,
  valeurdegresjours = 180
)

Arguments

data	Data.frame de données journalières issu de la fonction chronique.agregation
espece	Espèce recherchée (vide par défaut - Si complété, va directement chercher les valeurs de référence dans data(poissons_thermie_reproduction) - Exemple : TRF, BRO)
valeurdeclenchement	Température de déclenchement de la phase de reproduction (pour recherche automatique de la date de déclenchement)
nbjourssuccessifsdeclenchement	Nombre de jours successifs (2 par défaut) devant afficher une température moyenne supérieure ou inférieure (en fonction de typevaleurdeclenchement) à la valeurdeclenchement
datedeclenchementmanuelle	Si l'opérateur souhaite forcer manuellement la date de démarrage du calcul (au format 2020-12-01)
valeurdegresjours	Valeur de degrés-jours de référence
typevaleurdeclenchement	Si Montant (par défault), s'appuie sur une chronique printanière (valeurs croissantes : BRO, OBR, GAR, etc.). Si Descendant, s'appuie sur une chronique automnale (TRF)

Examples

Resultats %>% chronique.degresjours()
Resultats %>% chronique.degresjours(valeurdeclenchement = 10, typeseuildeclenchement = "Montant", nbjourssuccessifsdeclenchement = 2, valeurdegresjours = 180)
Resultats %>% chronique.degresjours(valeurdegresjours = 180, datedeclenchementmanuelle = "2021-03-30")
test <- ValJours %>% filter(chmes_coderhj == "AIN22-2") %>% formatage.annee.biologique() %>% group_by(chmes_coderhj, chmes_anneebiol) %>% group_split() 
listeespecesatraiter <- c("TRF", "OBR", "BRO", "GAR", "TAN", "CCO", "HOT", "BAF")
argList <- list(x = test, y = listeespecesatraiter)
crossArg <- cross_df(argList)
test <- map2_dfr(crossArg$x, crossArg$y, chronique.degresjours)

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