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Fonction (normalement temporaire) pour lire les donnees Coop a partir des fichier xls stocke dans T:R&D
Ce programme est temporaire puisqu a terme, tout le monde aura acces a la BDD. Il est, de plus, sensible au changement de nom de dossier. Donc attention!
1 | load_onf_ch(initiales = NULL, format = "xls")
|
initiales |
: vecteur contenant les initiales du ou des dispositifs que l'on veut charger (par defaut, tous !) |
format |
: plusieurs possibilite de format - "xls" : list de data.frame correspondant exactement au fichier xls de la Coop ou au chargement de la Coop par la fonction load_bdd_to_xls_ch - "R" : format completement different, identique au chargement par la fonction load_bdd_to_R_ch et qui sert pour la suite des calculs |
cl_circ |
data.frame a 2 colonnes : circonference puis effectif |
SurfPla |
surface en m2 |
N |
nombre de tige par ha, 100 par defaut. |
Cette fonction est un deuxieme jet. Les fonctions d'importation depuis Excel dependent de la
method
choisie : Java
pour la fonction readWorksheet
du package XLConnect
le diametre dominant Une liste de data.frame: - pour (format = "xls") : Placette, Mesure, Arbre, Ss_unite_surface, Inventaire_liste, Intervention, Historique_traitement, Numero_arbre identiques aux tables issues de la fonction load_bdd_to_xls_ch - pour (format = "R") : unite, mesure, mesure2, arbre, arbre_echantillon, inventaire_somme, surface_somme identiques aux tables issues de la fonction
Fonction reprise du package interne 'onfR'
Merci de faire remonter les critiques et ameliorations de la fonction
Quentin Girard
Protocole Coop chene...
dico.ch, load_bdd_to_R_ch, load_bdd_to_xls_ch, load_bdd_to_R_ch
Other coopR: accroissement_peuplement_ch
,
bd_2_xls_ch
, calc_D0
,
calc_Dg
, calc_Gha
,
calc_Ke
, calc_RDI
,
calc_veg
, ci_ht_fonction_ch
,
ci_ht_fonction
,
ci_ht_regression_ch
,
ci_ht_regression
,
graph_accroissement_ch
,
graph_age_ch
, graph_ci_ht_ch
,
graph_evolution_ch
,
graph_mortalite
,
intervention_ch
,
liste_dispo_ch
,
load_bdd_to_R_ch
,
load_bdd_to_xls_ch
,
load_xls_to_R_ch
,
peuplement_ch
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 | ## Utilisons l'exemple avec le format = "R"
require(XLConnect)
require(doBy)
require(plyr)
ex <- load_onf_ch(initiales = c("MBM", "TR", "MR"), format = "R")
str(ex)
## graphe de verification de mesure2
g <- ggplot(ex$mesure2) +
aes(x = no_mesure, y = id_unite, col = suivi) +
geom_line() +
geom_point(aes(shape = as.factor(av_ap_id))) + scale_shape_manual(values = c("0" = 1, "1" = 3, "2" = 4)) +
theme_bw()
print(g)
|
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